同源/共线性证据
跨参考基因组查看同源关系与共线性区块证据。
证据边界：TK1151 和 OH-1004 是同一物种的不同材料，本页展示两个参考基因组之间的同源与共线性 ID 对照，不是同一品种/同一基因组版本升级。区块来自 DIAMOND RBH 与坐标顺序锚点，后续仍可用 MCScanX/JCVI 继续复核。也支持直接输入 JCVI_TKOH_ 开头的区块 ID。
全局区块概览
共线性区块
427
ID 对照记录
84884
高置信区块
302
中置信区块
125
| 参考材料 | 组装 | 基因数 | gap 数 | 端粒扫描 |
|---|---|---|---|---|
| TK1151 | TK1151_GWHBCHF00000000 |
45224 | 1917 | 0/9 |
| OH-1004 | OH1004_GCA_047496595.1 |
40057 | 131 | 0/711 |
查询解析
输入 ID
JCVI_TKOH_00018
解析类型
区块 ID
ID 对照 + 共线性联合证据
解析到的基因
无
未能直接匹配到橡胶草基因目录
关联结果
0 / 1 / 10
对照 / 区块 / 锚点
最佳区块:
JCVI_TKOH_00018当前输入已解析为共线性区块 ID，下面优先展示区块范围和锚点基因。
线性共线性图
当前查询的最佳共线性区块以线性 ribbon 形式展示。
High
Medium
Other
仅绘制前 12 条锚点
锚点表按页展示，TSV 下载包含当前查询的全部锚点；上方 ribbon 仅展示当前区块的部分线性共线性骨架。
当前查询证据
当前查询没有可展示的 ID 对照记录。
共线性证据
| 区块 | 查询位置 | 目标位置 | 方向 | 当前映射锚点数 | 置信等级 | 备注 |
|---|---|---|---|---|---|---|
JCVI_TKOH_00018 |
Chr01:75882868-78715001 | Chr01:89612927-92747929 | mixed | 10 | 高置信 | Formal JCVI synteny block from rebuilt ID map pipeline. |
区块锚点基因
锚点总数: 10 · 当前范围 1–10 · 页码 1/1
| TK1151 基因 | OH-1004 基因 | 区块 | 一致性 | 覆盖度 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
TkA01G305660 | LXL04_003659 | JCVI_TKOH_00018 | 100.0 | 84.434 / 24.622 | Complex |
TkA01G305790 | LXL04_003651 | JCVI_TKOH_00018 | 57.7 | 34.426 / 57.778 | Complex |
TkA01G306250 | LXL04_003657 | JCVI_TKOH_00018 | 100.0 | 100.0 / 96.486 | Strict |
TkA01G307640 | LXL04_003654 | JCVI_TKOH_00018 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | 待复核 |
TkA01G307780 | LXL04_003654 | JCVI_TKOH_00018 | 88.3 | 81.022 / 72.848 | Complex |
TkA01G308400 | LXL04_003653 | JCVI_TKOH_00018 | 100.0 | 96.8 / 34.375 | 待复核 |
TkA01G311400 | LXL04_003638 | JCVI_TKOH_00018 | 100.0 | 100.0 / 100.0 | Strict |
TkA01G311830 | LXL04_003640 | JCVI_TKOH_00018 | 100.0 | 32.5 / 25.828 | Complex |
TkA01G315180 | LXL04_003642 | JCVI_TKOH_00018 | 80.5 | 100.0 / 99.515 | 待复核 |
TkA01G315370 | LXL04_003646 | JCVI_TKOH_00018 | 98.7 | 89.205 / 100.0 | 待复核 |