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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG044740
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 12433762-12435105 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

843 bp · TkAUNG044740|TK1151|cDNA

ATGGTTGCTGCCGACTTTGTCGTCGGGATCTTAGGAAACATCGTCTCTATACTCAGTTTCACTTCTCCCATATCACAATTTCGGGAGATTGTGAAGGGAAAAAATGCTGATAACTACAACGGAACACCATATATTGCAACGTTTTTGAGTTGTTCTTTGTGGATTTTGTACGGAGTACTTGACCCAGATGATGGTCTCCTCATTGTGACTGTCAACTCAGCTGGTGTGGGCATGCAAACCCTCTACCTTGCTCTACTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

843 bp · TkAUNG044740|TK1151|CDS

ATGGTTGCTGCCGACTTTGTCGTCGGGATCTTAGGAAACATCGTCTCTATACTCAGTTTCACTTCTCCCATATCACAATTTCGGGAGATTGTGAAGGGAAAAAATGCTGATAACTACAACGGAACACCATATATTGCAACGTTTTTGAGTTGTTCTTTGTGGATTTTGTACGGAGTACTTGACCCAGATGATGGTCTCCTCATTGTGACTGTCAACTCAGCTGGTGTGGGCATGCAAACCCTCTACCTTGCTCTACTTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

280 aa · TkAUNG044740|TK1151|PROTEIN

MVAADFVVGILGNIVSILSFTSPISQFREIVKGKNADNYNGTPYIATFLSCSLWILYGVLDPDDGLLIVTVNSAGVGMQTLYLALLFIYSSPEKRVKYFGFVVLDVVCFGLVVAFTLVAFHGESRRTFTGVICATFTTMMYAAPLAALRTTIKTKSVEYMPILLVFSLFVNGCVWLTFALLVTDVFVLVPNAIGILLGAIQFCVYLMFRNSRPIVNEKQTEIQEFGTEDIDVKSNNMITQKRSLSRLDAFPVIRSPSLLS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG044740
TK1151 IDTkAUNG044740
OH-1004 IDLXL04_001279
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG044740
位置ChrUn:12433762-12435105 (+)
描述Similar to SWEET16: Bidirectional sugar transporter SWEET16
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g28007 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
At3g16690 调节糖在液泡膜上的低亲和摄取和外排。
Overexpression of the vacuolar sugar carrier AtSWEET16 modifies germination, growth, and stress tolerance in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1104/pp.113.224972
SWEET17, a facilitative transporter, mediates fructose transport across the tonoplast of Arabidopsis roots and leaves.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.232751
At4g15920 作为液泡己糖转运蛋白。
Leaf fructose content is controlled by the vacuolar transporter SWEET17 in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1016/j.cub.2013.03.021
SWEET17, a facilitative transporter, mediates fructose transport across the tonoplast of Arabidopsis roots and leaves.2014 · DOI: 10.1104/pp.113.232751

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0341300 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YZ24 介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001279 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0008643 carbohydrate transport 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009646 response to absence of light 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0009750 response to fructose 生物过程
GO:0010930 negative regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0015755 fructose transmembrane transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16690
ath:AT4G15920
dosa:Os03g0341300
dosa:Os05g0588500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.618
排名 1 · TkAUNG044740 · TK1151
内质网0.150
排名 2 · TkAUNG044740 · TK1151
溶酶体／液泡0.134
排名 3 · TkAUNG044740 · TK1151
细胞质0.101
排名 4 · TkAUNG044740 · TK1151
高尔基体0.070
排名 5 · TkAUNG044740 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03083MtN3_slv7-93 aa
PF04193PQ-loop9-63 aa
PF03650MPC34-77 aa
PF09882EhaC86-116 aa
PF03083MtN3_slv129-211 aa
PF03650MPC139-214 aa
PF09882EhaC145-180 aa
PF04193PQ-loop150-182 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG044740PF03083MtN3_slv7935.6e-44148.8
TkAUNG044740PF04193PQ-loop9630.810.2
TkAUNG044740PF03650MPC34770.1413.0
TkAUNG044740PF09882EhaC861161.110.0
TkAUNG044740PF03083MtN3_slv1292115.6e-44148.8
TkAUNG044740PF03650MPC1392140.1413.0
TkAUNG044740PF09882EhaC1451801.110.0
TkAUNG044740PF04193PQ-loop1501820.810.2
TkAUNG044740PF04193PQ-loop1962070.810.2
TkAUNG044740PF03083MtN3_slv2372535.6e-44148.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q944M5拟南芥sp|Q944M5|SWET4_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET438.800%Swiss-Prot中等置信
Q9LUR4拟南芥sp|Q9LUR4|SWT16_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1638.800%Swiss-Prot中等置信
Q84WN3拟南芥sp|Q84WN3|SWT17_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET1738.900%Swiss-Prot中等置信
Q10LN5水稻sp|Q10LN5|SWT16_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET1646.900%Swiss-Prot中等置信
A2YZ24水稻sp|A2YZ24|SWT7B_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET7b35.500%Swiss-Prot中等置信

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