ID 对照
本站保留 TK1151 与 OH-1004 的原始基因 ID,列出 TK1151 与 OH-1004 两个 Taraxacum kok-saghyz 参考基因组之间的基因级对应关系。二者是同一物种不同材料,不是同一品种的版本升级。完整收录的对照不代表所有关系都能一对一转换;复杂映射需按类别和证据复核。
版本来源
| 版本 | 组装/注释 accession | 来源数据库 | 论文 | DOI / PMID | 下载日期 |
|---|---|---|---|---|---|
| TK1151 Taraxacum kok-saghyz |
GWHBCHF00000000 GWHBCHF00000000 GFF/RNA/CDS/Protein |
NGDC Genome Warehouse (GWH) |
Extensive sequence divergence between the reference genomes of Taraxacum kok-saghyz and Taraxacum mongolicum Tao Lin, Xia Xu, Huilong Du, Xiuli Fan, Qingwen Chen, et al.; Science China Life Sciences; 2022 |
10.1007/s11427-021-2033-2 PMID: 34939160 |
2026-08-14 |
| OH-1004 / OSU_TarKok_2.0 Taraxacum kok-saghyz |
GCA_047496595.1 GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 GenBank GFF |
NCBI Assembly / NGDC integrated NCBI Assembly |
NCBI/NGDC 组装记录未关联发表论文(截至 2026-08-17) 未发现 |
未发现 | 2026-08-14 |
完整基因 ID 对照表
参考基因集:TK1151;45224 个基因;当前筛选 9108 条。当前显示第 36 / 92 页。
严格 1:1 需要同时满足双向最佳命中、高序列一致性、查询和对象覆盖度、CDS 支持和 JCVI 共线性;较可信 1:1 也必须是 RBH 且覆盖度达标。低覆盖、多源命中、注释拆分/合并和未定位序列不会进入 1:1 对照。蛋白与 CDS 覆盖度均按最高分单个比对片段的实际序列跨度除以对应代表序列长度计算;查询侧为 TK1151,对象侧为 OH-1004。本表不展示蛋白、CDS 或不同转录本。
| TK1151 基因 ID | OH-1004 基因 ID | 类别 | 关系 / 置信度 | 相似度 / 覆盖度 | 共线性区块 | 说明 |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
TkA03G445870
Chr03:111222784-111230153 (-)
GWHBCHF00000004
|
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.400 查询 95.702 / 对象 95.429 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G445870 |
|
TkA03G446170
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GWHBCHF00000004
|
LXL04_009538
Chr02:128442249-128443670 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 96.703 / 对象 52.853 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G446170 |
|
TkA03G446730
Chr03:111430594-111430935 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_035715
Chr08:27599849-27602198 (-)
CM104806.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
94.700 查询 100.000 / 对象 41.241 |
TkA03G446730 | |
|
TkA03G446750
Chr03:111433281-111433697 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_025168
Chr05:107057605-107059258 (-)
CM104803.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 99.275 / 对象 50.368 |
TkA03G446750 | |
|
TkA03G447670
Chr03:111678789-111679427 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_027592
Chr06:19677208-19682497 (+)
CM104804.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.700 查询 31.132 / 对象 16.296 |
TkA03G447670 | |
|
TkA03G448250
Chr03:111832691-111834542 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_004426
Chr01:135543707-135547213 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
96.300 查询 93.182 / 对象 50.076 |
TkA03G448250 | |
|
TkA03G448590
Chr03:111918369-111924410 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_037818
Chr09:22029978-22039809 (-)
CM104807.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
88.700 查询 71.141 / 对象 28.962 |
TkA03G448590 | |
|
TkA03G448600
Chr03:111925689-111928494 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009560
Chr02:129014254-129015710 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G448600 |
|
TkA03G448820
Chr03:111982229-111983275 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009565
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CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 100.000 / 对象 100.000 |
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|
TkA03G448840
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|
LXL04_009566
Chr02:129076423-129076833 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G448840 |
|
TkA03G449310
Chr03:112076429-112077663 (+)
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|
LXL04_009571
Chr02:129153380-129156513 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.200 查询 90.909 / 对象 46.555 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449310 |
|
TkA03G449410
Chr03:112094216-112095855 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009571
Chr02:129153380-129156513 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 45.065 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449410 |
|
TkA03G449470
Chr03:112107094-112108733 (+)
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|
LXL04_009571
Chr02:129153380-129156513 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.500 查询 100.000 / 对象 45.065 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449470 |
|
TkA03G449680
Chr03:112181982-112183170 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009578
Chr02:129211757-129226009 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
92.900 查询 94.949 / 对象 24.040 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449680 |
|
TkA03G449800
Chr03:112216712-112223522 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009584
Chr02:129258534-129263824 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 89.272 / 对象 19.177 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449800 |
|
TkA03G449890
Chr03:112239165-112246902 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009587
Chr02:129266370-129275972 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
98.700 查询 99.081 / 对象 65.809 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449890 |
|
TkA03G449900
Chr03:112249525-112259082 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009589
Chr02:129280301-129288553 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.800 查询 99.102 / 对象 97.653 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G449900 |
|
TkA03G450160
Chr03:112339262-112344473 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009593
Chr02:129364777-129369657 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 97.743 / 对象 53.933 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G450160 |
|
TkA03G450240
Chr03:112353473-112354437 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_016471
Chr03:124246186-124250876 (+)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
83.300 查询 99.115 / 对象 47.899 |
TkA03G450240 | |
|
TkA03G450420
Chr03:112407307-112408956 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009600
Chr02:129459905-129461968 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
95.400 查询 93.347 / 对象 67.103 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G450420 |
|
TkA03G451150
Chr03:112579694-112581256 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009609
Chr02:129645266-129646472 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 75.824 / 对象 76.384 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G451150 |
|
TkA03G451170
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|
LXL04_009610
Chr02:129648212-129650281 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.500 查询 95.588 / 对象 41.845 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G451170 |
|
TkA03G451230
Chr03:112600777-112606483 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009612
Chr02:129715116-129720700 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.900 查询 89.848 / 对象 47.705 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G451230 |
|
TkA03G451270
Chr03:112608456-112609594 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033814
Chr07:59036499-59041754 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
99.100 查询 93.886 / 对象 61.605 |
TkA03G451270 | |
|
TkA03G451950
Chr03:112775743-112778191 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009626
Chr02:129890302-129896621 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
100.000 查询 31.653 / 对象 10.396 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G451950 |
|
TkA03G452080
Chr03:112804147-112808724 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009628
Chr02:129933462-129942806 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.100 查询 99.759 / 对象 22.288 |
JCVI_TKOH_00146 | TkA03G452080 |
|
TkA03G452150
Chr03:112822375-112822890 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_002739
Chr01:56775400-56777320 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 25.758 |
TkA03G452150 | |
|
TkA03G452980
Chr03:113041867-113042529 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_005463
Chr01:164600239-164602488 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
100.000 查询 100.000 / 对象 29.372 |
JCVI_TKOH_00120 | TkA03G452980 |
|
TkA03G453210
Chr03:113110680-113111135 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_008518
Chr02:101700295-101700750 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.400 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G453210 | |
|
TkA03G454520
Chr03:113437345-113441374 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_034456
Chr07:101481529-101485947 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
97.000 查询 99.570 / 对象 90.440 |
JCVI_TKOH_00167 | TkA03G454520 |
|
TkA03G455120
Chr03:113585731-113587741 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_003934
Chr01:116229463-116239115 (+)
CM104799.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
66.700 查询 30.738 / 对象 25.424 |
TkA03G455120 | |
|
TkA03G455670
Chr03:113774184-113777883 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_034263
Chr07:93779572-93783118 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
95.700 查询 100.000 / 对象 100.000 |
TkA03G455670 | |
|
TkA03G455810
Chr03:113812521-113818096 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033396
Chr07:42702825-42707426 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
99.200 查询 100.000 / 对象 47.917 |
JCVI_TKOH_00168 | TkA03G455810 |
|
TkA03G456130
Chr03:113880478-113881206 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_014974
Chr03:60670393-60675007 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
56.500 查询 51.282 / 对象 34.199 |
TkA03G456130 | |
|
TkA03G456630
Chr03:114019427-114019789 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_002180
Chr01:43239841-43245200 (-)
CM104799.1
|
注释冲突 | 序列支持,但注释或基因模型存在冲突 需复核 |
98.000 查询 85.000 / 对象 42.678 |
TkA03G456630 | |
|
TkA03G457600
Chr03:114216894-114220304 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_006315
Chr02:6770777-6774474 (-)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
44.500 查询 62.632 / 对象 46.304 |
TkA03G457600 | |
|
TkA03G457680
Chr03:114247967-114249477 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033405
Chr07:43093944-43095470 (+)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
87.900 查询 98.228 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00168 | TkA03G457680 |
|
TkA03G457770
Chr03:114271267-114275614 (-)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_033406
Chr07:43119336-43123431 (-)
CM104805.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
60.200 查询 100.000 / 对象 100.000 |
JCVI_TKOH_00168 | TkA03G457770 |
|
TkA03G458030
Chr03:114346266-114350091 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_013407
Chr03:29099904-29101213 (-)
CM104801.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
41.500 查询 95.730 / 对象 89.527 |
TkA03G458030 | |
|
TkA03G458520
Chr03:114459386-114459688 (+)
GWHBCHF00000004
|
LXL04_009649
Chr02:130535972-130537291 (+)
CM104800.1
|
注释冲突 | 双向最佳命中,但覆盖度或共线性未达高可信阈值 需复核 |
97.600 查询 84.000 / 对象 66.667 |
JCVI_TKOH_00147 | TkA03G458520 |
|
TkA03G461160
Chr03:115125005-115126428 (+)
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|
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