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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG072650
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 20976148-20977855 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1520 bp · TkAUNG072650|TK1151|cDNA

CTCAATCACCATGGCCAACCAGTTCTATTCGGCTGTGGATTGCTTCATTACGAGTCTGATTCTGCTTACATCTGGCTACTCCAAAATTGGCTCCACGCCATGTCCGAAAACCACCCAGTCTCCATCACAACCGAACCCAATCACCATATCCAGATGGCTGTTTCACAGGTTTTGCCTCAAACCCGCCATAGATTCTGTAAATGGAGCATCCTCAGAGAAACCCAACAGAAACTCTCTCATATTTATCAAACACATCATCC...

CDS

下载 CDS FASTA

804 bp · TkAUNG072650|TK1151|CDS

CTCAATCACCATGGCCAACCAGTTCTATTCGGCTGTGGATTGCTTCATTACGAGTCTGATTCTGCTTACATCTGGCTACTCCAAAATTGGCTCCACGCCATGTCCGAAAACCACCCAGTCTCCATCACAACCGAACCCAATCACCATATCCAGATGGCTGTTTCACAGGTTTTGCCTCAAACCCGCCATAGATTCTGTAAATGGAGCATCCTCAGAGAAACCCAACAGAAACTCTCTCATATTTATCAAACACATCATCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

267 aa · TkAUNG072650|TK1151|PROTEIN

LNHHGQPVLFGCGLLHYESDSAYIWLLQNWLHAMSENHPVSITTEPNHHIQMAVSQVLPQTRHRFCKWSILRETQQKLSHIYQTHHPSFDNDFANCIHESVSLDKFESSWQSLLNKYSLINNEWLQSIYNVRHQWVPVYLQDTFFGELYPKIPEQTLNLFFDGHMDPTTSTQSLFKQYETATSYWNEMELKADFETTNTMPLLKTPSPMEKQAANLYTRRAFLKFQEELVETLQTLQPNSKTTVVSQHFVWQNLGKNNRK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG072650
TK1151 IDTkAUNG072650
OH-1004 IDLXL04_019547
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 87.266 / OH-1004 42.259
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG072650
位置ChrUn:20976148-20977855 (+)
描述Similar to FRS9: Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g38170 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。
Arabidopsis FHY3/FAR1 gene family and distinct roles of its members in light control of Arabidopsis development.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.052191
At4g38180 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。 暂无已核实直接文献
At2g27110 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。 暂无已核实直接文献
At1g80010 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。
Arabidopsis FHY3/FAR1 gene family and distinct roles of its members in light control of Arabidopsis development.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.052191
At4g19990 假定的转录激活剂参与调节发育的光控制。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019547 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009639 response to red or far red light 生物过程
GO:0010017 red or far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0010018 far-red light signaling pathway 生物过程
GO:0010218 response to far red light 生物过程
GO:0042753 positive regulation of circadian rhythm 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:1900056 negative regulation of leaf senescence 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G27110
ath:AT3G06250
ath:AT4G15090
ath:AT4G38170
ath:AT4G38180
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.737
排名 1 · TkAUNG072650 · TK1151
细胞质0.317
排名 2 · TkAUNG072650 · TK1151
线粒体0.044
排名 3 · TkAUNG072650 · TK1151
细胞膜0.037
排名 4 · TkAUNG072650 · TK1151
内质网0.023
排名 5 · TkAUNG072650 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10551MULE2-71 aa
PF31079DUF880429-71 aa
PF10384Scm3102-120 aa
PF10551MULE112-123 aa
PF10384Scm3172-179 aa
PF09164VitD-bind_III216-247 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG072650PF10551MULE2712.1e-1351.2
TkAUNG072650PF31079DUF880429710.1613.1
TkAUNG072650PF10384Scm31021200.03914.4
TkAUNG072650PF10551MULE1121232.1e-1351.2
TkAUNG072650PF10384Scm31721790.03914.4
TkAUNG072650PF09164VitD-bind_III2162470.1412.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZL7拟南芥sp|Q9SZL7|FRS9_ARATH Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 956.000%Swiss-Prot高置信
Q9SZL8拟南芥sp|Q9SZL8|FRS5_ARATH Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 551.100%Swiss-Prot高置信
Q9ZVC9拟南芥sp|Q9ZVC9|FRS3_ARATH Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 350.000%Swiss-Prot高置信
Q9S793拟南芥sp|Q9S793|FRS8_ARATH Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 830.000%Swiss-Prot中等置信
Q5UBY2拟南芥sp|Q5UBY2|FRS1_ARATH Protein FAR1-RELATED SEQUENCE 131.800%Swiss-Prot中等置信

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