基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_010886
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 154871857-154877793
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3300 bp · LXL04_010886|LXL04_010886|OH1004|cDNA
atggatACATCCGCCTGTATAAAAGAAGTGAATAGATCGGCATCGGTGGCCTTTGCGCCCGAAGCGCCGCTCATTGCCGCAGGCACTATGGCGGGAGCTGTCGATATGTCGTTCAGCTCCTCCGCAAATCTGGAAATCTTTCAACTTGACTTCCAATCCGACGATCGCAAGCTTCCCTTAGTTGGCGCGATACCTATTACCGAACCATTTAATCGCCTATCATGGGGAAAATCCCCGACAGCGGGTTCGGAGGAATTCTC...
CDS
下载 CDS FASTA3300 bp · LXL04_010886|LXL04_010886|OH1004|CDS
ATGGATACATCCGCCTGTATAAAAGAAGTGAATAGATCGGCATCGGTGGCCTTTGCGCCCGAAGCGCCGCTCATTGCCGCAGGCACTATGGCGGGAGCTGTCGATATGTCGTTCAGCTCCTCCGCAAATCTGGAAATCTTTCAACTTGACTTCCAATCCGACGATCGCAAGCTTCCCTTAGTTGGCGCGATACCTATTACCGAACCATTTAATCGCCTATCATGGGGAAAATCCCCGACAGCGGGTTCGGAGGAATTCTC...
1099 aa · LXL04_010886|LXL04_010886|OH1004|PROTEIN
MDTSACIKEVNRSASVAFAPEAPLIAAGTMAGAVDMSFSSSANLEIFQLDFQSDDRKLPLVGAIPITEPFNRLSWGKSPTAGSEEFSLGLVAGGLVDGNIGIWNPRILISSEEKEGALVQQLTRHKGPVRGLEFSGLSPNHLASGAEEGEICIWDISKPTEPTHFPPLKGNASAKQGEISYLSWNRKVQPILASTSFNGTTVVWDLRKQKPIISFSDSVRRRCSVLQWHPDFATQLIVASDDDSSPSLRIWDMRNTMSPL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_010886 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_010886 |
|---|---|
| 位置 | Chr02:154871857-154877793 (-) |
| 描述 | Similar to SEC31B: Protein transport protein SEC31 homolog B |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007029 endoplasmic reticulum organization 生物过程 GO:0015031 protein transport 生物过程 GO:0051592 response to calcium ion 生物过程 GO:0090110 COPII-coated vesicle cargo loading 生物过程 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005768 endosome 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0030120 vesicle coat 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G18830 ath:AT3G63460 gga:422597 mmu:69162 pon:100173999 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.659
高尔基体0.237
细胞核0.201
溶酶体／液泡0.115
细胞膜0.093
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF24814.2WD40_Prp1990-159 aaPF25047.1Beta-prop_TEP1_2nd90-226 aaPF24796.2WDR5590-216 aaPF24807.2WD40_CDC20-Fz91-158 aaPF25173.2Beta-prop_WDR3_1st91-158 aaPF24105.2Beta-prop_CAF1B_HIR191-254 aaPF25175.2Beta-prop_WDR597-210 aaPF23381.2Beta-prop_IFT122_1st113-340 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_010886 | PF24814.2 | WD40_Prp19 | 90 | 159 | 1.3e-15 | 57.9 |
| LXL04_010886 | PF25047.1 | Beta-prop_TEP1_2nd | 90 | 226 | 1.7e-15 | 57.6 |
| LXL04_010886 | PF24796.2 | WDR55 | 90 | 216 | 2.7e-09 | 37.2 |
| LXL04_010886 | PF24807.2 | WD40_CDC20-Fz | 91 | 158 | 4.8e-21 | 76.0 |
| LXL04_010886 | PF25173.2 | Beta-prop_WDR3_1st | 91 | 158 | 5.7e-18 | 66.0 |
| LXL04_010886 | PF24105.2 | Beta-prop_CAF1B_HIR1 | 91 | 254 | 2.2e-13 | 50.7 |
| LXL04_010886 | PF25175.2 | Beta-prop_WDR5 | 97 | 210 | 9.9e-22 | 78.3 |
| LXL04_010886 | PF23381.2 | Beta-prop_IFT122_1st | 113 | 340 | 1e-17 | 65.1 |
| LXL04_010886 | PF25174.2 | Beta-prop_THOC3 | 125 | 243 | 2.7e-21 | 76.5 |
| LXL04_010886 | PF23098.2 | Beta-prop_NOL10_N | 130 | 257 | 4.7e-06 | 26.7 |
| LXL04_010886 | PF24807.2 | WD40_CDC20-Fz | 174 | 330 | 4.8e-21 | 76.0 |
| LXL04_010886 | PF25173.2 | Beta-prop_WDR3_1st | 176 | 338 | 5.7e-18 | 66.0 |
| LXL04_010886 | PF24814.2 | WD40_Prp19 | 176 | 273 | 1.3e-15 | 57.9 |
| LXL04_010886 | PF24817.2 | WD40_WDHD1_1st | 177 | 239 | 2e-11 | 44.4 |
| LXL04_010886 | PF23414.2 | Beta-prop_EML_2 | 191 | 308 | 2.4e-11 | 44.2 |
| LXL04_010886 | PF29037.1 | DSE1_N | 220 | 299 | 5.8e-12 | 46.1 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。