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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG055940
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 15919428-15926850 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

975 bp · TkAUNG055940|TK1151|cDNA

ATGCAGAAATATTTGCAGTCTTTTTCAAACCTGACTCTTAGAGTGGAGGAGATGAAAGAAAAACGGCGAGAAGCGGAGGATCTCATGTCGCATATTTCCCTCCCTGAAGATTTGAGGGACCGAGTTAGGAGAGACAAACATTACAAATGGAAGATAACGAGAGGTGTTGAATTAGATTCCTTTCTCAAAGACCTTCCTCGGGATTTGAGAAGGGACATAAAGCGTCATCTTTGCTTGTCTTCACTAGTGAGAGTACCTAT...

CDS

下载 CDS FASTA

975 bp · TkAUNG055940|TK1151|CDS

ATGCAGAAATATTTGCAGTCTTTTTCAAACCTGACTCTTAGAGTGGAGGAGATGAAAGAAAAACGGCGAGAAGCGGAGGATCTCATGTCGCATATTTCCCTCCCTGAAGATTTGAGGGACCGAGTTAGGAGAGACAAACATTACAAATGGAAGATAACGAGAGGTGTTGAATTAGATTCCTTTCTCAAAGACCTTCCTCGGGATTTGAGAAGGGACATAAAGCGTCATCTTTGCTTGTCTTCACTAGTGAGAGTACCTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

324 aa · TkAUNG055940|TK1151|PROTEIN

MQKYLQSFSNLTLRVEEMKEKRREAEDLMSHISLPEDLRDRVRRDKHYKWKITRGVELDSFLKDLPRDLRRDIKRHLCLSSLVRVPMFESMDEHIMDAMCDCLKPILYTENSYIVREGDPVPEMLFITRGGLQSYTADGGRVAFFNFSYLRAGDFCGEELLTWALAPITSTLPFSTRTVQAVTNVEAFALVVDDLMFVASQFKRLHSRRLQHTFRFYSQQWRTWAACYIQSAWRRHCKKKQELKNTLDELDYRMQTALST...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG055940
TK1151 IDTkAUNG055940
OH-1004 IDLXL04_010779
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)92.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 42.798
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG055940
位置ChrUn:15919428-15926850 (+)
描述Similar to CNGC1: Cyclic nucleotide-gated ion channel 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g01010 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At5g53130 充当环核苷酸门控离子通道。
Expression of a truncated tobacco NtCBP4 channel in transgenic plants and disruption of the homologous Arabidopsis CNGC1 gene confer Pb2+ tolerance.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00901.x
Electrophysiological analysis of cloned cyclic nucleotide-gated ion channels.2002 · DOI: 10.1104/pp.010832
At4g30560 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At2g23980 可能的环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At1g01340 可能的环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010779 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0035618 root hair 细胞组分
GO:0071944 cell periphery 细胞组分
GO:0005216 monoatomic ion channel activity 分子功能
GO:0005223 intracellularly cGMP-activated cation channel activity 分子功能
GO:0005242 inward rectifier potassium channel activity 分子功能
GO:0005249 voltage-gated potassium channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G01340
ath:AT2G23980
ath:AT2G46430
ath:AT4G01010
ath:AT5G53130
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.773
排名 1 · TkAUNG055940 · TK1151
细胞质0.160
排名 2 · TkAUNG055940 · TK1151
细胞核0.109
排名 3 · TkAUNG055940 · TK1151
内质网0.059
排名 4 · TkAUNG055940 · TK1151
高尔基体0.025
排名 5 · TkAUNG055940 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF20135DUF652517-50 aa
PF18215Rtt106_N33-43 aa
PF14377UBM33-39 aa
PF18215Rtt106_N60-74 aa
PF14377UBM60-73 aa
PF20135DUF652564-75 aa
PF00027cNMP_binding108-195 aa
PF24609IQ_SCN5A_C211-219 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG055940PF20135DUF652517501.69.2
TkAUNG055940PF18215Rtt106_N33430.02315.3
TkAUNG055940PF14377UBM33390.510.6
TkAUNG055940PF18215Rtt106_N60740.02315.3
TkAUNG055940PF14377UBM60730.510.6
TkAUNG055940PF20135DUF652564751.69.2
TkAUNG055940PF00027cNMP_binding1081952.1e-0628.3
TkAUNG055940PF24609IQ_SCN5A_C2112190.3211.2
TkAUNG055940PF20135DUF65252202581.69.2
TkAUNG055940PF24609IQ_SCN5A_C2262440.3211.2
TkAUNG055940PF20135DUF65253043101.69.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LD40拟南芥sp|Q9LD40|CNG13_ARATH Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 1358.500%Swiss-Prot高置信
O65717拟南芥sp|O65717|CNGC1_ARATH Cyclic nucleotide-gated ion channel 157.200%Swiss-Prot高置信
Q9M0A4拟南芥sp|Q9M0A4|CNGC9_ARATH Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 956.600%Swiss-Prot高置信
O82226拟南芥sp|O82226|CNGC6_ARATH Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 655.700%Swiss-Prot高置信
Q9LNJ0拟南芥sp|Q9LNJ0|CNG10_ARATH Probable cyclic nucleotide-gated ion channel 1054.000%Swiss-Prot高置信

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