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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG070520
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 20443611-20447361 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2095 bp · TkAUNG070520|TK1151|cDNA

ATTCTATGATACCAGGTTGTTAATTAGAACTTAGAAATGACATTTACTATAGTGTAAAAGCCAAATAATAGAACATCTTCGAAATAACTTCCAATGGCGGCACCCACCAGTGCTGAAGAGACACGCAGTTACCAAGAACAATTATTTGGAGTGTCCTTCAACTGTATCAGAGGACTACGAGTGTCCTTTCCATCTCTCCAAGCGCCAATGTTTTTTATTACTATTTTTTAGTTTAATGTTTCTTTATACCAGGCTCTTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

1524 bp · TkAUNG070520|TK1151|CDS

ATGTTTCTTTATACCAGGCTCTTCTTCTCCATTATGCCATCAGCTGCGACCGTTAGACGATCAATGACGAGCATATCGAGTTCAGTGTCGATCAAGCACGGGATTTCACTTTGGTGTCCTCAATCTCCATCTCTCAGTCGTCAGCATTCTGGTGTGGTTTATTCAAGAAGCTTCCACCGGAGAAACTTCGTCGTTTCTGCGTCATCCTCTTTTGCTAATGAGAATCGAGAATTTGTGATAGTCGGAGGTGGAAATGCTGC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

507 aa · TkAUNG070520|TK1151|PROTEIN

MFLYTRLFFSIMPSAATVRRSMTSISSSVSIKHGISLWCPQSPSLSRQHSGVVYSRSFHRRNFVVSASSSFANENREFVIVGGGNAAGYAARTFVEHGMADGKLCIVSKEAYAPYERPALTKGYLFPLDKKPARLPGFHTCVGSGGERQTPDWYKEKGIEMIYEDPVTAIDAKKQTLTTNSGKTLKYGSLIVATGCTASRFPEKIGGNLHGVHYIRDVADADSLISSLGKAQKVVVVGGGYIGMEVAAATVAWNLDTTVI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG070520
TK1151 IDTkAUNG070520
OH-1004 IDLXL04_029591
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG070520
位置ChrUn:20443611-20447361 (-)
描述Similar to MDAR5: Monodehydroascorbate reductase, chloroplastic/mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g63940 催化单脱氢抗坏血酸 转化为抗坏血酸，并在此过程中氧化 NADH。
Monodehydroascorbate reductase mediates TNT toxicity in plants.2015 · DOI: 10.1126/science.aab3472

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os08g0151800 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
Os09g0567300 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029591 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009570 chloroplast stroma 细胞组分
GO:0010319 stromule 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016651 oxidoreductase activity, acting on NAD(P)H 分子功能
GO:0016656 monodehydroascorbate reductase (NADH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63940
dosa:Os08g0151800
dosa:Os08g0557600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.607
排名 1 · TkAUNG070520 · TK1151
线粒体0.446
排名 2 · TkAUNG070520 · TK1151
细胞质0.097
排名 3 · TkAUNG070520 · TK1151
细胞核0.041
排名 4 · TkAUNG070520 · TK1151
过氧化物酶体0.030
排名 5 · TkAUNG070520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04820Trp_halogenase22-59 aa
PF13434Lys_Orn_oxgnase42-124 aa
PF13738Pyr_redox_370-99 aa
PF13241NAD_binding_774-113 aa
PF03486HI0933_like77-98 aa
PF01262AlaDh_PNT_C77-96 aa
PF07992Pyr_redox_278-391 aa
PF00070Pyr_redox78-98 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG070520PF04820Trp_halogenase22590.0214.5
TkAUNG070520PF13434Lys_Orn_oxgnase421240.000819.3
TkAUNG070520PF13738Pyr_redox_370995.8e-1142.9
TkAUNG070520PF13241NAD_binding_7741137.4e-0524.0
TkAUNG070520PF03486HI0933_like77980.01715.4
TkAUNG070520PF01262AlaDh_PNT_C77962.58.2
TkAUNG070520PF07992Pyr_redox_2783914.1e-55188.0
TkAUNG070520PF00070Pyr_redox78981e-1971.5
TkAUNG070520PF04820Trp_halogenase78980.0214.5
TkAUNG070520PF00890FAD_binding_2791120.004417.0
TkAUNG070520PF13454NAD_binding_9791070.00617.3
TkAUNG070520PF01134GIDA79915.66.6
TkAUNG070520PF00070Pyr_redox1541761e-1971.5
TkAUNG070520PF03486HI0933_like1541980.01715.4
TkAUNG070520PF01266DAO1552089.2e-0832.7
TkAUNG070520PF13738Pyr_redox_31573665.8e-1142.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P92947拟南芥sp|P92947|MDAR_ARATH Monodehydroascorbate reductase, chloroplastic/mitochondrial76.200%Swiss-Prot高置信
Q84PW3水稻sp|Q84PW3|MDAR5_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 5, chlorplastic76.100%Swiss-Prot高置信
Q652L6水稻sp|Q652L6|MDAR3_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 3, cytosolic46.700%Swiss-Prot中等置信

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