同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00210

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 24

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00210

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00210 Chr04 130341179-131417200 Chr09 64130512-64632339 mixed High 24 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00210`	Chr04:130341179-131417200	Chr09:64130512-64632339	mixed	24	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 24 · 当前范围 1–24 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA04G515830 → LXL04_039284

62.8%

TkA04G517330 → LXL04_039283

83.5%

TkA04G517340 → LXL04_039280

80.9%

TkA04G517360 → LXL04_039282

95.5%

TkA04G517380 → LXL04_039280

99.3%

TkA04G517560 → LXL04_039280

91.4%

TkA04G517780 → LXL04_039273

98.4%

TkA04G517910 → LXL04_039284

79.9%

TkA04G517930 → LXL04_039287

65.1%

TkA04G517950 → LXL04_039287

49.0%

TkA04G518040 → LXL04_039287

83.9%

TkA04G518060 → LXL04_039287

61.6%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA04G515830`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	62.8	89.937 / 1.55	Complex
`TkA04G517330`	`LXL04_039283`	`JCVI_TKOH_00210`	83.5	67.808 / 34.054	Complex
`TkA04G517340`	`LXL04_039280`	`JCVI_TKOH_00210`	80.9	98.333 / 20.891	Complex
`TkA04G517360`	`LXL04_039282`	`JCVI_TKOH_00210`	95.5	99.714 / 57.166	待复核
`TkA04G517380`	`LXL04_039280`	`JCVI_TKOH_00210`	99.3	99.257 / 82.335	Complex
`TkA04G517560`	`LXL04_039280`	`JCVI_TKOH_00210`	91.4	94.309 / 35.791	Complex
`TkA04G517780`	`LXL04_039273`	`JCVI_TKOH_00210`	98.4	100.0 / 67.266	Complex
`TkA04G517910`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	79.9	37.058 / 2.128	Complex
`TkA04G517930`	`LXL04_039287`	`JCVI_TKOH_00210`	65.1	67.291 / 4.582	Complex
`TkA04G517950`	`LXL04_039287`	`JCVI_TKOH_00210`	49.0	99.918 / 25.115	待复核
`TkA04G518040`	`LXL04_039287`	`JCVI_TKOH_00210`	83.9	95.541 / 11.593	Complex
`TkA04G518060`	`LXL04_039287`	`JCVI_TKOH_00210`	61.6	94.718 / 14.407	Complex
`TkA04G518070`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	81.3	47.291 / 2.053	Complex
`TkA04G518180`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	97.4	45.794 / 2.096	Complex
`TkA04G518230`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	75.5	87.353 / 9.355	Complex
`TkA04G518270`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	90.1	84.283 / 8.286	Complex
`TkA04G518370`	`LXL04_039283`	`JCVI_TKOH_00210`	78.8	65.283 / 34.054	Complex
`TkA04G518400`	`LXL04_039282`	`JCVI_TKOH_00210`	98.9	93.668 / 56.369	待复核
`TkA04G518410`	`LXL04_039280`	`JCVI_TKOH_00210`	99.7	99.656 / 89.094	Complex
`TkA04G518420`	`LXL04_039279`	`JCVI_TKOH_00210`	98.1	100.0 / 68.441	待复核
`TkA04G518480`	`LXL04_039278`	`JCVI_TKOH_00210`	100.0	97.531 / 58.955	待复核
`TkA04G518520`	`LXL04_039284`	`JCVI_TKOH_00210`	46.9	54.927 / 3.635	Complex
`TkA04G518560`	`LXL04_039275`	`JCVI_TKOH_00210`	95.6	81.081 / 32.967	Complex
`TkA04G519460`	`LXL04_039268`	`JCVI_TKOH_00210`	99.9	71.88 / 91.295	Probable