同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00014

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 8

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00014

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00014 Chr01 62611593-64383750 Chr01 108566417-111353341 mixed High 8 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00014`	Chr01:62611593-64383750	Chr01:108566417-111353341	mixed	8	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 8 · 当前范围 1–8 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA01G251180 → LXL04_003849

89.0%

TkA01G252270 → LXL04_003838

97.9%

TkA01G252280 → LXL04_003863

99.6%

TkA01G253100 → LXL04_003842

99.3%

TkA01G253290 → LXL04_003843

84.6%

TkA01G254100 → LXL04_003849

91.2%

TkA01G254460 → LXL04_003852

57.1%

TkA01G255010 → LXL04_003855

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA01G251180`	`LXL04_003849`	`JCVI_TKOH_00014`	89.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA01G252270`	`LXL04_003838`	`JCVI_TKOH_00014`	97.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G252280`	`LXL04_003863`	`JCVI_TKOH_00014`	99.6	100.0 / 100.0	Strict
`TkA01G253100`	`LXL04_003842`	`JCVI_TKOH_00014`	99.3	95.745 / 90.0	Strict
`TkA01G253290`	`LXL04_003843`	`JCVI_TKOH_00014`	84.6	100.0 / 46.208	Complex
`TkA01G254100`	`LXL04_003849`	`JCVI_TKOH_00014`	91.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA01G254460`	`LXL04_003852`	`JCVI_TKOH_00014`	57.1	100.0 / 85.38	Complex
`TkA01G255010`	`LXL04_003855`	`JCVI_TKOH_00014`	100.0	100.0 / 80.251	Complex