RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G634630
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 160549419-160551210 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1215 bp · TkA01G634630|TK1151|cDNA

CACAAACTCTCCGACTGCCGTTGTGATTTCAATTTCAAATTCGATCAATTTATATCCCTCCCATTTCATACTCACGCTCCCACCTTCATTCTGCAACCAGCCATGGCCATGGAAGACAAGTACGAGAAACTGGAGAAGGTAGGCGAAGGCACCTATGGAAAAGTCTACAAAGCCAAAGACAAGCAAACCGGTCAACTCGTCGCCCTCAAGAAAACCCGTCTCGAGATGGACGAGGAAGGCATCCCACCCACCGCCCTCCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1023 bp · TkA01G634630|TK1151|CDS

CACAAACTCTCCGACTGCCGTTGTGATTTCAATTTCAAATTCGATCAATTTATATCCCTCCCATTTCATACTCACGCTCCCACCTTCATTCTGCAACCAGCCATGGCCATGGAAGACAAGTACGAGAAACTGGAGAAGGTAGGCGAAGGCACCTATGGAAAAGTCTACAAAGCCAAAGACAAGCAAACCGGTCAACTCGTCGCCCTCAAGAAAACCCGTCTCGAGATGGACGAGGAAGGCATCCCACCCACCGCCCTCCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

340 aa · TkA01G634630|TK1151|PROTEIN

HKLSDCRCDFNFKFDQFISLPFHTHAPTFILQPAMAMEDKYEKLEKVGEGTYGKVYKAKDKQTGQLVALKKTRLEMDEEGIPPTALREISLLQMLSNSIYIVRLICVQHIHHNGKPLLYLVFEYLDTDLKKFIDSHRKGPNPSPLPSSQIQSFLFQLCKGVAHCHGHGVLHRDLKPQNLLVDKEKGILKIADLGLGRAFTVPLKSYTHEIVTLWYRAPEVLLGSTHYSTGVDMWSVGCIFAEMSRRQALFPGDSEFQQLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G634630
TK1151 IDTkA01G634630
OH-1004 IDLXL04_010696
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)57.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.353 / OH-1004 88.923
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G634630
位置Chr01:160549419-160551210 (+)
描述Similar to CDC2A: Cell division control protein 2 homolog A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38620 与CDKB1-1一起，促进气孔细胞谱系的最后一次分裂以及气孔数量。 暂无已核实直接文献
At3g54180 可能控制 G2/M期进展。
An Arabidopsis cell cycle -dependent kinase-related gene, CDC2b, plays a role in regulating seedling growth in darkness.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.10.1883
At1g20930 细胞周期蛋白dependent kinase B2-2。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0897000 细胞周期蛋白dependent kinase B1-1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010696 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000082 G1/S transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0010389 regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051445 regulation of meiotic cell cycle 生物过程
GO:0000307 cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008353 RNA polymerase II CTD heptapeptide repeat kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.618
排名 1 · TkA01G634630 · TK1151
细胞质0.571
排名 2 · TkA01G634630 · TK1151
线粒体0.059
排名 3 · TkA01G634630 · TK1151
细胞膜0.051
排名 4 · TkA01G634630 · TK1151
内质网0.038
排名 5 · TkA01G634630 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12330Haspin_kinase12-199 aa
PF03109ABC136-78 aa
PF00069Pkinase41-332 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr44-245 aa
PF14531Kinase-like46-72 aa
PF01636APH81-126 aa
PF06293Kdo83-186 aa
PF08966DUF188288-138 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G634630PF12330Haspin_kinase121990.03713.8
TkA01G634630PF03109ABC136780.0003720.4
TkA01G634630PF00069Pkinase413321.1e-64219.1
TkA01G634630PF07714PK_Tyr_Ser-Thr442452.8e-2796.4
TkA01G634630PF14531Kinase-like46720.2211.4
TkA01G634630PF01636APH811260.05513.9
TkA01G634630PF06293Kdo831860.003217.6
TkA01G634630PF08966DUF1882881380.2212.6
TkA01G634630PF03109ABC11502090.0003720.4
TkA01G634630PF14531Kinase-like1551920.2211.4
TkA01G634630PF01636APH1681860.05513.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q2V419拟南芥sp|Q2V419|CKB12_ARATH Cyclin-dependent kinase B1-281.900%Swiss-Prot高置信
P25859拟南芥sp|P25859|CKB11_ARATH Cyclin-dependent kinase B1-182.500%Swiss-Prot高置信
Q8LG64拟南芥sp|Q8LG64|CKB22_ARATH Cyclin-dependent kinase B2-267.200%Swiss-Prot高置信
Q8L4P8水稻sp|Q8L4P8|CKB11_ORYSJ Cyclin-dependent kinase B1-185.100%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看