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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_005976
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 176545144-176546962 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1404 bp · LXL04_005976|LXL04_005976|OH1004|cDNA

ATGGATGCAGGAAATCTTCCCGCTGAATCATCTTCTCTTTCCCATGGAAAGCATCGCAGGAGGAATTCTCGTGATGAAAATTTGGACCGTTTCATCCCAAATCGCGCCGCAATGGATTTCGACTTTGCAAACTACATGCTTACCGGAAAGAAAGCTGCAAACAAAAGTACCTCACCATGTTCACCTGGTAAAGAATCCTACCGGAAGCAGCTGGCAGAAATCTTCAACATGAACAGGACACGAATCCTTACATTCAAAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1404 bp · LXL04_005976|LXL04_005976|OH1004|CDS

ATGGATGCAGGAAATCTTCCCGCTGAATCATCTTCTCTTTCCCATGGAAAGCATCGCAGGAGGAATTCTCGTGATGAAAATTTGGACCGTTTCATCCCAAATCGCGCCGCAATGGATTTCGACTTTGCAAACTACATGCTTACCGGAAAGAAAGCTGCAAACAAAAGTACCTCACCATGTTCACCTGGTAAAGAATCCTACCGGAAGCAGCTGGCAGAAATCTTCAACATGAACAGGACACGAATCCTTACATTCAAAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

467 aa · LXL04_005976|LXL04_005976|OH1004|PROTEIN

MDAGNLPAESSSLSHGKHRRRNSRDENLDRFIPNRAAMDFDFANYMLTGKKAANKSTSPCSPGKESYRKQLAEIFNMNRTRILTFKNKPPPSLNTLNNTTPLSPKFKPTKRTRHISQVSLLSSYINLNNQHKQGTDSLRPQQSSERTLDAPEIIDDYYLNLVDWGATNTLAIALGNSVYLWNAFDGSTSELLSTDDDTGPVTSVKWAPDGRHIAVGFNNSEVQLWDASINRLMRTLREGHGGRVGSLDWTNHILTTGSMD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_005976
TK1151 IDTkA01G003460
OH-1004 IDLXL04_005976
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 92.077
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_005976
位置Chr01:176545144-176546962 (-)
描述Similar to CDC20-1: Cell division cycle 20.1, cofactor of APC complex
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g33270 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At4g33260 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At5g27570 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At5g26900 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献
At5g27080 后期促进复合物/环体 (APC/C) 的组成部分，这是一种细胞周期调节的 E3 泛素-蛋白连接酶复合物，可控制细胞周期有丝分裂和 G1 期的进展。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005976 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031145 anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:1905786 positive regulation of anaphase-promoting complex-dependent catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005680 anaphase-promoting complex 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0033597 mitotic checkpoint complex 细胞组分
GO:0080008 Cul4-RING E3 ubiquitin ligase complex 细胞组分
GO:0010997 anaphase-promoting complex binding 分子功能
GO:0019900 kinase binding 分子功能
GO:1990757 ubiquitin ligase activator activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G33260
ath:AT4G33270
ath:AT5G26900
ath:AT5G27080
ath:AT5G27570
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.582
排名 1 · LXL04_005976 · OH-1004
细胞质0.398
排名 2 · LXL04_005976 · OH-1004
溶酶体／液泡0.046
排名 3 · LXL04_005976 · OH-1004
细胞膜0.040
排名 4 · LXL04_005976 · OH-1004
线粒体0.027
排名 5 · LXL04_005976 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24807.2WD40_CDC20-Fz148-439 aa
PF24817.2WD40_WDHD1_1st159-251 aa
PF23389.2Beta-prop_WDR19_1st168-263 aa
PF23381.2Beta-prop_IFT122_1st169-269 aa
PF25173.2Beta-prop_WDR3_1st170-269 aa
PF25175.2Beta-prop_WDR5177-237 aa
PF25171.2Beta-prop_WDR36-Utp21_1st177-309 aa
PF24796.2WDR55178-440 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_005976PF24807.2WD40_CDC20-Fz1484393.5e-121404.7
LXL04_005976PF24817.2WD40_WDHD1_1st1592512.4e-2590.0
LXL04_005976PF23389.2Beta-prop_WDR19_1st1682635.4e-1142.8
LXL04_005976PF23381.2Beta-prop_IFT122_1st1692699.9e-37127.5
LXL04_005976PF25173.2Beta-prop_WDR3_1st1702693e-39135.4
LXL04_005976PF25175.2Beta-prop_WDR51772373.1e-34119.3
LXL04_005976PF25171.2Beta-prop_WDR36-Utp21_1st1773094.3e-1556.6
LXL04_005976PF24796.2WDR551784406.4e-1349.1
LXL04_005976PF24814.2WD40_Prp191802491.3e-31110.4
LXL04_005976PF25391.2WD40_Gbeta1803558.7e-1452.0
LXL04_005976PF23414.2Beta-prop_EML_21862707e-2175.5
LXL04_005976PF25047.1Beta-prop_TEP1_2nd1873111.6e-1764.2
LXL04_005976PF12894.14ANAPC4_WD401932515e-1659.4
LXL04_005976PF24782.3WD40_MABP1-WDR62_2nd1934406.3e-1039.2
LXL04_005976PF23410.5Beta-prop_VPS81942411.3e-0731.7
LXL04_005976PF00400.39WD401982263.2e-30104.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZA4拟南芥Cell division cycle 20.1, cofactor of APC complex60.088%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9S7I8拟南芥Cell division cycle 20.2, cofactor of APC complex60.394%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q3E906拟南芥Cell division cycle 20.5, cofactor of APC complex56.360%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q4PSE4拟南芥Cell division cycle 20.4, cofactor of APC complex57.737%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9S7H3拟南芥Cell division cycle 20.3, cofactor of APC complex57.176%Swiss-Prot强数据库同源证据

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