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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G528320
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 136244896-136251019 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2298 bp · TkA02G528320|TK1151|cDNA

ATGGAGACGGGGTTGCCATGGATCATCAATGGAGACGGGGTTGCCATGGATCCTCAATGGAGACGGGGTTGCCATGGATCCTCAATGGAGACGGGGTTGCGTGGATTTATGGGACTCACGGGATACTATCGGAAATTTGTGCAGAATTACGGGAGCATCGCCCGTCCCTTAACAGAACTGACCAAACGTGACTCGATCCAATGGAGTGATGTGGCTCAAGTGGCTTTTGAAGCTTTGAAGAGAGCCTTGGCTTTAAGCCC...

CDS

下载 CDS FASTA

2298 bp · TkA02G528320|TK1151|CDS

ATGGAGACGGGGTTGCCATGGATCATCAATGGAGACGGGGTTGCCATGGATCCTCAATGGAGACGGGGTTGCCATGGATCCTCAATGGAGACGGGGTTGCGTGGATTTATGGGACTCACGGGATACTATCGGAAATTTGTGCAGAATTACGGGAGCATCGCCCGTCCCTTAACAGAACTGACCAAACGTGACTCGATCCAATGGAGTGATGTGGCTCAAGTGGCTTTTGAAGCTTTGAAGAGAGCCTTGGCTTTAAGCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

765 aa · TkA02G528320|TK1151|PROTEIN

METGLPWIINGDGVAMDPQWRRGCHGSSMETGLRGFMGLTGYYRKFVQNYGSIARPLTELTKRDSIQWSDVAQVAFEALKRALALSPTNLAKSAYEREIMALVLAVQHWRSYLLGAAFIIYTDQKSLKFLLQQRITTPDQQNWVAKILGYNFEIRYKPGRENRTADALSRRAEAELGSMSLSEPLWLQGAQLLGECKLDSDIQQLGLKYATTPPESYGYHVRVGVLYYKNRLVISKTSVFVPLLLREFHQSASGGHSGYY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G528320
TK1151 IDTkA02G528320
OH-1004 IDLXL04_025668
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)67.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 73.987 / OH-1004 36.741
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G528320
位置Chr02:136244896-136251019 (-)
描述Similar to TY3B-G: Transposon Ty3-G Gag-Pol polyprotein (Saccharomyces cerevisiae (strain ATCC 204508 / S288c)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g16340 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g29940 与ABCG25一起，将脱落酸（ABA）从胚乳运出，通过ABCG30和ABCG40介导的输入输送到胚，以抑制胚根伸长和随后的胚发育。
The role of Arabidopsis ABCG9 and ABCG31 ATP binding cassette transporters in pollen fitness and the deposition of steryl glycosides on the pollen coat.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.118935
Abscisic acid transporters cooperate to control seed germination.2015 · DOI: 10.1038/ncomms9113
At1g59870 与 ABCG37 一起，通过在香豆素（如莨菪苷）和生长素前体吲哚-3-丁酸（IBA）外排运输中发挥双重作用，调节生长素稳态及响应，从而影响子叶、根和根毛的发育。
Loss of AtPDR8, a plasma membrane ABC transporter of Arabidopsis thaliana, causes hypersensitive cell death upon pathogen infection.2006 · DOI: 10.1093/pcp/pcj001
Arabidopsis PEN3/PDR8, an ATP binding cassette transporter, contributes to nonhost resistance to inappropriate pathogens that enter by direct penetration.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.038372
The ABC transporter AtPDR8 is a cadmium extrusion pump conferring heavy metal resistance.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03044.x
Extracellular transport and integration of plant secretory proteins into pathogen-induced cell wall compartments.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03743.x
Glucosinolate metabolites required for an Arabidopsis innate immune response.2009 · DOI: 10.1126/science.1164627
The Arabidopsis PLEIOTROPIC DRUG RESISTANCE8/ABCG36 ATP binding cassette transporter modulates sensitivity to the auxin precursor indole-3-butyric acid.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.065821
Overexpression of AtABCG36 improves drought and salt stress resistance in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2010.01353.x
Arabidopsis PIS1 encodes the ABCG37 transporter of auxinic compounds including the auxin precursor indole-3-butyric acid.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1005878107
Induction and suppression of PEN3 focal accumulation during Pseudomonas syringae pv. tomato DC3000 infection of Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1094/mpmi-11-12-0262-r
Role of the penetration-resistance genes PEN1, PEN2 and PEN3 in the hypersensitive response and race-specific resistance in Arabidopsis thaliana.2014 · DOI: 10.1111/tpj.12571
Mutant Allele-Specific Uncoupling of PENETRATION3 Functions Reveals Engagement of the ATP-Binding Cassette Transporter in Distinct Tryptophan Metabolic Pathways.2015 · DOI: 10.1104/pp.15.00182
ABC transporter PEN3/PDR8/ABCG36 interacts with calmodulin that, like PEN3, is required for Arabidopsis nonhost resistance.2016 · DOI: 10.1111/nph.13582
An Arabidopsis Lipid Flippase Is Required for Timely Recruitment of Defenses to the Host-Pathogen Interface at the Plant Cell Surface.2017 · DOI: 10.1016/j.molp.2017.04.003
Arabidopsis Transporter ABCG37/PDR9 contributes primarily highly oxygenated Coumarins to Root Exudation.2017 · DOI: 10.1038/s41598-017-03250-6
Expression analysis of transporter genes for screening candidate monolignol transporters using Arabidopsis thaliana cell suspensions during tracheary element differentiation.2018 · DOI: 10.1007/s10265-017-0979-4
Arabidopsis BTB/POZ protein-dependent PENETRATION3 trafficking and disease susceptibility.2017 · DOI: 10.1038/s41477-017-0039-z

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0724500 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2WSH0 可能是一种一般防御蛋白。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_025668 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0015074 DNA integration 生物过程
GO:0075523 viral translational frameshifting 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003723 RNA binding 分子功能
GO:0003887 DNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0003964 RNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0004519 endonuclease activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
sce:YGR109W-B
sce:YIL082W-A
spo:2542672
spo:2542797
spo:2543673
spo:3361218
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.514
排名 1 · TkA02G528320 · TK1151
细胞核0.220
排名 2 · TkA02G528320 · TK1151
过氧化物酶体0.141
排名 3 · TkA02G528320 · TK1151
线粒体0.133
排名 4 · TkA02G528320 · TK1151
内质网0.055
排名 5 · TkA02G528320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17919RT_RNaseH_268-87 aa
PF17917RT_RNaseH85-150 aa
PF17919RT_RNaseH_285-120 aa
PF17921Integrase_H2C2242-294 aa
PF09337zf-H2C2256-290 aa
PF00665rve314-408 aa
PF14533USP7_C2362-376 aa
PF29688TnsB_C364-424 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G528320PF17919RT_RNaseH_268874.5e-0524.2
TkA02G528320PF17917RT_RNaseH851504.4e-1350.0
TkA02G528320PF17919RT_RNaseH_2851204.5e-0524.2
TkA02G528320PF17921Integrase_H2C22422942.1e-1763.7
TkA02G528320PF09337zf-H2C22562900.008217.2
TkA02G528320PF00665rve3144081.6e-0835.4
TkA02G528320PF14533USP7_C23623764.4e-0833.8
TkA02G528320PF29688TnsB_C3644240.002418.4
TkA02G528320PF09337zf-H2C24154220.008217.2
TkA02G528320PF20886PWP3A-B_C4615150.09612.9
TkA02G528320PF17919RT_RNaseH_24925144.5e-0524.2
TkA02G528320PF24626SH3_Tf2-15255706.1e-1039.8
TkA02G528320PF31073DUF88035415700.03214.8
TkA02G528320PF14533USP7_C25466244.4e-0833.8
TkA02G528320PF17917RT_RNaseH5986084.4e-1350.0
TkA02G528320PF17919RT_RNaseH_25986084.5e-0524.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94A18拟南芥sp|Q94A18|AB29G_ARATH ABC transporter G family member 2967.000%Swiss-Prot低置信
Q7PC88拟南芥sp|Q7PC88|AB31G_ARATH ABC transporter G family member 3165.500%Swiss-Prot低置信
Q9XIE2拟南芥sp|Q9XIE2|AB36G_ARATH ABC transporter G family member 3663.100%Swiss-Prot低置信
Q7FMW4水稻sp|Q7FMW4|AB38G_ORYSJ ABC transporter G family member 3864.800%Swiss-Prot低置信
A2WSH0水稻sp|A2WSH0|AB36G_ORYSI ABC transporter G family member 3670.800%Swiss-Prot低置信

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