同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00342

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00342

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00342 Chr08 193552-931138 Chr06 77122-517736 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00342`	Chr08:193552-931138	Chr06:77122-517736	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA08G000790 → LXL04_026615

87.4%

TkA08G000810 → LXL04_026616

90.7%

TkA08G000840 → LXL04_026618

92.9%

TkA08G001290 → LXL04_026624

95.5%

TkA08G001330 → LXL04_026625

100.0%

TkA08G001440 → LXL04_026626

92.0%

TkA08G001790 → LXL04_026615

99.8%

TkA08G001800 → LXL04_026616

83.6%

TkA08G001830 → LXL04_026618

92.9%

TkA08G001950 → LXL04_026620

98.4%

TkA08G002190 → LXL04_026624

93.7%

TkA08G002220 → LXL04_026625

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA08G000790`	`LXL04_026615`	`JCVI_TKOH_00342`	87.4	97.376 / 61.812	Complex
`TkA08G000810`	`LXL04_026616`	`JCVI_TKOH_00342`	90.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G000840`	`LXL04_026618`	`JCVI_TKOH_00342`	92.9	99.091 / 98.045	Complex
`TkA08G001290`	`LXL04_026624`	`JCVI_TKOH_00342`	95.5	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G001330`	`LXL04_026625`	`JCVI_TKOH_00342`	100.0	99.367 / 25.993	待复核
`TkA08G001440`	`LXL04_026626`	`JCVI_TKOH_00342`	92.0	99.107 / 21.58	Complex
`TkA08G001790`	`LXL04_026615`	`JCVI_TKOH_00342`	99.8	98.282 / 83.333	Complex
`TkA08G001800`	`LXL04_026616`	`JCVI_TKOH_00342`	83.6	93.714 / 58.383	Complex
`TkA08G001830`	`LXL04_026618`	`JCVI_TKOH_00342`	92.9	60.967 / 98.324	Complex
`TkA08G001950`	`LXL04_026620`	`JCVI_TKOH_00342`	98.4	100.0 / 83.673	待复核
`TkA08G002190`	`LXL04_026624`	`JCVI_TKOH_00342`	93.7	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G002220`	`LXL04_026625`	`JCVI_TKOH_00342`	100.0	100.0 / 100.0	Probable
`TkA08G002400`	`LXL04_026626`	`JCVI_TKOH_00342`	99.8	100.0 / 100.0	Probable
`TkA08G003550`	`LXL04_026634`	`JCVI_TKOH_00342`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G003570`	`LXL04_026630`	`JCVI_TKOH_00342`	78.8	52.091 / 88.462	待复核
`TkA08G003580`	`LXL04_026632`	`JCVI_TKOH_00342`	99.8	100.0 / 100.0	Probable
`TkA08G003600`	`LXL04_026629`	`JCVI_TKOH_00342`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA08G003610`	`LXL04_026628`	`JCVI_TKOH_00342`	93.4	100.0 / 100.0	Complex