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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005954
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 176301366-176302322 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

957 bp · LXL04_005954|LXL04_005954|OH1004|cDNA

ATGTCTATCCCAAAATCCTCTTCTAAGCTTCAATCCACTGAAGCCAACTCTCATATCGACATGGGGTTTACAATACTACAAAGAAACACATCCATTCCTCAACCAACAGAAAGAAGAGGCCGGAAAAAGGAGGCGGAGCCAGGGCGGTTCCTTGGTGTCAGGAGGCGGCCGTGGGGAAGATATGCGGCTGAAATAAGAGACCCCACAACCAAAGAACGACATTGGCTTGGAACATTTGATACTGCCCAAGAAGCTGCCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

957 bp · LXL04_005954|LXL04_005954|OH1004|CDS

ATGTCTATCCCAAAATCCTCTTCTAAGCTTCAATCCACTGAAGCCAACTCTCATATCGACATGGGGTTTACAATACTACAAAGAAACACATCCATTCCTCAACCAACAGAAAGAAGAGGCCGGAAAAAGGAGGCGGAGCCAGGGCGGTTCCTTGGTGTCAGGAGGCGGCCGTGGGGAAGATATGCGGCTGAAATAAGAGACCCCACAACCAAAGAACGACATTGGCTTGGAACATTTGATACTGCCCAAGAAGCTGCCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

318 aa · LXL04_005954|LXL04_005954|OH1004|PROTEIN

MSIPKSSSKLQSTEANSHIDMGFTILQRNTSIPQPTERRGRKKEAEPGRFLGVRRRPWGRYAAEIRDPTTKERHWLGTFDTAQEAALAYDRAALSMKGTQARTNFIYTTDHDHNNTNFHTLISPLDVQTLFQPPQLFNPPPPPPPPTHTTKQPINPTINIPHNPNQSGIDTRHQSSIDDHNDFFISEGDNSGYLGSIVPDDYLNPRSSNASNVNISTHDDNQSHSYWDQSNQLFGSNEEVYGGAWGGSTDSSWETFNGYD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005954
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005954
位置Chr01:176301366-176302322 (+)
描述Similar to ERF086: Ethylene-responsive transcription factor ERF086
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g18560 可能充当转录激活因子。
The auxin-regulated AP2/EREBP gene PUCHI is required for morphogenesis in the early lateral root primordium of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.050674
A role for Arabidopsis PUCHI in floral meristem identity and bract suppression.2009 · DOI: 10.1105/tpc.109.067025
The AP2/EREBP gene PUCHI Co-Acts with LBD16/ASL18 and LBD18/ASL20 downstream of ARF7 and ARF19 to regulate lateral root development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1093/pcp/pct081
At5g13910 促进细胞分裂的因子，参与叶片分化、花序分枝，以及心皮和长角果形态。 暂无已核实直接文献
At1g28160 可能充当转录激活因子。 暂无已核实直接文献
At1g12890 可能充当转录激活因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0669500 必需防止在颖花序分生组织内形成侧芽分生组织，并允许随后建立花分生组织特性。
Ds tagging of BRANCHED FLORETLESS 1 (BFL1) that mediates the transition from spikelet to floret meristem in rice (Oryza sativa L).2003 · DOI: 10.1186/1471-2229-3-6
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005954 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009739 response to gibberellin 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0010102 lateral root morphogenesis 生物过程
GO:0010432 bract development 生物过程
GO:0010451 floral meristem growth 生物过程
GO:0010582 floral meristem determinacy 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:1901332 negative regulation of lateral root development 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12890
ath:AT1G28160
ath:AT5G13910
ath:AT5G18560
dosa:Os07g0669500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.966
排名 1 · LXL04_005954 · OH-1004
细胞质0.097
排名 2 · LXL04_005954 · OH-1004
内质网0.028
排名 3 · LXL04_005954 · OH-1004
细胞膜0.028
排名 4 · LXL04_005954 · OH-1004
质体0.018
排名 5 · LXL04_005954 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00847.27AP251-98 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005954PF00847.27AP251986.1e-1349.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q6J9Q2拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF08648.485%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M644拟南芥Ethylene-responsive transcription factor LEP75.676%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FZ90拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF08758.947%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q3E703拟南芥Ethylene-responsive transcription factor ERF08867.606%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q8H3Q1水稻Ethylene-responsive transcription factor FZP39.259%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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