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基因概览

TkAUNG095800

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 27072846-27075743 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2485 bp · TkAUNG095800|TK1151|cDNA

GTTTATAAGTTAGCGTTTCAGCTAACTTTTTGGTTTACCAAACACGACAACTCAAAAAAACTCGAAAAACAAGCTAACTGTGGCGCGTCAAACACGAGATATACCACATAATTGACTTACTAAAATGGAAACGATGCCGTTTCAGTTACATGGAAATTAAAATCCTACAAATTCAATAACGTTAGCCTTATATAAACCGGGTTCGGAGCAGTTTCGGGTTTGTCTTTCACACATCCCAGCGGGCTGCGGGTGCGAGGGCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1854 bp · TkAUNG095800|TK1151|CDS

ATGGCGGCCTCTCTCTCCTCTATCTCCGCCCTTCGCATCAAACTTCATAGACATTCCTTCAATACCAGGCTTATTGCTTCCTCGTCTTCAAACCCCCAACAGTTCTTCATTATTTCACCCCATCTTCCCCCAAAACGCCGTTTCATTAGGCCTTTCTCCCTCAAGTTATCAAGAAGTTTCTCAATTAACCCCGTATTCAATGATGATAAGAAGAACAGTAACCCTAGCTTTCACCATTTCATCGCTCAAGCTCAAGCGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

617 aa · TkAUNG095800|TK1151|PROTEIN

MAASLSSISALRIKLHRHSFNTRLIASSSSNPQQFFIISPHLPPKRRFIRPFSLKLSRSFSINPVFNDDKKNSNPSFHHFIAQAQATALTASDATQADDVPSSEVLPRGRIYQETYGCQMNVNDMEIVLSVMKKAGYDEIVNDPESAEIIFINTCAIRDNAEQRVWQRLNYFWFLKRHWKSNVATGRSHSLHPPKVVVLGCMAERLKDKILDSDKMVDVVCGPDAYRDLPRLLAEVENGQKGINTLLSLEETYADISPVR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG095800`
TK1151 ID	TkAUNG095800
OH-1004 ID	LXL04_024624
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG095800

位置 ChrUn:27072846-27075743 (-)

描述 Similar to At4g36390: CDK5RAP1-like protein

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g36390`	可能调节CDK5活性的潜在调控因子。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os11g0592800`	可能调节CDK5活性的潜在调控因子。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_024624 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000079 regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 生物过程

GO:0009451 RNA modification 生物过程

GO:0045736 negative regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 生物过程

GO:0045737 positive regulation of cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 生物过程

GO:0045786 negative regulation of cell cycle 生物过程

GO:0045903 positive regulation of translational fidelity 生物过程

GO:0060255 regulation of macromolecule metabolic process 生物过程

GO:0070131 positive regulation of mitochondrial translation 生物过程

GO:0070900 mitochondrial tRNA modification 生物过程

GO:0080090 regulation of primary metabolic process 生物过程

GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT4G36390

dosa:Os11g0592800

hsa:51654

mmu:66971

rno:252827

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.765

排名 1 · TkAUNG095800 · TK1151

线粒体0.257

排名 2 · TkAUNG095800 · TK1151

细胞核0.043

排名 3 · TkAUNG095800 · TK1151

细胞质0.033

排名 4 · TkAUNG095800 · TK1151

细胞膜0.009

排名 5 · TkAUNG095800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00919UPF0004110-222 aa

PF04055Radical_SAM123-144 aa

PF21911PG_1098_N240-261 aa

PF04055Radical_SAM270-464 aa

PF13353Fer4_12273-319 aa

PF01938TRAM520-594 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG095800	`PF00919`	UPF0004	110	222	4.2e-25	88.3
TkAUNG095800	`PF04055`	Radical_SAM	123	144	5e-26	92.6
TkAUNG095800	`PF21911`	PG_1098_N	240	261	0.14	12.3
TkAUNG095800	`PF04055`	Radical_SAM	270	464	5e-26	92.6
TkAUNG095800	`PF13353`	Fer4_12	273	319	0.24	12.5
TkAUNG095800	`PF01938`	TRAM	520	594	1.2e-07	32.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8H0V1`	拟南芥	sp\|Q8H0V1\|CK5P1_ARATH CDK5RAP1-like protein	71.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q2R1U4`	水稻	sp\|Q2R1U4\|CK5P1_ORYSJ CDK5RAP1-like protein	74.300%	Swiss-Prot	高置信

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