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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA05G018850
当前版本: TK1151 染色体: Chr05 坐标: 5188207-5191307 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1636 bp · TkA05G018850|TK1151|cDNA

ATTATTTTAAACCAAAAAAAAGAAAAAAAAAACTTTTCTTCACCGTCTCTGATGAAGTACTCCTCAAGAAATCGTTGATATTCTCATTTTCCCGTGTTGCTGCTCAATCCTCCCAATCTTCCGCCACCACTGAGCAACAATGGCAGCAACGATGGTTCTCGACCCTAAACCAGCATCATCTTCCCCACCACCAACCCTCCCCTCACCCTATTCCACCATCGACGCCGTCCTGACGGATTCCGAAGACGATCTCTACACTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1251 bp · TkA05G018850|TK1151|CDS

ATGGCAGCAACGATGGTTCTCGACCCTAAACCAGCATCATCTTCCCCACCACCAACCCTCCCCTCACCCTATTCCACCATCGACGCCGTCCTGACGGATTCCGAAGACGATCTCTACACTCGTCTCAAATCCCTAGAACGCCAAATCGAATTCATCGAAATCCAAGAAGAGTATGTCAAAGATGAGCAGAAAAACCTAAAACGTGAACTGCTGAGGTCGCAAGAGGAGGTAAAACGGATCCAATCGGTGCCGCTCGTGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

416 aa · TkA05G018850|TK1151|PROTEIN

MAATMVLDPKPASSSPPPTLPSPYSTIDAVLTDSEDDLYTRLKSLERQIEFIEIQEEYVKDEQKNLKRELLRSQEEVKRIQSVPLVIGQFMEMIDQNNGIVGSTTGSNYYVRILSTINRELLKPSASVALHRHSNALVDVLPPEADSSISLLSQSEKPDVTYSDIGGCDIQKQEIREAVELPLTHHELYKQIGIDPPRGVLLYGPPGTGKTMLAKAVANHTTAAFIRVVGSEFVQKYLGEGPRMVRDVFRLAKENAPAII...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA05G018850
TK1151 IDTkA05G018850
OH-1004 IDLXL04_000720
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.154 / OH-1004 64.205
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA05G018850
位置Chr05:5188207-5191307 (+)
描述Similar to 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58290 26S 蛋白酶体参与泛素化蛋白的 ATP 依赖性降解。
A mutation in the Proteosomal Regulatory Particle AAA-ATPase-3 in Arabidopsis impairs the light-specific hypocotyl elongation response elicited by a glutamate receptor agonist, BMAA.2009 · DOI: 10.1007/s11103-009-9489-7

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000720 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0000502 proteasome complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0008540 proteasome regulatory particle, base subcomplex 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G58290
han:110873361
rno:117262
sot:102577768
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.554
排名 1 · TkA05G018850 · TK1151
细胞核0.491
排名 2 · TkA05G018850 · TK1151
线粒体0.076
排名 3 · TkA05G018850 · TK1151
细胞膜0.045
排名 4 · TkA05G018850 · TK1151
过氧化物酶体0.036
排名 5 · TkA05G018850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01025GrpE30-96 aa
PF11932DUF345031-94 aa
PF30147SSP135-123 aa
PF13479AAA_2438-70 aa
PF03225Viral_Hsp9039-98 aa
PF14532Sigma54_activ_242-76 aa
PF23130IcmW44-95 aa
PF13173AAA_1447-91 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA05G018850PF01025GrpE30960.08113.3
TkA05G018850PF11932DUF345031940.03214.2
TkA05G018850PF30147SSP1351230.03514.2
TkA05G018850PF13479AAA_2438700.006616.9
TkA05G018850PF03225Viral_Hsp9039980.1111.7
TkA05G018850PF14532Sigma54_activ_242760.2212.5
TkA05G018850PF23130IcmW44950.1512.9
TkA05G018850PF13173AAA_1447910.001619.2
TkA05G018850PF05673DUF81548722.1e-0524.6
TkA05G018850PF06745ATPase49680.1312.3
TkA05G018850PF13086AAA_1153810.07213.6
TkA05G018850PF16450Prot_ATP_ID_OB_C871425.3e-1349.3
TkA05G018850PF13191AAA_16891448.9e-0833.6
TkA05G018850PF00158Sigma54_activat991230.001718.8
TkA05G018850PF20209DUF65701281960.1912.8
TkA05G018850PF05673DUF8151602652.1e-0524.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SEI4拟南芥sp|Q9SEI4|PRS6B_ARATH 26S proteasome regulatory subunit 6B homolog87.400%Swiss-Prot高置信

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