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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG062400
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 18059868-18061550 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1617 bp · TkAUNG062400|TK1151|cDNA

ATGGACGTTGAATTCAAAGATATTAATGGAAACCATTTGGGTGTGAATCTTAATTCGATGGTTTCAACCGACGTCGCCGATTTGGATTCGGCCAACATTGATCTGAGAAGCGGCGACCAAATTAACTCGTGGGTGGAGTACAACGGCTCAACTCAGCAACTCTACGTCTCGATTTCATATTCCAACATAAAACCAACCTCCCCAGTTCTATCAATCCCCTTGGATCTTAACAAATACGTGAACGAGTTCATGTTCATCGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1617 bp · TkAUNG062400|TK1151|CDS

ATGGACGTTGAATTCAAAGATATTAATGGAAACCATTTGGGTGTGAATCTTAATTCGATGGTTTCAACCGACGTCGCCGATTTGGATTCGGCCAACATTGATCTGAGAAGCGGCGACCAAATTAACTCGTGGGTGGAGTACAACGGCTCAACTCAGCAACTCTACGTCTCGATTTCATATTCCAACATAAAACCAACCTCCCCAGTTCTATCAATCCCCTTGGATCTTAACAAATACGTGAACGAGTTCATGTTCATCGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

538 aa · TkAUNG062400|TK1151|PROTEIN

MDVEFKDINGNHLGVNLNSMVSTDVADLDSANIDLRSGDQINSWVEYNGSTQQLYVSISYSNIKPTSPVLSIPLDLNKYVNEFMFIGFTGSTQGSTEVHSVEWWTFNSSFDDIPQNPPPPNTTFTNPSADSEKKSKCNNQLCKQGAGAVVGVVTASAFVLAACALFLIWLYSKKFKSAKKPQLFASEVIKTPKEFSYKELKLATKGFDPTRVIGHGAFGTVYRGVLSESGETIAVKRCSHTGGQGMAEFLSELSIIGTLR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG062400
TK1151 IDTkAUNG062400
OH-1004 IDLXL04_032685
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)95.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 79.659
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG062400
位置ChrUn:18059868-18061550 (-)
描述Similar to LECRK81: L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g53380 含 L 型凝集素结构域的受体激酶 VIII.1。 暂无已核实直接文献
At5g03140 参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At5g55830 参与对病原卵菌马铃薯晚疫病菌和辣椒晚疫病菌的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At3g55550 参与对病原性卵菌 Phytophthora infestans 和 Phytophthora capsici 以及病原性细菌 Pseudomonas syringae 的抗性反应。 暂无已核实直接文献
At2g37710 含L型凝集素结构域的受体激酶 IV.1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032685 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G37710
ath:AT3G53380
ath:AT5G03140
ath:AT5G42120
ath:AT5G55830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.845
排名 1 · TkAUNG062400 · TK1151
细胞质0.096
排名 2 · TkAUNG062400 · TK1151
内质网0.077
排名 3 · TkAUNG062400 · TK1151
细胞核0.061
排名 4 · TkAUNG062400 · TK1151
高尔基体0.027
排名 5 · TkAUNG062400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00139Lectin_legB3-113 aa
PF18483Lectin_L-type_dom34-102 aa
PF15756DUF4690114-176 aa
PF00069Pkinase210-479 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr211-481 aa
PF03109ABC1212-237 aa
PF07387Seadorna_VP7306-349 aa
PF17667Pkinase_fungal308-381 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG062400PF00139Lectin_legB31131.4e-29104.1
TkAUNG062400PF18483Lectin_L-type_dom341020.1113.1
TkAUNG062400PF15756DUF46901141760.2113.0
TkAUNG062400PF00069Pkinase2104793.5e-49168.3
TkAUNG062400PF07714PK_Tyr_Ser-Thr2114816.6e-46157.4
TkAUNG062400PF03109ABC12122370.0004120.3
TkAUNG062400PF07387Seadorna_VP73063490.07312.8
TkAUNG062400PF17667Pkinase_fungal3083810.000419.9
TkAUNG062400PF14531Kinase-like3154110.03913.9
TkAUNG062400PF03109ABC13163590.0004120.3
TkAUNG062400PF01636APH3163420.2611.7
TkAUNG062400PF15756DUF46903994130.2113.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFH9拟南芥sp|Q9LFH9|LRK81_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.164.400%Swiss-Prot高置信
Q9LYX1拟南芥sp|Q9LYX1|LRK82_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase VIII.264.200%Swiss-Prot高置信
Q9FHG4拟南芥sp|Q9FHG4|LRKS7_ARATH Probable L-type lectin-domain containing receptor kinase S.750.400%Swiss-Prot高置信
Q9M2S4拟南芥sp|Q9M2S4|LRKS4_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase S.440.500%Swiss-Prot中等置信
O80939拟南芥sp|O80939|LRK41_ARATH L-type lectin-domain containing receptor kinase IV.138.700%Swiss-Prot中等置信

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