ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 54 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA05G071860
Chr05:19188824-19190446 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019658
Chr04:36082479-36086294 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.800 查询 100.000 / 对象 66.914 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G071860 |
|
TkA05G072940
Chr05:19502763-19503380 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020305
Chr04:64966179-64967758 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 100.000 / 对象 42.014 |
TkA05G072940 | |
|
TkA05G074180
Chr05:19760132-19760689 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019675
Chr04:36701874-36709855 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 93.514 / 对象 27.814 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074180 |
|
TkA05G074200
Chr05:19770235-19770831 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019675
Chr04:36701874-36709855 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.300 查询 89.899 / 对象 28.617 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074200 |
|
TkA05G074490
Chr05:19832896-19833261 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019676
Chr04:36771747-36772803 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
81.900 查询 95.146 / 对象 48.133 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074490 |
|
TkA05G074500
Chr05:19833740-19834718 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019677
Chr04:36773373-36775053 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 48.831 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074500 |
|
TkA05G074650
Chr05:19875082-19877641 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019678
Chr04:36799519-36805841 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.900 查询 92.569 / 对象 41.719 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074650 |
|
TkA05G074660
Chr05:19877869-19880117 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019679
Chr04:36806233-36808308 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.600 查询 94.828 / 对象 99.698 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074660 |
|
TkA05G074730
Chr05:19897616-19898184 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_011229
Chr02:160529087-160530229 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.900 查询 75.781 / 对象 55.429 |
TkA05G074730 | |
|
TkA05G074810
Chr05:19930732-19931250 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019681
Chr04:36856232-36859433 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.400 查询 100.000 / 对象 43.990 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G074810 |
|
TkA05G074820
Chr05:19932628-19934093 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_009631
Chr02:130005398-130006732 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
70.700 查询 97.934 / 对象 94.444 |
TkA05G074820 | |
|
TkA05G075110
Chr05:19996736-19999420 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_007129
Chr02:36922781-36938347 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.100 查询 86.243 / 对象 17.304 |
TkA05G075110 | |
|
TkA05G075180
Chr05:20019730-20020125 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019689
Chr04:36953894-36954289 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G075180 |
|
TkA05G075610
Chr05:20128170-20128568 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019689
Chr04:36953894-36954289 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G075610 |
|
TkA05G075890
Chr05:20185096-20191099 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022058
Chr04:144096667-144099062 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.600 查询 100.000 / 对象 77.809 |
TkA05G075890 | |
|
TkA05G075990
Chr05:20219461-20226230 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019693
Chr04:37045304-37051820 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.700 查询 99.814 / 对象 57.969 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G075990 |
|
TkA05G077290
Chr05:20570589-20571378 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024784
Chr05:98880713-98882354 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 96.250 / 对象 54.804 |
TkA05G077290 | |
|
TkA05G077970
Chr05:20711575-20713435 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_017052
Chr03:140094587-140095203 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.200 查询 85.465 / 对象 97.351 |
TkA05G077970 | |
|
TkA05G078980
Chr05:20966005-20970134 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019712
Chr04:37633072-37633368 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.000 查询 54.472 / 对象 68.367 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G078980 |
|
TkA05G078990
Chr05:20970979-20971458 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_002355
Chr01:46832292-46847303 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 91.824 / 对象 28.131 |
TkA05G078990 | |
|
TkA05G080040
Chr05:21210072-21212652 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019719
Chr04:37868612-37870733 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 56.386 / 对象 89.604 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G080040 |
|
TkA05G081050
Chr05:21450451-21450765 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_009822
Chr02:134214984-134215301 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.800 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G081050 | |
|
TkA05G081140
Chr05:21462619-21463474 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_031353
Chr07:4910111-4911423 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 59.712 |
TkA05G081140 | |
|
TkA05G081450
Chr05:22055205-22056576 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_014905
Chr03:59362883-59364247 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.900 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G081450 | |
|
TkA05G081720
Chr05:22120134-22120460 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024953
Chr05:102709225-102713482 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.700 查询 72.222 / 对象 46.154 |
TkA05G081720 | |
|
TkA05G082050
Chr05:22222453-22223445 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020237
Chr04:59256009-59260757 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 97.222 / 对象 34.653 |
TkA05G082050 | |
|
TkA05G082060
Chr05:22226793-22227785 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020237
Chr04:59256009-59260757 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 97.222 / 对象 34.653 |
TkA05G082060 | |
|
TkA05G082100
Chr05:22238703-22240290 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019739
Chr04:38906220-38907223 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G082100 |
|
TkA05G083090
Chr05:22496866-22497807 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_037160
Chr09:529472-534997 (+)
CM104807.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.000 查询 99.681 / 对象 48.980 |
TkA05G083090 | |
|
TkA05G083130
Chr05:22514942-22519577 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_007736
Chr02:58740459-58742790 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.100 查询 85.642 / 对象 63.286 |
TkA05G083130 | |
|
TkA05G083460
Chr05:22620050-22620590 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_006013
Chr01:176972645-176974820 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
89.500 查询 54.808 / 对象 63.218 |
TkA05G083460 | |
|
TkA05G085450
Chr05:23100053-23101944 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022814
Chr05:10052309-10058078 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.500 查询 69.697 / 对象 29.677 |
TkA05G085450 | |
|
TkA05G085810
Chr05:23185014-23185760 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019772
Chr04:39795570-39796316 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
74.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G085810 |
|
TkA05G086260
Chr05:23281233-23281535 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_010902
Chr02:155021159-155024402 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
84.700 查询 59.000 / 对象 30.729 |
TkA05G086260 | |
|
TkA05G086740
Chr05:23425061-23427158 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_024153
Chr05:82731824-82733970 (+)
CM104803.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
54.800 查询 63.054 / 对象 85.859 |
TkA05G086740 | |
|
TkA05G087080
Chr05:23537564-23538861 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_022686
Chr05:4789116-4791851 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.300 查询 98.485 / 对象 44.521 |
TkA05G087080 | |
|
TkA05G087110
Chr05:23549146-23549586 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_020372
Chr04:71373246-71375868 (-)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.600 查询 98.630 / 对象 45.000 |
TkA05G087110 | |
|
TkA05G087600
Chr05:23676324-23676914 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_037737
Chr09:19709876-19711379 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.400 查询 79.577 / 对象 74.615 |
TkA05G087600 | |
|
TkA05G088110
Chr05:23809976-23810951 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_015242
Chr03:66591725-66594277 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
93.000 查询 83.333 / 对象 43.071 |
TkA05G088110 | |
|
TkA05G088320
Chr05:23860282-23861029 (-)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_036892
Chr08:49873184-49873930 (+)
CM104806.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA05G088320 | |
|
TkA05G088840
Chr05:23994568-23995323 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019809
Chr04:40712007-40712384 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 49.801 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00231 | TkA05G088840 |
|
TkA05G089010
Chr05:24034968-24038876 (+)
GWHBCHF00000006
|
LXL04_019813
Chr04:40735610-40742836 (+)
CM104802.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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CM104800.1
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
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99.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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