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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G621610
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 156869677-156870582 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

711 bp · TkA01G621610|TK1151|cDNA

ATGGAGCGTATATGTGGTCGGGCATTGGGCTTACAATTTGACAAAAATACGGGATCATTATTCATTGCAGATGCTTATTTTGGGCTACTTTCAGTGGGCCCTAAAGGTGGGTTAGCCACTTCTCTGGTATCAAAAGACCAGAATCTTCCATTAAAATTCACAAATTCACTAGACATTGACCAGACCAATAGAGTCATCTACTTTACCGATAGCAGTCAACGTTACACCCGTAGGGATCACATGCTTGTCATACTCACAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

711 bp · TkA01G621610|TK1151|CDS

ATGGAGCGTATATGTGGTCGGGCATTGGGCTTACAATTTGACAAAAATACGGGATCATTATTCATTGCAGATGCTTATTTTGGGCTACTTTCAGTGGGCCCTAAAGGTGGGTTAGCCACTTCTCTGGTATCAAAAGACCAGAATCTTCCATTAAAATTCACAAATTCACTAGACATTGACCAGACCAATAGAGTCATCTACTTTACCGATAGCAGTCAACGTTACACCCGTAGGGATCACATGCTTGTCATACTCACAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

236 aa · TkA01G621610|TK1151|PROTEIN

MERICGRALGLQFDKNTGSLFIADAYFGLLSVGPKGGLATSLVSKDQNLPLKFTNSLDIDQTNRVIYFTDSSQRYTRRDHMLVILTNEKTGRLLKYDLESTNVTVIHNNLTFPNGVTLSQDGNFLLVAETTSCRIMRFWLKTPKAGTCEVFADLPGYPDNIKRNQQGEFWVAIVTSHIGKGKGEGLAVKLGVNGEILEILEDVHGKRWKYASEVMERDGNLWIGSVENNVAIKLKI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G621610
TK1151 IDTkA01G621610
OH-1004 IDLXL04_000301
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)88.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G621610
位置Chr01:156869677-156870582 (+)
描述Similar to SSL10: Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g57030 蛋白 STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 10。 暂无已核实直接文献
At2g41290 异胡豆苷合酶样蛋白2。 暂无已核实直接文献
At1g08470 蛋白STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 3。 暂无已核实直接文献
At2g41300 蛋白质 STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 1。 暂无已核实直接文献
At3g59530 在花粉发育过程中外壁形成所必需。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000301 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0010584 pollen exine formation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08470
ath:AT2G41290
ath:AT2G41300
ath:AT3G57030
ath:AT3G59530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞外0.343
排名 1 · TkA01G621610 · TK1151
细胞质0.230
排名 2 · TkA01G621610 · TK1151
溶酶体／液泡0.219
排名 3 · TkA01G621610 · TK1151
内质网0.130
排名 4 · TkA01G621610 · TK1151
细胞膜0.091
排名 5 · TkA01G621610 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01436NHL10-25 aa
PF03088Str_synth11-25 aa
PF25784BigA_N12-27 aa
PF08450SGL28-176 aa
PF01731Arylesterase52-74 aa
PF25784BigA_N52-101 aa
PF03088Str_synth55-142 aa
PF26550Tricorn_2nd55-136 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G621610PF01436NHL10250.000919.9
TkA01G621610PF03088Str_synth11252.7e-30105.1
TkA01G621610PF25784BigA_N12270.6211.0
TkA01G621610PF08450SGL281761.2e-1455.3
TkA01G621610PF01731Arylesterase52740.0001321.5
TkA01G621610PF25784BigA_N521010.6211.0
TkA01G621610PF03088Str_synth551422.7e-30105.1
TkA01G621610PF26550Tricorn_2nd551360.001618.0
TkA01G621610PF01731Arylesterase991720.0001321.5
TkA01G621610PF06525SoxE1011320.1912.0
TkA01G621610PF01436NHL1101350.000919.9
TkA01G621610PF25784BigA_N1111310.6211.0
TkA01G621610PF07494Reg_prop1621720.0614.3
TkA01G621610PF01436NHL1641720.000919.9
TkA01G621610PF07494Reg_prop1932050.0614.3
TkA01G621610PF25784BigA_N2052120.6211.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q4V3D9拟南芥sp|Q4V3D9|SSL10_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 1049.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SLG8拟南芥sp|Q9SLG8|SSL2_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 245.200%Swiss-Prot中等置信
Q8VWF6拟南芥sp|Q8VWF6|SSL3_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 344.700%Swiss-Prot中等置信
F4IJZ6拟南芥sp|F4IJZ6|SSL1_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 143.800%Swiss-Prot中等置信
Q9M1B4拟南芥sp|Q9M1B4|SSL13_ARATH Protein STRICTOSIDINE SYNTHASE-LIKE 1342.400%Swiss-Prot中等置信

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