同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00422

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00422

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00422 ChrUn 7490918-8094030 Chr09 33714603-34655354 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00422`	ChrUn:7490918-8094030	Chr09:33714603-34655354	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG027900 → LXL04_038219

99.5%

TkAUNG027910 → LXL04_038220

98.4%

TkAUNG027960 → LXL04_038221

100.0%

TkAUNG028010 → LXL04_038222

99.1%

TkAUNG028020 → LXL04_038220

98.5%

TkAUNG028080 → LXL04_038221

91.4%

TkAUNG028130 → LXL04_038222

99.8%

TkAUNG028140 → LXL04_038222

99.6%

TkAUNG028260 → LXL04_038223

100.0%

TkAUNG028860 → LXL04_038201

88.6%

TkAUNG028910 → LXL04_038202

47.9%

TkAUNG029010 → LXL04_038200

96.2%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG027900`	`LXL04_038219`	`JCVI_TKOH_00422`	99.5	99.055 / 76.614	Complex
`TkAUNG027910`	`LXL04_038220`	`JCVI_TKOH_00422`	98.4	89.512 / 100.0	Complex
`TkAUNG027960`	`LXL04_038221`	`JCVI_TKOH_00422`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG028010`	`LXL04_038222`	`JCVI_TKOH_00422`	99.1	98.148 / 34.603	待复核
`TkAUNG028020`	`LXL04_038220`	`JCVI_TKOH_00422`	98.5	81.513 / 52.861	Complex
`TkAUNG028080`	`LXL04_038221`	`JCVI_TKOH_00422`	91.4	90.947 / 83.396	Complex
`TkAUNG028130`	`LXL04_038222`	`JCVI_TKOH_00422`	99.8	94.658 / 48.205	待复核
`TkAUNG028140`	`LXL04_038222`	`JCVI_TKOH_00422`	99.6	100.0 / 50.598	待复核
`TkAUNG028260`	`LXL04_038223`	`JCVI_TKOH_00422`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkAUNG028860`	`LXL04_038201`	`JCVI_TKOH_00422`	88.6	30.792 / 93.75	待复核
`TkAUNG028910`	`LXL04_038202`	`JCVI_TKOH_00422`	47.9	96.396 / 95.059	Complex
`TkAUNG029010`	`LXL04_038200`	`JCVI_TKOH_00422`	96.2	99.774 / 99.773	Probable
`TkAUNG029020`	`LXL04_038198`	`JCVI_TKOH_00422`	99.5	100.0 / 100.0	Probable
`TkAUNG029130`	`LXL04_038196`	`JCVI_TKOH_00422`	87.9	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG029170`	`LXL04_038192`	`JCVI_TKOH_00422`	95.0	98.736 / 99.887	Probable
`TkAUNG029230`	`LXL04_038191`	`JCVI_TKOH_00422`	90.1	81.982 / 85.047	Complex
`TkAUNG029320`	`LXL04_038189`	`JCVI_TKOH_00422`	98.8	87.634 / 79.319	Complex
`TkAUNG030110`	`LXL04_038187`	`JCVI_TKOH_00422`	79.1	37.719 / 22.632	待复核