同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00231

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 634

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00231

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00231 Chr05 23840-24371060 Chr04 18932311-41076231 mixed High 34 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00231`	Chr05:23840-24371060	Chr04:18932311-41076231	mixed	634	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 634 · 当前范围 601–634 · 页码 4/4

上一页下载全部锚点 TSV

TkA05G082330 → LXL04_019743

99.3%

TkA05G082340 → LXL04_019744

99.1%

TkA05G082420 → LXL04_019746

99.0%

TkA05G082980 → LXL04_019750

100.0%

TkA05G083240 → LXL04_019751

99.1%

TkA05G083260 → LXL04_019752

95.9%

TkA05G083270 → LXL04_019753

100.0%

TkA05G083280 → LXL04_019754

99.5%

TkA05G083290 → LXL04_019755

99.8%

TkA05G083430 → LXL04_019758

98.1%

TkA05G083470 → LXL04_019758

79.5%

TkA05G083610 → LXL04_019761

98.9%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA05G082330`	`LXL04_019743`	`JCVI_TKOH_00231`	99.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G082340`	`LXL04_019744`	`JCVI_TKOH_00231`	99.1	92.521 / 79.147	Probable
`TkA05G082420`	`LXL04_019746`	`JCVI_TKOH_00231`	99.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G082980`	`LXL04_019750`	`JCVI_TKOH_00231`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G083240`	`LXL04_019751`	`JCVI_TKOH_00231`	99.1	99.074 / 84.861	Strict
`TkA05G083260`	`LXL04_019752`	`JCVI_TKOH_00231`	95.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G083270`	`LXL04_019753`	`JCVI_TKOH_00231`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G083280`	`LXL04_019754`	`JCVI_TKOH_00231`	99.5	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G083290`	`LXL04_019755`	`JCVI_TKOH_00231`	99.8	98.815 / 98.815	Complex
`TkA05G083430`	`LXL04_019758`	`JCVI_TKOH_00231`	98.1	100.0 / 97.59	Complex
`TkA05G083470`	`LXL04_019758`	`JCVI_TKOH_00231`	79.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G083610`	`LXL04_019761`	`JCVI_TKOH_00231`	98.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G084410`	`LXL04_019764`	`JCVI_TKOH_00231`	94.3	100.0 / 100.0	Probable
`TkA05G084780`	`LXL04_019765`	`JCVI_TKOH_00231`	99.6	85.437 / 79.042	Complex
`TkA05G085810`	`LXL04_019772`	`JCVI_TKOH_00231`	74.2	100.0 / 100.0	待复核
`TkA05G086030`	`LXL04_019777`	`JCVI_TKOH_00231`	77.2	50.893 / 13.648	Complex
`TkA05G086320`	`LXL04_019777`	`JCVI_TKOH_00231`	97.7	38.053 / 11.286	Complex
`TkA05G086800`	`LXL04_019780`	`JCVI_TKOH_00231`	99.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G087000`	`LXL04_019782`	`JCVI_TKOH_00231`	91.6	97.449 / 58.589	Complex
`TkA05G087010`	`LXL04_019782`	`JCVI_TKOH_00231`	98.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G087240`	`LXL04_019783`	`JCVI_TKOH_00231`	99.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA05G088570`	`LXL04_019804`	`JCVI_TKOH_00231`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G088670`	`LXL04_019805`	`JCVI_TKOH_00231`	98.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G088680`	`LXL04_019806`	`JCVI_TKOH_00231`	98.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G088720`	`LXL04_019807`	`JCVI_TKOH_00231`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G088840`	`LXL04_019809`	`JCVI_TKOH_00231`	99.2	49.801 / 100.0	待复核
`TkA05G088870`	`LXL04_019811`	`JCVI_TKOH_00231`	97.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G089010`	`LXL04_019813`	`JCVI_TKOH_00231`	98.3	99.309 / 28.909	待复核
`TkA05G089090`	`LXL04_019814`	`JCVI_TKOH_00231`	98.0	99.509 / 81.092	Strict
`TkA05G089340`	`LXL04_019815`	`JCVI_TKOH_00231`	92.1	100.0 / 100.0	Probable
`TkA05G089380`	`LXL04_019816`	`JCVI_TKOH_00231`	98.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G089610`	`LXL04_019818`	`JCVI_TKOH_00231`	98.3	100.0 / 100.0	Strict
`TkA05G090200`	`LXL04_019822`	`JCVI_TKOH_00231`	100.0	100.0 / 96.784	Complex
`TkA05G090210`	`LXL04_019823`	`JCVI_TKOH_00231`	99.2	95.926 / 71.944	Complex