同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00405

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 14

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00405

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00405 ChrUn 5282588-5463100 Chr05 115397346-115539161 - High 14 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00405`	ChrUn:5282588-5463100	Chr05:115397346-115539161	-	14	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 14 · 当前范围 1–14 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkAUNG019740 → LXL04_025695

99.8%

TkAUNG019900 → LXL04_025693

100.0%

TkAUNG020010 → LXL04_025692

99.3%

TkAUNG020100 → LXL04_025702

100.0%

TkAUNG020120 → LXL04_025702

100.0%

TkAUNG020170 → LXL04_025700

93.6%

TkAUNG020180 → LXL04_025698

99.6%

TkAUNG020190 → LXL04_025697

100.0%

TkAUNG020200 → LXL04_025696

99.5%

TkAUNG020260 → LXL04_025695

100.0%

TkAUNG020270 → LXL04_025698

100.0%

TkAUNG020280 → LXL04_025697

99.5%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkAUNG019740`	`LXL04_025695`	`JCVI_TKOH_00405`	99.8	94.989 / 57.359	待复核
`TkAUNG019900`	`LXL04_025693`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkAUNG020010`	`LXL04_025692`	`JCVI_TKOH_00405`	99.3	100.0 / 100.0	Probable
`TkAUNG020100`	`LXL04_025702`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	65.865 / 64.623	待复核
`TkAUNG020120`	`LXL04_025702`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	53.493 / 38.522	Complex
`TkAUNG020170`	`LXL04_025700`	`JCVI_TKOH_00405`	93.6	100.0 / 95.408	Probable
`TkAUNG020180`	`LXL04_025698`	`JCVI_TKOH_00405`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG020190`	`LXL04_025697`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG020200`	`LXL04_025696`	`JCVI_TKOH_00405`	99.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG020260`	`LXL04_025695`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	100.0 / 39.202	待复核
`TkAUNG020270`	`LXL04_025698`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkAUNG020280`	`LXL04_025697`	`JCVI_TKOH_00405`	99.5	100.0 / 100.0	待复核
`TkAUNG020290`	`LXL04_025696`	`JCVI_TKOH_00405`	100.0	100.0 / 56.41	待复核
`TkAUNG020350`	`LXL04_025695`	`JCVI_TKOH_00405`	99.9	96.676 / 100.0	待复核