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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_000365
当前版本: OH-1004 染色体: Chr01 坐标: 6693250-6697874 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1806 bp · LXL04_000365|LXL04_000365|OH1004|cDNA

ATGGGTATCTTCTTGGTTTTCTACCCTGAAGAACAGCAATTCAATTCTTCAACACCTTCATCAACATCTTCATTATCGCCATTTAAATCTCCCAAAATTAACGCGTTTCTCAAACGCACCAATTCCAGTCATATTTTCACCAGAGCTCAATCCACCATCTCCATTTGTGCTCTGCTCATCTTCCTCACTTTCCTCCTCTTCACTCTCTCATCCTTCGAGCCCAACAATGATTTCATCACCTCTCATAATCTTCATCATTA...

CDS

下载 CDS FASTA

1806 bp · LXL04_000365|LXL04_000365|OH1004|CDS

ATGGGTATCTTCTTGGTTTTCTACCCTGAAGAACAGCAATTCAATTCTTCAACACCTTCATCAACATCTTCATTATCGCCATTTAAATCTCCCAAAATTAACGCGTTTCTCAAACGCACCAATTCCAGTCATATTTTCACCAGAGCTCAATCCACCATCTCCATTTGTGCTCTGCTCATCTTCCTCACTTTCCTCCTCTTCACTCTCTCATCCTTCGAGCCCAACAATGATTTCATCACCTCTCATAATCTTCATCATTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

601 aa · LXL04_000365|LXL04_000365|OH1004|PROTEIN

MGIFLVFYPEEQQFNSSTPSSTSSLSPFKSPKINAFLKRTNSSHIFTRAQSTISICALLIFLTFLLFTLSSFEPNNDFITSHNLHHYRRFLSQNHPKFHPKPRWNPPALQGLGTLYTRGTMAMNELVICHVSESVTKKELKLFLRGFHRSGLASKSDLLFVFNSISTIDSFNDLIMEENDLFLKLVHRYKSELGNGSKAIDFPASFDVTRFVKSGKEADKGEPIWGRKIKSSNSSFSNGENGTESTRMSYGSVVGFGISE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_000365
TK1151 IDTkA01G617350
OH-1004 IDLXL04_000365
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.323 / OH-1004 71.880
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_000365
位置Chr01:6693250-6697874 (+)
描述Similar to CSLD5: Cellulose synthase-like protein D5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g02730 参与茎和根的生长。
Disruption of ATCSLD5 results in reduced growth, reduced xylan and homogalacturonan synthase activity and altered xylan occurrence in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03281.x
At3g03050 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。
AtCSLD3, a cellulose synthase-like gene important for root hair growth in arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.126.2.575
At5g16910 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0555600 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
Os06g0111800 被认为是定位于高尔基体的β-聚糖合酶，催化植物细胞壁非纤维素多糖（半纤维素）主链的聚合。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_000365 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000919 cell plate assembly 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009625 response to insect 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009833 plant-type primary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0030244 cellulose biosynthetic process 生物过程
GO:0042546 cell wall biogenesis 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0048767 root hair elongation 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02730
ath:AT3G03050
ath:AT5G16910
dosa:Os06g0111800
dosa:Os12g0555600
osa:4339895
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.567
排名 1 · LXL04_000365 · OH-1004
内质网0.170
排名 2 · LXL04_000365 · OH-1004
细胞膜0.107
排名 3 · LXL04_000365 · OH-1004
细胞核0.102
排名 4 · LXL04_000365 · OH-1004
细胞外0.072
排名 5 · LXL04_000365 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF25002.2DUF7780107-410 aa
PF03552.21Cellulose_synt456-540 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_000365PF25002.2DUF77801074101.9e-134448.3
LXL04_000365PF03552.21Cellulose_synt4565409.3e-1141.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SRW9拟南芥Cellulose synthase-like protein D555.682%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9M9M4拟南芥Cellulose synthase-like protein D347.619%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LFL0拟南芥Cellulose synthase-like protein D248.148%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q2QNS6水稻Cellulose synthase-like protein D450.588%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LHZ7水稻Cellulose synthase-like protein D245.000%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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