同源/共线性证据

跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。

证据边界:TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料,本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照,不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点,后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。

全局区块概览

共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
参考材料组装基因数gap 数端粒扫描
TK1151 TK1151_GWHBCHF00000000 45224 1917 0/9
OH-1004 OH1004_GCA_047496595.1 40057 131 0/711

查询解析

输入 ID
JCVI_TKOH_00075
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 10
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块: JCVI_TKOH_00075

当前输入已解析为共线性区块 ID,下面优先展示区块范围和锚点基因。

线性共线性图

当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。

JCVI_TKOH_00075 Chr02 157497521-157578099 Chr02 163782334-163868918 + High 10 anchors
Chr02 157497521-157578099 Chr02 163782334-163868918 JCVI_TKOH_00075 · 10 gene pairs TkA02G610490 | LXL04_011397 | 99.7% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA02G610500 | LXL04_011398 | 98.6% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G610510 | LXL04_011399 | 99.3% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA02G610630 | LXL04_011401 | 100.0% | RBH_high_identity_coverage_local_synteny_minor_chr_pair | Probable TkA02G610640 | LXL04_011400 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G610650 | LXL04_011402 | 100.0% | RBH_below_probable_coverage_or_synteny_threshold | Review TkA02G610660 | LXL04_011403 | 99.1% | multi_source_to_OH1004 | Complex TkA02G610690 | LXL04_011403 | 100.0% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review TkA02G610760 | LXL04_011404 | 99.0% | RBH_sequence_supported | Probable TkA02G610800 | LXL04_011407 | 97.3% | sequence_supported_annotation_or_model_conflict | Review
High Medium Other 仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示,TSV 下载包含当前查询的全部锚点;上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。

当前查询证据

当前查询没有可展示的 ID 对照记录。

共线性证据

区块查询位置目标位置方向当前映射锚点数置信等级备注
JCVI_TKOH_00075 Chr02:157497521-157578099 Chr02:163782334-163868918 + 10 高置信 Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline.

区块锚点基因

锚点总数: 10 · 当前范围 1–10 · 页码 1/1

TkA02G610490 → LXL04_011397
99.7%
TkA02G610500 → LXL04_011398
98.6%
TkA02G610510 → LXL04_011399
99.3%
TkA02G610630 → LXL04_011401
100.0%
TkA02G610640 → LXL04_011400
100.0%
TkA02G610650 → LXL04_011402
100.0%
TkA02G610660 → LXL04_011403
99.1%
TkA02G610690 → LXL04_011403
100.0%
TkA02G610760 → LXL04_011404
99.0%
TkA02G610800 → LXL04_011407
97.3%
TK1151 基因OH-1004 基因区块一致性覆盖度置信等级
TkA02G610490LXL04_011397JCVI_TKOH_0007599.799.19 / 99.512Probable
TkA02G610500LXL04_011398JCVI_TKOH_0007598.6100.0 / 59.574待复核
TkA02G610510LXL04_011399JCVI_TKOH_0007599.3100.0 / 100.0Probable
TkA02G610630LXL04_011401JCVI_TKOH_00075100.0100.0 / 100.0Probable
TkA02G610640LXL04_011400JCVI_TKOH_00075100.0100.0 / 49.407待复核
TkA02G610650LXL04_011402JCVI_TKOH_00075100.072.289 / 50.209待复核
TkA02G610660LXL04_011403JCVI_TKOH_0007599.1100.0 / 100.0Complex
TkA02G610690LXL04_011403JCVI_TKOH_00075100.086.29 / 50.235待复核
TkA02G610760LXL04_011404JCVI_TKOH_0007599.098.366 / 70.794Probable
TkA02G610800LXL04_011407JCVI_TKOH_0007597.388.281 / 43.295待复核