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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG075450
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 21727679-21739565 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

3487 bp · TkAUNG075450|TK1151|cDNA

TTTGCTCGAATACTACACTATTACAAACACGTCACCCTCACACTTTTCCTCTTTTTAGTCAGGTTTGTTACTGCTTGTCTTGGTGTCTATTCTATACCCGTGAGCTCATCAGCCCGCATCAGACAGGTATCACCGACGACAACGTTTCCTGCCTTCTTTCCACCGAGTAATTTCTCGTTTTTTCTTTCTGGAATACGTAAGTGATTCGTGTATAAGAAGGCGTACATTTTGAGAGATCGGTAGAGATGGCGGAGAGAAAG...

3195 bp · TkAUNG075450|TK1151|CDS

ATGGCGGAGAGAAAGGAGAAGGATGACGTGGACAGGAAGATCACGATTGGCGTTTGCGTTATGGAAAAGAAGGTGAAATGCGGCCTGGAGGTTTTCTCGGCGCCTATGGGGCAAATTCTGGAAAGGTTGCAAGCTTTTGGTGAATTTGAGATCATCCATTTCGGGGACAGAGTTATCCTAGAGGAACCTGTAGAGAGGTGGCCAATATGTGATTGTTTGATTGCTTTCCATTCTTCTGGGTATCCACTTGAAAAAGCTGA...

1064 aa · TkAUNG075450|TK1151|PROTEIN

MAERKEKDDVDRKITIGVCVMEKKVKCGLEVFSAPMGQILERLQAFGEFEIIHFGDRVILEEPVERWPICDCLIAFHSSGYPLEKAEAYAALRKPFLVNELEQQHLLHDRRKVYECLESFGIPVPRYALVNREKPYQDLDYFVEEEDFVEVHGQRFGKPFVEKPIHGDDHSIMIYYPSSAGGGMKELFRKVGNRSSEFHPEVRRVRRESSYIYEEFMPTGGTDVKVYTVGPEYAHAEARKSPVVDGVVMRNPDGKEVRYP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG075450
TK1151 IDTkAUNG075450
OH-1004 IDLXL04_006217
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG075450
位置ChrUn:21727679-21739565 (+)
描述Similar to VIP2: Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase VIP2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g15070 双功能肌醇激酶,与IP6K激酶协同作用合成含二磷酸基团的肌醇焦磷酸盐:二磷酸肌醇五磷酸(PP-InsP5)和双二磷酸肌醇四磷酸((PP)2-InsP4)。 暂无已核实直接文献
At3g01310 双功能肌醇激酶,与 IP6K 激酶协同作用,合成含有二磷酸基团的肌醇焦磷酸二磷酸肌醇五磷酸 和双二磷酸肌醇四磷酸 2-InsP4。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_006217 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006020 inositol metabolic process 生物过程
GO:0009861 jasmonic acid and ethylene-dependent systemic resistance 生物过程
GO:0032958 inositol phosphate biosynthetic process 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:1900367 positive regulation of defense response to insect 生物过程
GO:1904966 positive regulation of vitamin E biosynthetic process 生物过程
GO:1905036 positive regulation of antifungal innate immune response 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0000827 inositol-1,3,4,5,6-pentakisphosphate kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G01310
ath:AT5G15070
dme:Dmel_CG14616
mmu:227399
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.542
排名 1 · TkAUNG075450 · TK1151
细胞核0.309
排名 2 · TkAUNG075450 · TK1151
细胞膜0.181
排名 3 · TkAUNG075450 · TK1151
线粒体0.114
排名 4 · TkAUNG075450 · TK1151
内质网0.076
排名 5 · TkAUNG075450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18086PPIP5K2_N14-109 aa
PF08443RimK246-308 aa
PF00328His_Phos_2369-952 aa
PF01114Colipase790-820 aa
PF13299CPSF100_C802-912 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG075450PF18086PPIP5K2_N141091.9e-36124.8
TkAUNG075450PF08443RimK2463080.02514.9
TkAUNG075450PF00328His_Phos_23699526.4e-72243.6
TkAUNG075450PF01114Colipase7908200.212.1
TkAUNG075450PF13299CPSF100_C8029120.003318.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84WW3拟南芥sp|Q84WW3|VIP2L_ARATH Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase VIP281.600%Swiss-Prot高置信
F4J8C6拟南芥sp|F4J8C6|VIP1L_ARATH Inositol hexakisphosphate and diphosphoinositol-pentakisphosphate kinase VIP182.400%Swiss-Prot高置信

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