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基因概览

TkAUNG058030

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 16952744-16954010 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

429 bp · TkAUNG058030|TK1151|cDNA

ATGCACTTCTCCGAGCAGTGTGAAATTGGTGGAACAAGAATTATGACAGAGGGAGGAGAAAGGGTTGATTGGCATTATGCCTGTTCGAGATATTGCAGAGGGTTCCATAGTAACACAAGGGGTGTGGCTGCACGTGCATTACATCTATCAAGAGGAGTTGAGAAACCAAGTGGTAGAGTGACATATATAGTTCTTGAACAGAAACAAAAAACTGGAGGGAGGACTAAAGTTCTTCTGGAAACTGTCGTTGTGCATAAACT...

CDS

下载 CDS FASTA

429 bp · TkAUNG058030|TK1151|CDS

ATGCACTTCTCCGAGCAGTGTGAAATTGGTGGAACAAGAATTATGACAGAGGGAGGAGAAAGGGTTGATTGGCATTATGCCTGTTCGAGATATTGCAGAGGGTTCCATAGTAACACAAGGGGTGTGGCTGCACGTGCATTACATCTATCAAGAGGAGTTGAGAAACCAAGTGGTAGAGTGACATATATAGTTCTTGAACAGAAACAAAAAACTGGAGGGAGGACTAAAGTTCTTCTGGAAACTGTCGTTGTGCATAAACT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

142 aa · TkAUNG058030|TK1151|PROTEIN

MHFSEQCEIGGTRIMTEGGERVDWHYACSRYCRGFHSNTRGVAARALHLSRGVEKPSGRVTYIVLEQKQKTGGRTKVLLETVVVHKLADIFVASFEISFEEQLAMLDSVDVKVRLSKATELVDRHLQSIRVAENIFYVSRYI

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG058030`
TK1151 ID	TkAUNG058030
OH-1004 ID	LXL04_035407
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	98.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG058030

位置 ChrUn:16952744-16954010 (+)

描述 Similar to Lon protease homolog 2, peroxisomal

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g47040`	ATP依赖性丝氨酸蛋白酶，通过选择性降解过度折叠和未组装的多肽，作用于过氧化物酶体基质（通过相似性）。	Arabidopsis LON2 is necessary for peroxisomal function and sustained matrix protein import.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.142505

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8BDV1`	ATP 依赖性丝氨酸蛋白酶，介导过氧化物酶体基质中错误折叠和未组装多肽的选择性降解。	暂无已核实直接文献
`Os09g0533400`	ATP 依赖性丝氨酸蛋白酶，介导过氧化物酶体基质中错误折叠和未组装多肽的选择性降解。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035407 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006515 protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins 生物过程

GO:0006625 protein targeting to peroxisome 生物过程

GO:0016485 protein processing 生物过程

GO:0016558 protein import into peroxisome matrix 生物过程

GO:0016560 protein import into peroxisome matrix, docking 生物过程

GO:0048527 lateral root development 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005777 peroxisome 细胞组分

GO:0005782 peroxisomal matrix 细胞组分

GO:0070013 intracellular organelle lumen 细胞组分

GO:0004176 ATP-dependent peptidase activity 分子功能

GO:0004252 serine-type endopeptidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G47040

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.417

排名 1 · TkAUNG058030 · TK1151

细胞核0.380

排名 2 · TkAUNG058030 · TK1151

线粒体0.187

排名 3 · TkAUNG058030 · TK1151

细胞膜0.068

排名 4 · TkAUNG058030 · TK1151

内质网0.045

排名 5 · TkAUNG058030 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00944Peptidase_S322-77 aa

PF02190LON_substr_bdg84-124 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG058030	`PF00944`	Peptidase_S3	22	77	0.2	12.2
TkAUNG058030	`PF02190`	LON_substr_bdg	84	124	2.2e-05	25.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O64948`	拟南芥	sp\|O64948\|LONP2_ARATH Lon protease homolog 2, peroxisomal	57.000%	Swiss-Prot	中等置信
`B8BDV1`	水稻	sp\|B8BDV1\|LONP2_ORYSI Lon protease homolog 2, peroxisomal	51.700%	Swiss-Prot	高置信
`Q0J032`	水稻	sp\|Q0J032\|LONP2_ORYSJ Lon protease homolog 2, peroxisomal	51.100%	Swiss-Prot	高置信

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