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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G581860
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 147702887-147705739 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1405 bp · TkA03G581860|TK1151|cDNA

TTACATAGATTGAGCGCAAGATTGGGGATATGGAGGCTGAAGCACCGCTGTGTGGTAGGTTGGCTAACATGCACCGCGCCTTCTAAACCAAATTCCAGTAAAACCCCCGAAAATCAAAGTCGAAATTTCACCGGAAAATATCGAGGAACAATGGGAACATCAAATGCTCTCTTCAACCTTCAGCTCAACACAAACAATTGCGTCAATTGTATGAGATCGAGAACAAATCATTCAAATTCTTTGCAGATCAATCAAAATAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1176 bp · TkA03G581860|TK1151|CDS

TTACATAGATTGAGCGCAAGATTGGGGATATGGAGGCTGAAGCACCGCTGTGTGGTAGGTTGGCTAACATGCACCGCGCCTTCTAAACCAAATTCCAGTAAAACCCCCGAAAATCAAAGTCGAAATTTCACCGGAAAATATCGAGGAACAATGGGAACATCAAATGCTCTCTTCAACCTTCAGCTCAACACAAACAATTGCGTCAATTGTATGAGATCGAGAACAAATCATTCAAATTCTTTGCAGATCAATCAAAATAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

391 aa · TkA03G581860|TK1151|PROTEIN

LHRLSARLGIWRLKHRCVVGWLTCTAPSKPNSSKTPENQSRNFTGKYRGTMGTSNALFNLQLNTNNCVNCMRSRTNHSNSLQINQNKTYLSLPNKRQKKVNRGVCFAFDDMRDLELKLGIIRDRPKVVEEIKEETPPETGGAMYNFLYPDKELLPEDKEMSLFDHLEELRGRLLVSVLAVGAAIIGCFAYSKELIMLLEAPVSSQGVRFLQLAPGEFFFTTIKVSGYCGILLGSPVILFEIIAFVLPGLTKSERKFLAPI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G581860
TK1151 IDTkA03G581860
OH-1004 IDLXL04_011312
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.721 / OH-1004 65.983
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G581860
位置Chr03:147702887-147705739 (+)
描述Similar to TATC: Sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g01110 双精氨酸易位 系统的一部分，该系统将信号肽中包含特征性双精氨酸基序的大折叠蛋白跨类囊体膜转运。
An essential role of a TatC homologue of a Delta pH- dependent protein transporter in thylakoid membrane formation during chloroplast development in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1073/pnas.181304598

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0501700 双精氨酸转运（Tat）系统的一部分，该系统将包含特征性双精氨酸基序的折叠大蛋白通过类囊体膜转运。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011312 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程
GO:0010027 thylakoid membrane organization 生物过程
GO:0043953 protein transport by the Tat complex 生物过程
GO:0045038 protein import into chloroplast thylakoid membrane 生物过程
GO:0065002 intracellular protein transmembrane transport 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009535 chloroplast thylakoid membrane 细胞组分
GO:0033281 TAT protein transport complex 细胞组分
GO:0042651 thylakoid membrane 细胞组分
GO:0043235 receptor complex 细胞组分
GO:0009977 proton motive force dependent protein transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G01110
dosa:Os01g0501700
syn:sll0194
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.983
排名 1 · TkA03G581860 · TK1151
线粒体0.021
排名 2 · TkA03G581860 · TK1151
细胞核0.015
排名 3 · TkA03G581860 · TK1151
细胞质0.013
排名 4 · TkA03G581860 · TK1151
过氧化物酶体0.010
排名 5 · TkA03G581860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23071DUF704455-91 aa
PF00902TatC164-372 aa
PF10716NdhL229-239 aa
PF10716NdhL266-325 aa
PF24378DUF7534350-374 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G581860PF23071DUF704455910.08413.8
TkA03G581860PF00902TatC1643727.9e-65219.3
TkA03G581860PF10716NdhL2292399.27.0
TkA03G581860PF10716NdhL2663259.27.0
TkA03G581860PF24378DUF75343503740.09713.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJV5拟南芥sp|Q9SJV5|TATC_ARATH Sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic80.800%Swiss-Prot中等置信
Q9AVE6水稻sp|Q9AVE6|TATC_ORYSJ Sec-independent protein translocase protein TATC, chloroplastic83.500%Swiss-Prot中等置信

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