同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

TkA01G624900 LXL04_000258 JCVI_TKOH_00001 基因 ID 对照

证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块

427

ID 对照记录

84884

高置信区块

302

中置信区块

125

参考材料	组装	基因数	gap 数	端粒扫描
TK1151	`TK1151_GWHBCHF00000000`	45224	1917	0/9
OH-1004	`OH1004_GCA_047496595.1`	40057	131	0/711

查询解析

输入 ID

JCVI_TKOH_00085

解析类型

区块 ID

ID 对照 + 共线性联合证据

解析到的基因

无

未能直接匹配到橡胶草基因目录

关联结果

0 / 1 / 18

对照 / 区块 / 锚点

最佳区块: JCVI_TKOH_00085

当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。

基因 ID 对照下载当前结果

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00085 Chr02 57556407-64826088 Chr03 91106426-98697462 mixed High 18 anchors

High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点

锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块	查询位置	目标位置	方向	当前映射锚点数	置信等级	备注
`JCVI_TKOH_00085`	Chr02:57556407-64826088	Chr03:91106426-98697462	mixed	18	高置信	Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 18 · 当前范围 1–18 · 页码 1/1

下载全部锚点 TSV

TkA02G222630 → LXL04_015840

97.1%

TkA02G223120 → LXL04_015847

100.0%

TkA02G223680 → LXL04_015848

96.2%

TkA02G226740 → LXL04_015861

100.0%

TkA02G228730 → LXL04_015865

97.5%

TkA02G231510 → LXL04_015878

98.4%

TkA02G232200 → LXL04_015879

99.6%

TkA02G232460 → LXL04_015881

91.2%

TkA02G234310 → LXL04_015884

97.3%

TkA02G234870 → LXL04_015884

97.9%

TkA02G239030 → LXL04_015888

100.0%

TkA02G240600 → LXL04_015904

98.1%

TK1151 基因	OH-1004 基因	区块	一致性	覆盖度	置信等级
`TkA02G222630`	`LXL04_015840`	`JCVI_TKOH_00085`	97.1	20.178 / 80.952	待复核
`TkA02G223120`	`LXL04_015847`	`JCVI_TKOH_00085`	100.0	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G223680`	`LXL04_015848`	`JCVI_TKOH_00085`	96.2	99.367 / 45.906	待复核
`TkA02G226740`	`LXL04_015861`	`JCVI_TKOH_00085`	100.0	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G228730`	`LXL04_015865`	`JCVI_TKOH_00085`	97.5	96.034 / 100.0	Strict
`TkA02G231510`	`LXL04_015878`	`JCVI_TKOH_00085`	98.4	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G232200`	`LXL04_015879`	`JCVI_TKOH_00085`	99.6	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G232460`	`LXL04_015881`	`JCVI_TKOH_00085`	91.2	100.0 / 62.1	Complex
`TkA02G234310`	`LXL04_015884`	`JCVI_TKOH_00085`	97.3	100.0 / 55.952	待复核
`TkA02G234870`	`LXL04_015884`	`JCVI_TKOH_00085`	97.9	100.0 / 55.952	待复核
`TkA02G239030`	`LXL04_015888`	`JCVI_TKOH_00085`	100.0	94.235 / 69.901	Complex
`TkA02G240600`	`LXL04_015904`	`JCVI_TKOH_00085`	98.1	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G241940`	`LXL04_015905`	`JCVI_TKOH_00085`	98.5	100.0 / 93.885	Strict
`TkA02G243100`	`LXL04_015905`	`JCVI_TKOH_00085`	99.2	75.904 / 22.662	Complex
`TkA02G244960`	`LXL04_015917`	`JCVI_TKOH_00085`	99.2	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G246820`	`LXL04_015920`	`JCVI_TKOH_00085`	92.8	100.0 / 100.0	Complex
`TkA02G252530`	`LXL04_015924`	`JCVI_TKOH_00085`	97.9	100.0 / 100.0	Strict
`TkA02G253260`	`LXL04_015928`	`JCVI_TKOH_00085`	100.0	80.203 / 100.0	Strict