同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00279

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 17

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00279

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00279 Chr06 76050399-79684107 Chr05 44202606-47550712 mixed High 17 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00279`	Chr06:76050399-79684107	Chr05:44202606-47550712	mixed	17	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 17 · 当前范围 1–17 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G302140 → LXL04_023480

99.7%

TkA06G304140 → LXL04_023487

93.2%

TkA06G306120 → LXL04_023490

97.8%

TkA06G308890 → LXL04_023516

90.9%

TkA06G309070 → LXL04_023519

77.8%

TkA06G309080 → LXL04_023516

100.0%

TkA06G309350 → LXL04_023515

83.1%

TkA06G312000 → LXL04_023513

99.9%

TkA06G312400 → LXL04_023511

99.3%

TkA06G313170 → LXL04_023507

86.3%

TkA06G313390 → LXL04_023506

54.5%

TkA06G314780 → LXL04_023504

100.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G302140`	`LXL04_023480`	`JCVI_TKOH_00279`	99.7	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G304140`	`LXL04_023487`	`JCVI_TKOH_00279`	93.2	97.357 / 78.523	Probable
`TkA06G306120`	`LXL04_023490`	`JCVI_TKOH_00279`	97.8	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G308890`	`LXL04_023516`	`JCVI_TKOH_00279`	90.9	32.353 / 21.29	Complex
`TkA06G309070`	`LXL04_023519`	`JCVI_TKOH_00279`	77.8	32.762 / 22.917	Complex
`TkA06G309080`	`LXL04_023516`	`JCVI_TKOH_00279`	100.0	100.0 / 91.613	待复核
`TkA06G309350`	`LXL04_023515`	`JCVI_TKOH_00279`	83.1	100.0 / 42.034	待复核
`TkA06G312000`	`LXL04_023513`	`JCVI_TKOH_00279`	99.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G312400`	`LXL04_023511`	`JCVI_TKOH_00279`	99.3	100.0 / 28.903	待复核
`TkA06G313170`	`LXL04_023507`	`JCVI_TKOH_00279`	86.3	96.923 / 100.0	Complex
`TkA06G313390`	`LXL04_023506`	`JCVI_TKOH_00279`	54.5	92.562 / 57.724	待复核
`TkA06G314780`	`LXL04_023504`	`JCVI_TKOH_00279`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G316920`	`LXL04_023521`	`JCVI_TKOH_00279`	100.0	57.937 / 60.331	Complex
`TkA06G317140`	`LXL04_023520`	`JCVI_TKOH_00279`	100.0	100.0 / 95.973	Strict
`TkA06G317560`	`LXL04_023519`	`JCVI_TKOH_00279`	100.0	98.795 / 42.708	待复核
`TkA06G317570`	`LXL04_023520`	`JCVI_TKOH_00279`	79.9	76.344 / 46.644	Complex
`TkA06G318210`	`LXL04_023504`	`JCVI_TKOH_00279`	99.7	100.0 / 100.0	Complex