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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA03G561020
当前版本: TK1151 染色体: Chr03 坐标: 142294655-142298022 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2068 bp · TkA03G561020|TK1151|cDNA

AATCAAATATAATAACAAATTTTCTTCTTTTTTTCTTTAACAAAATCTCCCGGGTCTACATGGCTCCATCTGCGTTTTCACTACCATCAACGGCTTCTTAAATCCTTCCCCACTCCTCCCTTTCTCTCTCTAAAATCTTTGACTGCTTTCTCTCTCTAAAACCAAAATAAAACCCTAAAATCCACAAGCAAAAGCAAAACCCACCTCCTTTTATGGACCAAACACGTATTCTGTGTTCTTCAATATCCTTAACTTTATGA...

CDS

下载 CDS FASTA

891 bp · TkA03G561020|TK1151|CDS

ATGGCAATTGGAATCGGAATCGGGACATTGTTCATTCTTCTACTCATGTTCTTAATCGTTCTTCGCGCAACAACCAGACAAGAAGTCGACCCAGAAAAGGAAGACGACAACGATGCCAACAAAGAAGAACACGAGTCACGATTAGTTGTTTTTTTCCAGAAATCAAACGAAAACAACAAAGATCTTTCCCTCGACGACCTATTAAAATCAACCAACAGTTTAGACCAAGCAAACATAATCGGATGCGGCGGATTCGGCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

297 aa · TkA03G561020|TK1151|PROTEIN

MAIGIGIGTLFILLLMFLIVLRATTRQEVDPEKEDDNDANKEEHESRLVVFFQKSNENNKDLSLDDLLKSTNSLDQANIIGCGGFGLVFKATLPDGQKVAIKRLTGDTGEVDREFQAEVETLSRAQHPNLVLLQGYCQQKNDKFLIYSFMENGSLDYWLHEKPDGRSKLKWNTRLRIAQGAIKGLAYLHQSCDPHILHRDIKSSNILLDENFEAHLADFGLARLILPYDTHVTTDLVGTLGYIPPEYGQASVASYKGDVY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA03G561020
TK1151 IDTkA03G561020
OH-1004 IDLXL04_011022
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 29.261
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA03G561020
位置Chr03:142294655-142298022 (-)
描述Similar to PSKR: Phytosulfokine receptor 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g02220 植物磺肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性和鸟苷酸环化酶活性。
Disruption and overexpression of Arabidopsis phytosulfokine receptor gene affects cellular longevity and potential for growth.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.081109
The phytosulfokine (PSK) receptor is capable of guanylate cyclase activity and enabling cyclic GMP-dependent signaling in plants.2011 · DOI: 10.1074/jbc.m110.168823
The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
At5g53890 具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性的植物硫肽受体。 暂无已核实直接文献
At1g72300 酪氨酸硫酸化糖肽受体，具有丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶活性。
Tyrosine-sulfated glycopeptide involved in cellular proliferation and expansion in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1073/pnas.0706403104
The tyrosine-sulfated peptide receptors PSKR1 and PSY1R modify the immunity of Arabidopsis to biotrophic and necrotrophic pathogens in an antagonistic manner.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12050
Receptor kinase-mediated control of primary active proton pumping at the plasma membrane.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12680

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0917500 类受体激酶，在限制进入雄性和雌性孢子发生的细胞数量方面发挥重要作用。
The MSP1 gene is necessary to restrict the number of cells entering into male and female sporogenesis and to initiate anther wall formation in rice.2003 · DOI: 10.1105/tpc.012401
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011022 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0031347 regulation of defense response 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0045851 pH reduction 生物过程
GO:0051707 response to other organism 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G72300
ath:AT2G02220
ath:AT5G53890
dosa:Os10g0114400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.759
排名 1 · TkA03G561020 · TK1151
细胞质0.162
排名 2 · TkA03G561020 · TK1151
细胞核0.110
排名 3 · TkA03G561020 · TK1151
内质网0.070
排名 4 · TkA03G561020 · TK1151
高尔基体0.033
排名 5 · TkA03G561020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF15179Myc_target_11-77 aa
PF17667Pkinase_fungal47-104 aa
PF14531Kinase-like74-105 aa
PF00069Pkinase77-278 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr77-283 aa
PF03109ABC180-123 aa
PF14531Kinase-like157-270 aa
PF17667Pkinase_fungal179-242 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA03G561020PF15179Myc_target_11770.3211.6
TkA03G561020PF17667Pkinase_fungal471040.001118.5
TkA03G561020PF14531Kinase-like741050.003117.5
TkA03G561020PF00069Pkinase772781.1e-40140.5
TkA03G561020PF07714PK_Tyr_Ser-Thr772832.1e-40139.4
TkA03G561020PF03109ABC1801237.1e-0729.4
TkA03G561020PF14531Kinase-like1572700.003117.5
TkA03G561020PF17667Pkinase_fungal1792420.001118.5
TkA03G561020PF01636APH1852270.03814.5
TkA03G561020PF03109ABC11862257.1e-0729.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVR7拟南芥sp|Q9ZVR7|PSKR1_ARATH Phytosulfokine receptor 179.000%Swiss-Prot高置信
Q9FN37拟南芥sp|Q9FN37|PSKR2_ARATH Phytosulfokine receptor 272.300%Swiss-Prot高置信
Q9C7S5拟南芥sp|Q9C7S5|PSYR1_ARATH Tyrosine-sulfated glycopeptide receptor 166.800%Swiss-Prot高置信
Q8RZV7水稻sp|Q8RZV7|MSP1_ORYSJ Leucine-rich repeat receptor protein kinase MSP154.300%Swiss-Prot高置信

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