基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_011387
当前版本: OH-1004
染色体: Chr02
坐标: 163643180-163647136
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1713 bp · LXL04_011387|LXL04_011387|OH1004|cDNA
ATGGCATCAATTACTAGTGAACACGGATATGATCGTCTAAAACAAGTGAAACAATTCGATGAATCAAAAATTGGTGTAAAGGGATTAGTAGACTCTGGAATCACCACCATCCCCACCTTCTTCCACCAACCACCGGAGAATCTCCCTGGTCCAAAACCTAAAAACCAACCAAATGTAACCGTGCCTGTCATTGATTTATCCAAGGAAAGATCAATTGTTGTTGAAGAAATTCAACGATCAGCTTCCACATTAGGGTTTTT...
CDS
下载 CDS FASTA1713 bp · LXL04_011387|LXL04_011387|OH1004|CDS
ATGGCATCAATTACTAGTGAACACGGATATGATCGTCTAAAACAAGTGAAACAATTCGATGAATCAAAAATTGGTGTAAAGGGATTAGTAGACTCTGGAATCACCACCATCCCCACCTTCTTCCACCAACCACCGGAGAATCTCCCTGGTCCAAAACCTAAAAACCAACCAAATGTAACCGTGCCTGTCATTGATTTATCCAAGGAAAGATCAATTGTTGTTGAAGAAATTCAACGATCAGCTTCCACATTAGGGTTTTT...
570 aa · LXL04_011387|LXL04_011387|OH1004|PROTEIN
MASITSEHGYDRLKQVKQFDESKIGVKGLVDSGITTIPTFFHQPPENLPGPKPKNQPNVTVPVIDLSKERSIVVEEIQRSASTLGFFQIVNHSIPITLIDAVLNGLKSFFEQPTEYKMQFYHRDIEKGAAYSTNFDLYQSNAASWRDTLQVRMAPMEPAWEIVPEMCTAELADWDKAVAELGEELMSILCEGLGVKSDRKMRTRAKELLTSSLQLLVVEMVLPISRFPSISIPAIICLLEMENSRNYLDIEATSSFNASL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_011387 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_011387 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr02:163643180-163647136 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to ASY1: Meiosis-specific protein ASY1 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0007129 homologous chromosome pairing at meiosis 生物过程 GO:0007130 synaptonemal complex assembly 生物过程 GO:0009554 megasporogenesis 生物过程 GO:0009556 microsporogenesis 生物过程 GO:0009620 response to fungus 生物过程 GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0010439 regulation of glucosinolate biosynthetic process 生物过程 GO:0019761 glucosinolate biosynthetic process 生物过程 GO:0051026 chiasma assembly 生物过程 GO:0051598 meiotic recombination checkpoint signaling 生物过程 GO:0000228 nuclear chromosome 细胞组分 GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G06620 ath:AT1G06650 ath:AT1G67370 ath:AT2G25450 dosa:Os09g0506800 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.739
细胞质0.304
细胞膜0.037
线粒体0.036
内质网0.025
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF14226.13DIOX_N61-155 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_011387 | PF14226.13 | DIOX_N | 61 | 155 | 3.3e-17 | 63.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
F4HRV8 | 拟南芥 | Meiosis-specific protein ASY1 | 47.112% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q84MB3 | 拟南芥 | 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 1 | 42.564% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q9SKK4 | 拟南芥 | Probable 2-oxoacid dependent dioxygenase | 41.327% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q8H1S4 | 拟南芥 | 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase homolog 3 | 39.000% | Swiss-Prot | 低置信数据库同源证据 |
Q76CY8 | 水稻 | Meiosis-specific protein PAIR2 | 39.528% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |