基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_037940
当前版本: OH-1004
染色体: Chr09
坐标: 25850503-25860857
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA5628 bp · LXL04_037940|LXL04_037940|OH1004|cDNA
ATGTTGCAAATCATCTCCCTTCTATATGTGCTGGGTACAATCACATGCGTTGGGTCATCACTAAGCCATGATGAGGAATGCTCAGCCTTATTTCGGTTTAAGAAAAGCATGTTTTATCACGATGATGTTGCTTGTGCTGCCAGCTGGTTTCATACATTTGACTCTTGGAAACTCACAAACAACGAATCAAATGCTGATTTTGATTGTTGTTCGTGGAATGGTGTGGAATGCAGCAACAATGATGTGTACAGTCATGTGGT...
CDS
下载 CDS FASTA5628 bp · LXL04_037940|LXL04_037940|OH1004|CDS
ATGTTGCAAATCATCTCCCTTCTATATGTGCTGGGTACAATCACATGCGTTGGGTCATCACTAAGCCATGATGAGGAATGCTCAGCCTTATTTCGGTTTAAGAAAAGCATGTTTTATCACGATGATGTTGCTTGTGCTGCCAGCTGGTTTCATACATTTGACTCTTGGAAACTCACAAACAACGAATCAAATGCTGATTTTGATTGTTGTTCGTGGAATGGTGTGGAATGCAGCAACAATGATGTGTACAGTCATGTGGT...
1875 aa · LXL04_037940|LXL04_037940|OH1004|PROTEIN
MLQIISLLYVLGTITCVGSSLSHDEECSALFRFKKSMFYHDDVACAASWFHTFDSWKLTNNESNADFDCCSWNGVECSNNDVYSHVVGLDLSESFLCGHINSTSTLFSLVHLQNLNLAMNNFDESKIPSEITNLKQLRSLNLSDSRFTGQIPVEMSQLMQLSSLDLSWNPLKLQSPGGLQNMLQNLTRLEKLDLSGVDISSFVPHFLANFSCLRSIMLQNCSLQNKFPDTILALPNLKFLNVARNTNLTGSFPEFRNNNS...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_037940 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_037940 |
|---|---|
| 位置 | Chr09:25850503-25860857 (-) |
| 描述 | Similar to RLP6: Receptor-like protein 6 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007165 signal transduction 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G45616 ath:AT1G47890 ath:AT4G13920 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.823
内质网0.095
细胞质0.070
细胞外0.040
细胞核0.037
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF23598.2LRR_1489-290 aaPF25013.1LRR_Zer-1181-261 aaPF23598.2LRR_14207-338 aaPF13855.13LRR_8260-319 aaPF23598.2LRR_14279-482 aaPF13855.13LRR_8624-681 aaPF23211.1LRR_LRWD1816-899 aaPF13855.13LRR_8817-875 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_037940 | PF23598.2 | LRR_14 | 89 | 290 | 1.5e-63 | 215.4 |
| LXL04_037940 | PF25013.1 | LRR_Zer-1 | 181 | 261 | 4.4e-19 | 69.7 |
| LXL04_037940 | PF23598.2 | LRR_14 | 207 | 338 | 1.5e-63 | 215.4 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 260 | 319 | 6.2e-76 | 250.8 |
| LXL04_037940 | PF23598.2 | LRR_14 | 279 | 482 | 1.5e-63 | 215.4 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 624 | 681 | 6.2e-76 | 250.8 |
| LXL04_037940 | PF23211.1 | LRR_LRWD1 | 816 | 899 | 2.3e-09 | 37.9 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 817 | 875 | 6.2e-76 | 250.8 |
| LXL04_037940 | PF23598.2 | LRR_14 | 977 | 1126 | 1.5e-63 | 215.4 |
| LXL04_037940 | PF29594.1 | LRR_SKP2 | 987 | 1174 | 1.5e-10 | 41.5 |
| LXL04_037940 | PF23598.2 | LRR_14 | 1089 | 1217 | 1.5e-63 | 215.4 |
| LXL04_037940 | PF23598.2 | LRR_14 | 1168 | 1366 | 1.5e-63 | 215.4 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 1260 | 1318 | 6.2e-76 | 250.8 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 1301 | 1344 | 6.2e-76 | 250.8 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 1478 | 1538 | 6.2e-76 | 250.8 |
| LXL04_037940 | PF13855.13 | LRR_8 | 1504 | 1560 | 6.2e-76 | 250.8 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9C637 | 拟南芥 | Receptor-like protein 6 | 37.286% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9C699 | 拟南芥 | Receptor-like protein 7 | 36.983% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q93YT3 | 拟南芥 | Receptor-like protein 50 | 32.392% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9SRL2 | 拟南芥 | Receptor-like protein 34 | 35.325% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SVM3 | 拟南芥 | Receptor-like protein 49 | 38.523% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |