橡胶生物合成专题

围绕 MVA/MEP、IPP/DMAPP、异戊二烯供体、CPT/CPTL、REF/SRPP、乳胶/根相关和萜类代谢，集中展示候选基因、证据等级、跨模块支持与下载入口。

本专题基于当前 GFF/GO/KEGG/同源注释预计算候选集合，并联动表达、蛋白组、亚细胞定位、Pfam、Swiss-Prot、PPI、共表达和 TFBS 等证据。所有结果为候选证据，不等同于实验证实的橡胶合成调控机制。

当前数据库收录 5523 条候选记录、4979 个候选基因和 8 个通路步骤；主显示以 TK1151 参考为中心，OH-1004/LXL04 参考仍可直接查询和跳转。

示例 TkA01G624900 LXL04_000258

下载当前筛选候选基因 TSV

跨物种研究参考

此处的 4 条参考基因与橡胶草自身候选记录分开统计。它们来自巴西橡胶树、银胶菊、近缘蒲公英和杜仲的已发表实验、组学或序列资源；同源性或外源功能不等同于橡胶草中的直接验证。

1. 选择参照物种点击下方物种卡或使用筛选框，聚焦同一物种的参考基因和材料背景。

2. 查看证据类型优先查看“证据与边界”列：直接实验、组学关联和序列资源的可解释范围不同。

3. 核查原始来源每条记录的 DOI、论文或公共数据库入口均可点击；可下载当前筛选结果用于进一步比对。

杜仲记录仅作为反式聚异戊二烯（杜仲胶）对照，不计入天然顺式橡胶候选和通路卡片数量。

4巴西橡胶树点击查看 · 2 个来源 · cis-1,4-polyisoprene

下载当前跨物种参考 TSV

物种与材料	参考基因/序列 ID	通路步骤	证据与边界	来源
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneRubber particles	`HRBP`LC057267CPTL	CPT/CPTLHRT1复合体辅助亚基	A_direct_experiment HRBP作为HRT1橡胶粒子复合体辅助亚基被报道。 Complex-support evidence, not a stand-alone catalytic claim.	10.7554/eLife.19022Identification and reconstitution of the rubber biosynthetic machinery on rubber particles from Hevea brasiliensis
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneRubber particles	`HRT1`BAB71776.2;AB061234.3CPT	CPT/CPTL橡胶粒子上的顺式异戊二烯基转移酶	A_direct_experiment HRT1在去污剂清洗的橡胶粒子上显示体外橡胶转移酶活性，HRT1-REF-HRBP复合体提高活性。 Direct evidence in Hevea rubber particles; not direct validation in rubber dandelion.	10.7554/eLife.19022Identification and reconstitution of the rubber biosynthetic machinery on rubber particles from Hevea brasiliensis
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneLatex and recombinant enzyme	`HRT2`Q8W3U4;AB064661.2CPT	CPT/CPTL乳胶表达的顺式异戊二烯基转移酶参考	A_enzyme_experiment HRT2为顺式异戊二烯基转移酶和乳胶表达参考。 Do not claim direct reconstitution of 高置信-molecular-weight natural rubber by HRT2 alone.	10.1046/j.1432-1033.2003.03863.xMolecular cloning expression and characterization of cDNA encoding cis-prenyltransferases from Hevea brasiliensis
巴西橡胶树Hevea brasiliensiscis-1,4-polyisopreneRubber particles	`REF`REF complex memberREF	REF/SRPP 橡胶颗粒橡胶粒子复合体成员	A_complex_evidence HRT1 and HRBP/REF particle-complex evidence; REF is not displayed as a stand-alone catalytic proof. Not a stand-alone catalytic proof.	10.7554/eLife.19022Identification and reconstitution of the rubber biosynthetic machinery on rubber particles from Hevea brasiliensis

巴西橡胶树 · HRBP

序列 IDLC057267

步骤CPT/CPTL · CPTL

证据HRBP作为HRT1橡胶粒子复合体辅助亚基被报道。

边界Complex-support evidence, not a stand-alone catalytic claim.

来源10.7554/eLife.19022

巴西橡胶树 · HRT1

序列 IDBAB71776.2;AB061234.3

步骤CPT/CPTL · CPT

证据HRT1在去污剂清洗的橡胶粒子上显示体外橡胶转移酶活性，HRT1-REF-HRBP复合体提高活性。

边界Direct evidence in Hevea rubber particles; not direct validation in rubber dandelion.

来源10.7554/eLife.19022

巴西橡胶树 · HRT2

序列 IDQ8W3U4;AB064661.2

步骤CPT/CPTL · CPT

证据HRT2为顺式异戊二烯基转移酶和乳胶表达参考。

边界Do not claim direct reconstitution of 高置信-molecular-weight natural rubber by HRT2 alone.

来源10.1046/j.1432-1033.2003.03863.x

巴西橡胶树 · REF

序列 IDREF complex member

步骤REF/SRPP 橡胶颗粒 · REF

证据HRT1 and HRBP/REF particle-complex evidence; REF is not displayed as a stand-alone catalytic proof.

边界Not a stand-alone catalytic proof.

来源10.7554/eLife.19022

通路导航与候选分布

MVA · MVA 甲羟戊酸途径

High 40 · Medium 3 · Low 4 MEP · MEP 非甲羟戊酸途径

High 23 · Medium 0 · Low 36 IPP/DMAPP/FPP · 异戊二烯供体

271

High 141 · Medium 83 · Low 47 CPT/CPTL · 顺式异戊二烯转移酶

High 0 · Medium 0 · Low 5 REF/SRPP · 橡胶颗粒相关蛋白

High 0 · Medium 0 · Low 7 Rubber · 橡胶生物合成

288

High 1 · Medium 287 · Low 0 Terpenoid · 萜类代谢

380

High 72 · Medium 107 · Low 201 Latex/root · 乳胶/根相关候选

4466

High 231 · Medium 1284 · Low 2951

377 MVA/MEP 与异戊二烯

点击筛选 · High 204 · Medium 86 · Low 87 4466 乳胶/根相关候选

点击筛选 · High 231 · Medium 1284 · Low 2951 300 橡胶生物合成

点击筛选 · High 1 · Medium 287 · Low 12 380 萜类代谢

点击筛选 · High 72 · Medium 107 · Low 201

候选基因表

当前筛选共 2000 条候选，每页显示 10 条；当前为第 24/200 页。下载按钮导出当前筛选条件下最多 2000 条记录。点击上方通路卡或统计卡可快速筛选，证据摘要可通过基因详情和关联模块继续核查。

基因 ID	通路/步骤	等级	证据层	位置	关键证据	操作
`LXL04_004037` TK1151: - OH-1004: LXL04_004037	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:122743952-122744289 -	go:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`LXL04_004043` TK1151: - OH-1004: LXL04_004043	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:123221404-123222267 +	go:0006970 response to osmotic stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G174520` TK1151: TkA01G174520 OH-1004: LXL04_004293	萜类代谢萜类代谢	高置信分数 8	功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:131831356-131832928 +	go:0016117 carotenoid biosynthetic process 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G004390` TK1151: TkA01G004390;TkA01G132850 OH-1004: LXL04_004575	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:140916871-140919628 +	go:0006979 response to oxidative stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G132810` TK1151: TkA01G132810 OH-1004: LXL04_004576	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:140934609-140935574 +	go:0006950 response to stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G121250` TK1151: TkA01G121250 OH-1004: LXL04_004704	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI	CM104799.1:144024827-144026223 +	go:0006950 response to stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G120640` TK1151: TkA01G120640 OH-1004: LXL04_004705	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:144124256-144125750 +	go:0006950 response to stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G117460` TK1151: TkA01G117460;TkA03G382580;TkA08G213620 OH-1004: LXL04_004734	乳胶/根相关候选乳胶/根相关候选	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-ProtPPI共表达	CM104799.1:144997459-144999440 +	go:0006979 response to oxidative stress 生物过程	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G096770` TK1151: TkA01G096770;TkA01G096950 OH-1004: LXL04_004922	MVA/MEP 与异戊二烯异戊二烯供体	高置信分数 8	GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:150213195-150216277 -	go:0010333 terpene synthase activity 分子功能	基因详情表达蛋白组 JBrowse
`TkA01G074040` TK1151: TkA01G074040;TkA01G074120 OH-1004: LXL04_005234	萜类代谢萜类代谢	高置信分数 8	功能注释GO表达定位PfamSwiss-Prot共表达	CM104799.1:158129845-158134194 +	go:0010436 carotenoid dioxygenase activity 分子功能	基因详情表达蛋白组 JBrowse