LXL04_011595 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_011595

当前版本: OH-1004 染色体: Chr02 坐标: 167866778-167878637 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1656 bp · LXL04_011595|LXL04_011595|OH1004|cDNA

ATGATTAGTTGTGTAGCTCCTCCGCCGAGGTTACCCCAGCCGCCGGAAAGTCCGTTGGCGGTCCCAACGACTCCTGGGGAGAACATGGAGCTCATCCAGAACTGGGTGGAAACAAAGGTGGATAAAGAGAATCCGGTGAAGAAACGGACCATTAAGAAGGCCGCCGGGGAGTTAGCGATGGAGCTAAGGAACACCGCCGGAGCTGTGAGGAGGATGAGCGAAGACGACGCGAGGCGAGGTCCGAACAGGTCACATGCAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1656 bp · LXL04_011595|LXL04_011595|OH1004|CDS

ATGATTAGTTGTGTAGCTCCTCCGCCGAGGTTACCCCAGCCGCCGGAAAGTCCGTTGGCGGTCCCAACGACTCCTGGGGAGAACATGGAGCTCATCCAGAACTGGGTGGAAACAAAGGTGGATAAAGAGAATCCGGTGAAGAAACGGACCATTAAGAAGGCCGCCGGGGAGTTAGCGATGGAGCTAAGGAACACCGCCGGAGCTGTGAGGAGGATGAGCGAAGACGACGCGAGGCGAGGTCCGAACAGGTCACATGCAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

551 aa · LXL04_011595|LXL04_011595|OH1004|PROTEIN

MISCVAPPPRLPQPPESPLAVPTTPGENMELIQNWVETKVDKENPVKKRTIKKAAGELAMELRNTAGAVRRMSEDDARRGPNRSHAVPIATRAKTEPETAAIPALPMSVAVKSRLSRIIGMSGGAAKVETKQAKKEIHERWNARMAVNEPNVRRTVREPFGGKFVMFVYLINERTRTRFPVRLVKRTNTNNALVRLFMFVKVRIYVRSIMFVHICSFTFHVRGIQLFNNKFSGSIPPTFSSCTVLQNLDFGNNSLVGEIP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_011595`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_011595

位置 Chr02:167866778-167878637 (+)

描述 Similar to ACX3: Acyl-coenzyme A oxidase 3, peroxisomal

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g06290`	催化中链酰基辅酶A脱饱和，生成2-反式烯酰辅酶A。	暂无已核实直接文献
`At3g51740`	可能不活跃的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 IMK2。	暂无已核实直接文献
`At1g06310`	催化酰基辅酶A向 2-反式-烯酰辅酶A的脱氢反应。	暂无已核实直接文献
`At3g56100`	能磷酸化 AGL24。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0225300`	可能通过油菜素甾醇（BR）信号通路参与植物生长调控。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_011595 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006635 fatty acid beta-oxidation 生物过程

GO:0033540 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA oxidase 生物过程

GO:0051791 medium-chain fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0003997 acyl-CoA oxidase activity 分子功能

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0005504 fatty acid binding 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G06290

ath:AT3G51740

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.314

排名 1 · LXL04_011595 · OH-1004

细胞质0.309

排名 2 · LXL04_011595 · OH-1004

细胞膜0.275

排名 3 · LXL04_011595 · OH-1004

线粒体0.106

排名 4 · LXL04_011595 · OH-1004

内质网0.091

排名 5 · LXL04_011595 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`P0CZ23`	拟南芥	Acyl-coenzyme A oxidase 3, peroxisomal	83.333%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9SCT4`	拟南芥	Probably inactive leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK2	48.515%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9LMI7`	拟南芥	Putative acyl-coenzyme A oxidase 3.2, peroxisomal	75.926%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`C0LGP9`	拟南芥	Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase IMK3	49.462%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q67X31`	水稻	LRR receptor kinase SERK2	39.773%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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