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基因概览

LXL04_000842

当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 15566946-15569530 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

678 bp · LXL04_000842|LXL04_000842|OH1004|cDNA

ATGGGGAAATACATGAGGAAAGCTAATTTAACCGGAGACATGGTGGCCGTAATGGATGTTTCGCAGTCGTCTCTCGGCGTCCGAACGCGAGCCAAAACCCTAGCGTTGCAGAAACTTCGAGCCACGAAATCAACCGCCACACCGCCAGAGTCGCCAGCGGCGGAAAAACACAGTGAATTGTCGTATCTCCAGCTACGCAGCCGTCGGCTAGAGAAACCAACGTTTCAACAACTAACATGCTGCCGGCAacaaaaccctaa...

CDS

下载 CDS FASTA

678 bp · LXL04_000842|LXL04_000842|OH1004|CDS

ATGGGGAAATACATGAGGAAAGCTAATTTAACCGGAGACATGGTGGCCGTAATGGATGTTTCGCAGTCGTCTCTCGGCGTCCGAACGCGAGCCAAAACCCTAGCGTTGCAGAAACTTCGAGCCACGAAATCAACCGCCACACCGCCAGAGTCGCCAGCGGCGGAAAAACACAGTGAATTGTCGTATCTCCAGCTACGCAGCCGTCGGCTAGAGAAACCAACGTTTCAACAACTAACATGCTGCCGGCAACAAAACCCTAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

225 aa · LXL04_000842|LXL04_000842|OH1004|PROTEIN

MGKYMRKANLTGDMVAVMDVSQSSLGVRTRAKTLALQKLRATKSTATPPESPAAEKHSELSYLQLRSRRLEKPTFQQLTCCRQQNPNPNPMISSGVSGSVGSGSLDTEFKAGEETEESCYFGENNIDFDGRERSTRESTPCSLRNDTYDIYAHGSSSSTRSMNLEPSRTSRNLITKNMPFTQEIEEFFARHDQEQQRRFADKYNFDIAKEKPIGGRYEWVQVQSQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_000842`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_000842

位置 Chr01:15566946-15569530 (-)

描述 Similar to KRP3: Cyclin-dependent kinase inhibitor 3

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g48820`	结合并抑制CYCD2-1/CDKA-1复合激酶的活性。	暂无已核实直接文献
`At3g24810`	抑制 CYCD2-1/CDKA-1 复合物激酶活性，但不与复合物相互作用。	暂无已核实直接文献
`At2g32710`	结合并抑制CYCD2-1/CDKA-1复合激酶的活性。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os03g0137800`	细胞周期蛋白dependent kinase inhibitor 5。	暂无已核实直接文献
`Os10g0471700`	细胞周期蛋白dependent kinase inhibitor 4。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000842 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0032877 positive regulation of DNA endoreduplication 生物过程

GO:0045740 positive regulation of DNA replication 生物过程

GO:0045786 negative regulation of cell cycle 生物过程

GO:0051726 regulation of cell cycle 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0004861 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase inhibitor activity 分子功能

GO:0031490 chromatin DNA binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G32710

ath:AT3G24810

ath:AT5G48820

dosa:Os03g0137800

dosa:Os10g0471700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.932

排名 1 · LXL04_000842 · OH-1004

细胞质0.145

排名 2 · LXL04_000842 · OH-1004

细胞膜0.033

排名 3 · LXL04_000842 · OH-1004

内质网0.018

排名 4 · LXL04_000842 · OH-1004

质体0.015

排名 5 · LXL04_000842 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02234.25CDI179-222 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_000842	`PF02234.25`	CDI	179	222	1.2e-16	61.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FKB5`	拟南芥	Cyclin-dependent kinase inhibitor 3	42.798%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LRY0`	拟南芥	Cyclin-dependent kinase inhibitor 5	34.468%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q8GYJ3`	拟南芥	Cyclin-dependent kinase inhibitor 4	32.180%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q283L0`	水稻	Cyclin-dependent kinase inhibitor 5	37.719%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q7XDH8`	水稻	Cyclin-dependent kinase inhibitor 4	32.301%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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