基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_029152
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 81952796-81954040
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1245 bp · LXL04_029152|LXL04_029152|OH1004|cDNA
ATGATGTTGTTGAATCTCCTTCCTTCGTCATCTGTCACTTTCCCAAAATCACACCATAAATTCCCCATTAATAATCCTTCGTTTTCTCATCCTACTATCGTCCCCAGAACCTCCATTTCTCCTCAATCGAAGTTCAAAGTCTTGGCCTTTAACAAAATCGACAGCAACCCCACTTCTCAGATCTATAATGCTAGCAAGTTTCTCAAGACCCCATATCTATTTGGAGATTTTGGGAGAAAACCCACTTCACAGATCGTCAA...
CDS
下载 CDS FASTA1245 bp · LXL04_029152|LXL04_029152|OH1004|CDS
ATGATGTTGTTGAATCTCCTTCCTTCGTCATCTGTCACTTTCCCAAAATCACACCATAAATTCCCCATTAATAATCCTTCGTTTTCTCATCCTACTATCGTCCCCAGAACCTCCATTTCTCCTCAATCGAAGTTCAAAGTCTTGGCCTTTAACAAAATCGACAGCAACCCCACTTCTCAGATCTATAATGCTAGCAAGTTTCTCAAGACCCCATATCTATTTGGAGATTTTGGGAGAAAACCCACTTCACAGATCGTCAA...
414 aa · LXL04_029152|LXL04_029152|OH1004|PROTEIN
MMLLNLLPSSSVTFPKSHHKFPINNPSFSHPTIVPRTSISPQSKFKVLAFNKIDSNPTSQIYNASKFLKTPYLFGDFGRKPTSQIVKSTSETSQDSTPDGELEKKPNKTLQLGIVFGFWYFQNIVFNIYNKKCLNIFPYPWLLASFQLFVGSLWMLFLWASKLQPCPKIDKSFIIALLGPALFHTVGHISACVSFSKVAVSFTHVIKSAEPVFSVVFSSALGDSYPISVWLSILPIVMGCSLAAVTEVSFNLGGLWGAMI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_029152 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_029152 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:81952796-81954040 (-) | |||||||||
| 描述 | Similar to XPT: Xylulose 5-phosphate/phosphate translocator, chloroplastic | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥水稻
| |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007033 vacuole organization 生物过程 GO:0009553 embryo sac development 生物过程 GO:0009624 response to nematode 生物过程 GO:0009643 photosynthetic acclimation 生物过程 GO:0009744 response to sucrose 生物过程 GO:0009749 response to glucose 生物过程 GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程 GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程 GO:0010152 pollen maturation 生物过程 GO:0015713 phosphoglycerate transmembrane transport 生物过程 GO:0015714 phosphoenolpyruvate transport 生物过程 GO:0015760 glucose-6-phosphate transport 生物过程 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G61800 ath:AT5G17630 ath:AT5G54800 dosa:Os08g0344600 dosa:Os09g0297400 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
质体0.968
内质网0.040
高尔基体0.034
过氧化物酶体0.029
线粒体0.018
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF03151.23TPT110-400 aaPF00892.27EamA131-243 aaPF00892.27EamA254-400 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_029152 | PF03151.23 | TPT | 110 | 400 | 1.5e-113 | 379.7 |
| LXL04_029152 | PF00892.27 | EamA | 131 | 243 | 4.5e-10 | 40.7 |
| LXL04_029152 | PF00892.27 | EamA | 254 | 400 | 4.5e-10 | 40.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LF61 | 拟南芥 | Xylulose 5-phosphate/phosphate translocator, chloroplastic | 71.605% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q9M5A9 | 拟南芥 | Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 1, chloroplastic | 55.161% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q94B38 | 拟南芥 | Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 2, chloroplastic | 53.746% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q84QU8 | 水稻 | Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 2, chloroplastic | 44.375% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q69VR7 | 水稻 | Phosphoenolpyruvate/phosphate translocator 1, chloroplastic | 45.364% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |