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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_015587
当前版本: OH-1004 染色体: Chr03 坐标: 76879897-76884579 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1920 bp · LXL04_015587|LXL04_015587|OH1004|cDNA

ATGTCTGTCCTAAAACAGTTCGAACACCTCAAAATACAACTAGAAGCTATAGAATCAGCAACCAACAAATTTGCTGAAGAGAGTTGCATCGGAAAAGGAGGCTTTGGGAAAGTATACAAGGGAGATCTCCTCCACTTGAATGGGCGTACCACGGTTGCTATAAAACGTTTAGATCGTTCATTTGGACAAAGAGATTCCGAGTTTTGGAAGGAGGTAATTATGCTTTCAGTTTACAGCCATGAAAATATCGTCTCCCTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1920 bp · LXL04_015587|LXL04_015587|OH1004|CDS

ATGTCTGTCCTAAAACAGTTCGAACACCTCAAAATACAACTAGAAGCTATAGAATCAGCAACCAACAAATTTGCTGAAGAGAGTTGCATCGGAAAAGGAGGCTTTGGGAAAGTATACAAGGGAGATCTCCTCCACTTGAATGGGCGTACCACGGTTGCTATAAAACGTTTAGATCGTTCATTTGGACAAAGAGATTCCGAGTTTTGGAAGGAGGTAATTATGCTTTCAGTTTACAGCCATGAAAATATCGTCTCCCTCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

639 aa · LXL04_015587|LXL04_015587|OH1004|PROTEIN

MSVLKQFEHLKIQLEAIESATNKFAEESCIGKGGFGKVYKGDLLHLNGRTTVAIKRLDRSFGQRDSEFWKEVIMLSVYSHENIVSLLGFCDEKDEKILVYEYSSRGSLDLHLDNKDLTWVRRLTICIGAARGLAYLHNPAGTQQRVLHRDIKSSNILLDENWNARISDLGLSKFGPANQNYTFLITNNRAGTIGYCDPQYVESGILTKESDVYSFGVVLFEVLCGRLCFRSNDKTQCFTQVARKHYKQKSLNEFIWGNIK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_015587
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_015587
位置Chr03:76879897-76884579 (+)
描述Similar to LUG: Transcriptional corepressor LEUNIG
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g32551 花分生组织发育早期阶段 C 类花同源异型基因 AGAMOUS 的 SEU-LUG 转录辅阻遏物的转录阻遏子亚基。
The rotunda2 mutants identify a role for the LEUNIG gene in vegetative leaf morphogenesis.2004 · DOI: 10.1093/jxb/erh165
At2g32700 可能作为转录共抑制复合体的亚基，抑制非生物胁迫相关基因的表达。
The Arabidopsis transcription factor LUH/MUM1 is required for extrusion of seed coat mucilage.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.172023
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献
At5g38990 可能的受体样蛋白激酶At5g38990。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015587 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001666 response to hypoxia 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006974 DNA damage response 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G32700
ath:AT3G46290
ath:AT4G32551
ath:AT5G38990
ath:AT5G39000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.529
排名 1 · LXL04_015587 · OH-1004
细胞核0.342
排名 2 · LXL04_015587 · OH-1004
细胞膜0.210
排名 3 · LXL04_015587 · OH-1004
溶酶体／液泡0.057
排名 4 · LXL04_015587 · OH-1004
内质网0.054
排名 5 · LXL04_015587 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase25-294 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr28-296 aa
PF25391.2WD40_Gbeta323-489 aa
PF24807.2WD40_CDC20-Fz325-402 aa
PF25174.2Beta-prop_THOC3332-411 aa
PF23381.2Beta-prop_IFT122_1st334-379 aa
PF23414.2Beta-prop_EML_2334-479 aa
PF24105.2Beta-prop_CAF1B_HIR1334-430 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_015587PF00069.32Pkinase252942.9e-43148.9
LXL04_015587PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr282961.4e-43149.8
LXL04_015587PF25391.2WD40_Gbeta3234891e-2178.0
LXL04_015587PF24807.2WD40_CDC20-Fz3254024.8e-29102.3
LXL04_015587PF25174.2Beta-prop_THOC33324111.8e-41142.6
LXL04_015587PF23381.2Beta-prop_IFT122_1st3343798.7e-40137.5
LXL04_015587PF23414.2Beta-prop_EML_23344797e-2485.3
LXL04_015587PF24105.2Beta-prop_CAF1B_HIR13344302e-1764.0
LXL04_015587PF24782.3WD40_MABP1-WDR62_2nd3355544.7e-1659.4
LXL04_015587PF25047.1Beta-prop_TEP1_2nd3363794.1e-2176.0
LXL04_015587PF25172.2Beta-prop_WDR3_2nd3415532.6e-2383.4
LXL04_015587PF25173.2Beta-prop_WDR3_1st3444742.1e-43148.9
LXL04_015587PF24817.2WD40_WDHD1_1st3514301.2e-33117.3
LXL04_015587PF25175.2Beta-prop_WDR53534902.9e-49168.7
LXL04_015587PF24814.2WD40_Prp193534856.3e-33114.7
LXL04_015587PF23409.2Beta-prop_EML3555341.2e-1248.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FUY2拟南芥Transcriptional corepressor LEUNIG67.155%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O48847拟南芥Transcriptional corepressor LEUNIG_HOMOLOG52.011%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FID8拟南芥Putative receptor-like protein kinase At5g3900042.442%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FID9拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g3899044.816%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 144.850%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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