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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG055600
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 15824356-15829438 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3595 bp · TkAUNG055600|TK1151|cDNA

GAGAGGCATTTGTGCAACTCTCTGTGTCGTTTATATTCACGCTGACAGAAGCACAACGTTTGATTGTTTATGCAACTGCAAGAACAAAATCCTAATTCTTCATCTCCCTACATACCTCGCTGCTGCTGCGTTTTTTCTTCTCAATTTGAATCGCAGATTTAATTCGTTCGATTTGCCATCAGTTCTTGACTCTTTTCGTCGTTTTAACCCCTCGATTCTATGAATTAGGGTTTCTTTTCTTTGGGTTAGCATGTTCGGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2865 bp · TkAUNG055600|TK1151|CDS

ATGATTGAACCGATGGTACGATCAAAAATGCCGAATGTTAAACGCTGCAAATTGGAGGAAATTGACGCCGATACGACTGACAATTCGCATTCACATTACCCTTCTGTGGGTTTCACCAAGAAACAAAGAACAAACACCGCGTTCGTGGCAACTGCCGATAAGGAAGCCTGTTTTATCGACTACGAAAACGTCGTTAACGCTTGGTGCACTGGAGTTCCGTGTACCCCTGCCGATTTGAAGTCAAGTTCGAGTTCAATTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

954 aa · TkAUNG055600|TK1151|PROTEIN

MIEPMVRSKMPNVKRCKLEEIDADTTDNSHSHYPSVGFTKKQRTNTAFVATADKEACFIDYENVVNAWCTGVPCTPADLKSSSSSIKLLKSSRGRLSVCPSRFNDTVIGLWKKENDIDTNIRKRKFPFSDRESVTKKQSMEPKVGQMFSSSSSSATSFGNHISNDSKKARKTTKNVKRKESYTHEDFLTGEIVWAKCSNRFPAWPAIVIDAQQEAPTSVKKARIPNTVCVMFYGYSKRGTRDYAWVKDGMIYPFLEFLER...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG055600
TK1151 IDTkAUNG055600
OH-1004 IDLXL04_010786
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG055600
位置ChrUn:15824356-15829438 (-)
描述Similar to ATX3: Histone-lysine N-methyltransferase ATX3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61740 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At5g53430 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At4g27910 组蛋白甲基转移酶。 暂无已核实直接文献
At1g05830 组蛋白甲基转移酶。
The highly similar Arabidopsis homologs of trithorax ATX1 and ATX2 encode proteins with divergent biochemical functions.2008 · DOI: 10.1105/tpc.107.056614
Combinatorial functions of diverse histone methylations in Arabidopsis thaliana flowering time regulation.2014 · DOI: 10.1111/nph.12493

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0134500 体外具有组蛋白H3甲基转移酶活性。
Trithorax group protein Oryza sativa Trithorax1 controls flowering time in rice via interaction with early heading date3.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.228049
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_010786 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程
GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05830
ath:AT3G61740
ath:AT4G27910
ath:AT5G53430
dosa:Os09g0134500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.899
排名 1 · TkAUNG055600 · TK1151
细胞质0.152
排名 2 · TkAUNG055600 · TK1151
细胞膜0.032
排名 3 · TkAUNG055600 · TK1151
线粒体0.020
排名 4 · TkAUNG055600 · TK1151
内质网0.014
排名 5 · TkAUNG055600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00855PWWP190-282 aa
PF13832zf-HC5HC2H_2344-374 aa
PF13771zf-HC5HC2H346-373 aa
PF13831PHD_2363-370 aa
PF00628PHD363-385 aa
PF01342SAND424-483 aa
PF13771zf-HC5HC2H505-555 aa
PF13832zf-HC5HC2H_2519-555 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG055600PF00855PWWP1902824.8e-1763.0
TkAUNG055600PF13832zf-HC5HC2H_23443741e-28100.4
TkAUNG055600PF13771zf-HC5HC2H3463733.8e-1350.2
TkAUNG055600PF13831PHD_23633702.1e-1350.2
TkAUNG055600PF00628PHD3633850.0001622.3
TkAUNG055600PF01342SAND4244830.003217.8
TkAUNG055600PF13771zf-HC5HC2H5055553.8e-1350.2
TkAUNG055600PF13832zf-HC5HC2H_25195551e-28100.4
TkAUNG055600PF00628PHD5265710.0001622.3
TkAUNG055600PF13831PHD_25385722.1e-1350.2
TkAUNG055600PF13771zf-HC5HC2H5755893.8e-1350.2
TkAUNG055600PF13832zf-HC5HC2H_25796911e-28100.4
TkAUNG055600PF13771zf-HC5HC2H6016923.8e-1350.2
TkAUNG055600PF13831PHD_26376472.1e-1350.2
TkAUNG055600PF00628PHD6376630.0001622.3
TkAUNG055600PF13831PHD_26486622.1e-1350.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9M364拟南芥sp|Q9M364|ATX3_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX348.100%Swiss-Prot中等置信
Q8GZ42拟南芥sp|Q8GZ42|ATX5_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX546.700%Swiss-Prot中等置信
Q9SUE7拟南芥sp|Q9SUE7|ATX4_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX448.000%Swiss-Prot中等置信
P0CB22拟南芥sp|P0CB22|ATX2_ARATH Histone-lysine N-methyltransferase ATX232.700%Swiss-Prot低置信
Q6K431水稻sp|Q6K431|TRX1_ORYSJ Histone-lysine N-methyltransferase TRX134.000%Swiss-Prot低置信

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