同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00263

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 15

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00263

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00263 Chr06 3633003-3910446 Chr05 124996933-125226924 + High 15 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00263`	Chr06:3633003-3910446	Chr05:124996933-125226924	+	15	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 15 · 当前范围 1–15 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA06G013750 → LXL04_026346

98.3%

TkA06G013760 → LXL04_026347

98.7%

TkA06G013770 → LXL04_026348

93.6%

TkA06G014050 → LXL04_026351

75.3%

TkA06G014220 → LXL04_026354

100.0%

TkA06G014300 → LXL04_026358

99.2%

TkA06G014310 → LXL04_026359

64.6%

TkA06G014340 → LXL04_026359

98.0%

TkA06G014350 → LXL04_026359

99.5%

TkA06G014580 → LXL04_026361

100.0%

TkA06G014590 → LXL04_026362

100.0%

TkA06G014610 → LXL04_026363

97.0%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA06G013750`	`LXL04_026346`	`JCVI_TKOH_00263`	98.3	97.468 / 61.93	Complex
`TkA06G013760`	`LXL04_026347`	`JCVI_TKOH_00263`	98.7	96.195 / 99.345	Complex
`TkA06G013770`	`LXL04_026348`	`JCVI_TKOH_00263`	93.6	100.0 / 100.0	Probable
`TkA06G014050`	`LXL04_026351`	`JCVI_TKOH_00263`	75.3	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G014220`	`LXL04_026354`	`JCVI_TKOH_00263`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA06G014300`	`LXL04_026358`	`JCVI_TKOH_00263`	99.2	98.819 / 97.287	Strict
`TkA06G014310`	`LXL04_026359`	`JCVI_TKOH_00263`	64.6	99.422 / 22.535	Complex
`TkA06G014340`	`LXL04_026359`	`JCVI_TKOH_00263`	98.0	99.433 / 41.197	待复核
`TkA06G014350`	`LXL04_026359`	`JCVI_TKOH_00263`	99.5	100.0 / 51.056	待复核
`TkA06G014580`	`LXL04_026361`	`JCVI_TKOH_00263`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G014590`	`LXL04_026362`	`JCVI_TKOH_00263`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G014610`	`LXL04_026363`	`JCVI_TKOH_00263`	97.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA06G014630`	`LXL04_026364`	`JCVI_TKOH_00263`	100.0	100.0 / 100.0	待复核
`TkA06G014640`	`LXL04_026365`	`JCVI_TKOH_00263`	100.0	100.0 / 95.789	Strict
`TkA06G014650`	`LXL04_026366`	`JCVI_TKOH_00263`	99.4	100.0 / 100.0	Strict