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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA02G421580
当前版本: TK1151 染色体: Chr02 坐标: 107042943-107045181 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1269 bp · TkA02G421580|TK1151|cDNA

GGGTTGCATGTCCATTGCCAACAAAAAACAAATCAAGAGGACAAAAACAATGTCAAACCTGTAACCTCACTAGATCATGATTGTGAAACCCCTAAATTACATCTCTCCACCTCCAAACTCCGGCGACCGGCACACGTACTCCGGGAATCCTCCGGCAGCGATATTCTCCGGTGTTACCGCTTTGGGAAAGAGCTCGGAAGAGGTGAGTTTGGGGTGACATATGAATGTCAAGATAAGGTGAGCGGGGAGAACGTTGCATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1269 bp · TkA02G421580|TK1151|CDS

GGGTTGCATGTCCATTGCCAACAAAAAACAAATCAAGAGGACAAAAACAATGTCAAACCTGTAACCTCACTAGATCATGATTGTGAAACCCCTAAATTACATCTCTCCACCTCCAAACTCCGGCGACCGGCACACGTACTCCGGGAATCCTCCGGCAGCGATATTCTCCGGTGTTACCGCTTTGGGAAAGAGCTCGGAAGAGGTGAGTTTGGGGTGACATATGAATGTCAAGATAAGGTGAGCGGGGAGAACGTTGCATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

422 aa · TkA02G421580|TK1151|PROTEIN

GLHVHCQQKTNQEDKNNVKPVTSLDHDCETPKLHLSTSKLRRPAHVLRESSGSDILRCYRFGKELGRGEFGVTYECQDKVSGENVACKKISKSRLRTEVDIEDVRREVEIMRHLPPHPNIVRYKDVFEDKEAIYLVMEHCEGGELFDRIVREGHYTERAAALATKTIVEVVQVCHKHGVIHRDLKPENFLYANRSENAPLKAIDFGLSIFFKPEHRFKEIVGSPYYMAPEVLRRNYGAEVDVWSAGVILYILLCGVPPFG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA02G421580
TK1151 IDTkA02G421580
OH-1004 IDLXL04_014493
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.682 / OH-1004 26.895
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA02G421580
位置Chr02:107042943-107045181 (+)
描述Similar to At3g28040: Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At3g28040
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g31500 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At5g19450 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At3g57530 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。
Arabidopsis calcium-dependent protein kinase AtCPK32 interacts with ABF4, a transcriptional regulator of abscisic acid-responsive gene expression, and modulates its activity.2005 · DOI: 10.1104/pp.105.069757

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0568600 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
Os12g0230200 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014493 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0051302 regulation of cell division 生物过程
GO:0080092 regulation of pollen tube growth 生物过程
GO:0090511 periclinal cell division 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G31500
ath:AT3G28040
ath:AT3G56370
dosa:Os07g0568600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.477
排名 1 · TkA02G421580 · TK1151
细胞膜0.381
排名 2 · TkA02G421580 · TK1151
细胞核0.315
排名 3 · TkA02G421580 · TK1151
高尔基体0.063
排名 4 · TkA02G421580 · TK1151
内质网0.055
排名 5 · TkA02G421580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase59-317 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr60-311 aa
PF14531Kinase-like62-109 aa
PF03109ABC174-127 aa
PF06293Kdo86-205 aa
PF01636APH102-147 aa
PF01163RIO1102-193 aa
PF03109ABC1133-217 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA02G421580PF00069Pkinase593173.6e-77260.0
TkA02G421580PF07714PK_Tyr_Ser-Thr603116.1e-29101.8
TkA02G421580PF14531Kinase-like621092.4e-0731.0
TkA02G421580PF03109ABC1741271.1e-0628.8
TkA02G421580PF06293Kdo862050.0003720.7
TkA02G421580PF01636APH1021470.001119.5
TkA02G421580PF01163RIO11021930.08113.3
TkA02G421580PF03109ABC11332171.1e-0628.8
TkA02G421580PF14531Kinase-like1483052.4e-0731.0
TkA02G421580PF01636APH1772060.001119.5
TkA02G421580PF13499EF-hand_73303591.9e-1041.7
TkA02G421580PF23564EF-hand_FSTL13413870.1113.6
TkA02G421580PF10591SPARC_Ca_bdg3544220.07514.1
TkA02G421580PF13499EF-hand_73644221.9e-1041.7
TkA02G421580PF00036EF-hand_13653912.3e-1040.0
TkA02G421580PF13405EF-hand_63653932.1e-0730.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SIQ7拟南芥sp|Q9SIQ7|CDPKO_ARATH Calcium-dependent protein kinase 2466.700%Swiss-Prot高置信
Q42438拟南芥sp|Q42438|CDPK8_ARATH Calcium-dependent protein kinase 865.300%Swiss-Prot高置信
Q6NLQ6拟南芥sp|Q6NLQ6|CDPKW_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3263.400%Swiss-Prot高置信
Q84SL0水稻sp|Q84SL0|CDPKK_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2066.000%Swiss-Prot高置信
Q2QVG8水稻sp|Q2QVG8|CDPKT_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 2964.000%Swiss-Prot高置信

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