LXL04_003080 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_003080

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 66894023-66897340 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1530 bp · LXL04_003080|LXL04_003080|OH1004|cDNA

atggcTACATTTAAGAAAAAATTAAAGAAGAAAAGCTTCCACTGTGTATTATTATTGAAAATATATTGGGTCAAGTGGACTGTGAGGCCAGCAAGACAAGCCTCGTGTCTCTTCTCGCTGCCCCATGTGAATGTGATATTTTGCTTCCATCACCACCCCctaatttcttcttcttctgcttcttctttaCGATATTCATTTTTCGATACAAGAAAGGCAAGCAAAGAAACACTCCAAGTTCCACCTCTTCCACAACTAGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1530 bp · LXL04_003080|LXL04_003080|OH1004|CDS

ATGGCTACATTTAAGAAAAAATTAAAGAAGAAAAGCTTCCACTGTGTATTATTATTGAAAATATATTGGGTCAAGTGGACTGTGAGGCCAGCAAGACAAGCCTCGTGTCTCTTCTCGCTGCCCCATGTGAATGTGATATTTTGCTTCCATCACCACCCCCTAATTTCTTCTTCTTCTGCTTCTTCTTTACGATATTCATTTTTCGATACAAGAAAGGCAAGCAAAGAAACACTCCAAGTTCCACCTCTTCCACAACTAGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

509 aa · LXL04_003080|LXL04_003080|OH1004|PROTEIN

MATFKKKLKKKSFHCVLLLKIYWVKWTVRPARQASCLFSLPHVNVIFCFHHHPLISSSSASSLRYSFFDTRKASKETLQVPPLPQLAPTYRRGGTDSNAERFGVFYTIKEGSRSPPALLGLSTSYLSGIAGFPTLPYMLPYLGYLQKQKTGKKRIRVYMDGCFDLMHYGHANALRQAKALGDELVVGVVSDEEIIKNKGPPVLSMEERLALVSGLKWVDEVIANAPYAITEEFMNSLFKEHKIDYIIHGDDPCLLPDGSD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_003080`
TK1151 ID	TkA01G396370
OH-1004 ID	LXL04_003080
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.571 / OH-1004 77.210 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_003080

位置 Chr01:66894023-66897340 (-)

描述 Similar to PECT1: Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g38670`	在磷脂磷脂酰乙醇胺的生物合成中发挥重要作用。	Defects in CTP:PHOSPHORYLETHANOLAMINE CYTIDYLYLTRANSFERASE affect embryonic and postembryonic development in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.040840

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003080 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006646 phosphatidylethanolamine biosynthetic process 生物过程

GO:0008654 phospholipid biosynthetic process 生物过程

GO:0010119 regulation of stomatal movement 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005741 mitochondrial outer membrane 细胞组分

GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分

GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分

GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分

GO:0045335 phagocytic vesicle 细胞组分

GO:0004306 ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G38670

bta:510274

ddi:DDB_G0270298

hsa:5833

mmu:68671

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.615

排名 1 · LXL04_003080 · OH-1004

质体0.199

排名 2 · LXL04_003080 · OH-1004

细胞质0.102

排名 3 · LXL04_003080 · OH-1004

过氧化物酶体0.078

排名 4 · LXL04_003080 · OH-1004

细胞核0.071

排名 5 · LXL04_003080 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01467.33CTP_transf_like158-287 aa

PF01467.33CTP_transf_like346-445 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_003080	`PF01467.33`	CTP_transf_like	158	287	5.9e-45	153.4
LXL04_003080	`PF01467.33`	CTP_transf_like	346	445	5.9e-45	153.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZVI9`	拟南芥	Ethanolamine-phosphate cytidylyltransferase	67.297%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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