TkAUNG081120 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG081120

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 23111653-23113589 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1693 bp · TkAUNG081120|TK1151|cDNA

GCATTTTATCTTTCTATCAACAAATCAATAACTGATGGACTTGAAACAACTAGCATTTATCATCATCTTTGTAGTTCTCGTATCTAGAATTATATCTTTATGGTTTGCCAAAATTTCCTTACAAACAGTTGGTAAACTTCCCCCAGGACCACCAAGGTGGCCTATTGTTGGTAATCTCCTCCAATTAGGGTCGTTGCCTCATAGAGATTTGGCTGCATTTTGTGAAAAATATGGACCATTGGTCTACCTTCGTCTTGGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1557 bp · TkAUNG081120|TK1151|CDS

ATGGACTTGAAACAACTAGCATTTATCATCATCTTTGTAGTTCTCGTATCTAGAATTATATCTTTATGGTTTGCCAAAATTTCCTTACAAACAGTTGGTAAACTTCCCCCAGGACCACCAAGGTGGCCTATTGTTGGTAATCTCCTCCAATTAGGGTCGTTGCCTCATAGAGATTTGGCTGCATTTTGTGAAAAATATGGACCATTGGTCTACCTTCGTCTTGGAAAAGTCGACGCCATCACCACCAATGACCCTAAGAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

518 aa · TkAUNG081120|TK1151|PROTEIN

MDLKQLAFIIIFVVLVSRIISLWFAKISLQTVGKLPPGPPRWPIVGNLLQLGSLPHRDLAAFCEKYGPLVYLRLGKVDAITTNDPKIIREILLQQDDVFASRPQTLAAVHLAYNCGDVALAPFGPRWKWMRRICMEQLLTTKRLESFAKQRESEAQHLVQDVWALTQTKGPINLREVLGAFSMNNVTRMLLGKQYFGSGSAGPKEALEFMHITHELFWLLGLIYLGDYLPFWRWIDPYGCEKKMREVEKRVDDFHMKIIE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG081120`
TK1151 ID	TkAUNG081120
OH-1004 ID	LXL04_026641
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG081120

位置 ChrUn:23111653-23113589 (+)

描述 Similar to CYP703A3: Cytochrome P450 703A2

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g01280`	参与花粉壁发育。	CYP703 is an ancient cytochrome P450 in land plants catalyzing in-chain hydroxylation of lauric acid to provide building blocks for sporopollenin synthesis in pollen.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.045948

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os08g0131100`	参与花粉外壁和花药表皮层发育。	Rice CYP703A3, a cytochrome P450 hydroxylase, is essential for development of anther cuticle and pollen exine.2014 · DOI: 10.1111/jipb.12212

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_026641 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0002933 lipid hydroxylation 生物过程

GO:0009411 response to UV 生物过程

GO:0009555 pollen development 生物过程

GO:0009733 response to auxin 生物过程

GO:0009813 flavonoid biosynthetic process 生物过程

GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程

GO:0010584 pollen exine formation 生物过程

GO:0048653 anther development 生物过程

GO:0051791 medium-chain fatty acid metabolic process 生物过程

GO:0051792 medium-chain fatty acid biosynthetic process 生物过程

GO:0080027 response to herbivore 生物过程

GO:0080110 sporopollenin biosynthetic process 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G01280

ath:AT5G07990

dosa:Os08g0131100

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.925

排名 1 · TkAUNG081120 · TK1151

细胞膜0.039

排名 2 · TkAUNG081120 · TK1151

细胞质0.034

排名 3 · TkAUNG081120 · TK1151

质体0.028

排名 4 · TkAUNG081120 · TK1151

高尔基体0.023

排名 5 · TkAUNG081120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00067p45036-499 aa

PF14198TnpV130-169 aa

PF14198TnpV242-280 aa

PF14198TnpV298-346 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG081120	`PF00067`	p450	36	499	2e-93	314.4
TkAUNG081120	`PF14198`	TnpV	130	169	9.8	7.1
TkAUNG081120	`PF14198`	TnpV	242	280	9.8	7.1
TkAUNG081120	`PF14198`	TnpV	298	346	9.8	7.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LNJ4`	拟南芥	sp\|Q9LNJ4\|C70A2_ARATH Cytochrome P450 703A2	76.400%	Swiss-Prot	高置信
`Q7EZR4`	水稻	sp\|Q7EZR4\|C70A3_ORYSJ Cytochrome P450 703A2	75.900%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情