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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG044020
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 12220301-12223886 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3051 bp · TkAUNG044020|TK1151|cDNA

CAACGACAATAAAGATTCTTCTTTCCATTTATAAATGATAAGAAAAAAGTAGACGGTCGTTGCGTTGGTACCAATTATTGATGAGGGTTGACTTTTCCATTCCAACATTCTTCTCTCTGTTTTGATCAATGACTTCTCAATCATCATCTTCCATGGTTAAATCTTATTTCAGGGCTACTTCACAGCCTTCTTCGATTCGTTATGATGTTTTTTTAAGTTTTCGCGGTGAAGACACTCGTGACAATTTTACAGATCATCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2253 bp · TkAUNG044020|TK1151|CDS

ATGACTTCTCAATCATCATCTTCCATGGTTAAATCTTATTTCAGGGCTACTTCACAGCCTTCTTCGATTCGTTATGATGTTTTTTTAAGTTTTCGCGGTGAAGACACTCGTGACAATTTTACAGATCATCTCTATACAGCCTTGAATCAAGCAGGAATCCGCACTTTCCGGGATGATGATGCAATGGATAGAGGGAAACCGCTGACGCCAGAGCTAAAAAAAGCCATCCGCGAGTCTGCAATTTCACTAATCGTCTTCTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

750 aa · TkAUNG044020|TK1151|PROTEIN

MTSQSSSSMVKSYFRATSQPSSIRYDVFLSFRGEDTRDNFTDHLYTALNQAGIRTFRDDDAMDRGKPLTPELKKAIRESAISLIVFSKGYASSTWCLDEVRTIMEKQKTSAVYGNFRYDVLPVFYKVKPSDVRNQRGSFKQAFDKYDDEIKAEKNLKKKTALLLKVSAWRQTLGHAATSTGFVYRDGSESRFIYKIVNAVIKKVDNNALYTEDKLVGMENHVAEIESWLQDPSPYASVLLINGMGGIGKTTIAKIIFNLN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG044020
TK1151 IDTkAUNG044020
OH-1004 IDLXL04_001270
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)95.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG044020
位置ChrUn:12220301-12223886 (-)
描述Similar to RUN1: Disease resistance protein RUN1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g19510 疾病抗性蛋白，与RPP2A合作对Hyaloperonospora parasitica Cala2株产生抗性。 暂无已核实直接文献
At5g45060 特异识别P.syringae AvrRps4 III型效应物不亲和蛋白的抗病（R）蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g44510 TIR-NB-LRR受体样蛋白，有助于铜绿假单胞菌三型分泌效应子AvrB诱导的抗病性。
Arabidopsis TAO1 is a TIR-NB-LRR protein that contributes to disease resistance induced by the Pseudomonas syringae effector AvrB.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0802157105
At5g18370 参与植物防御的 TIR-NB-LRR 受体样蛋白。
Matching NLR Immune Receptors to Autoimmunity in camta3 Mutants Using Antimorphic NLR Alleles.2017 · DOI: 10.1016/j.chom.2017.03.005
At4g12020 转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001270 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0019677 NAD+ catabolic process 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0050832 defense response to fungus 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0003953 NAD+ nucleosidase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0042803 protein homodimerization activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G19510
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.405
排名 1 · TkAUNG044020 · TK1151
细胞膜0.394
排名 2 · TkAUNG044020 · TK1151
细胞核0.222
排名 3 · TkAUNG044020 · TK1151
内质网0.077
排名 4 · TkAUNG044020 · TK1151
细胞外0.048
排名 5 · TkAUNG044020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13191AAA_167-84 aa
PF01582TIR25-210 aa
PF13676TIR_227-130 aa
PF28108T7SS_assoc-like46-62 aa
PF13173AAA_1482-103 aa
PF23952LRR_EndoS131-152 aa
PF06309Torsin183-198 aa
PF13191AAA_16214-297 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG044020PF13191AAA_167840.001519.8
TkAUNG044020PF01582TIR252101.6e-42146.1
TkAUNG044020PF13676TIR_2271309.5e-1555.9
TkAUNG044020PF28108T7SS_assoc-like46620.00418.6
TkAUNG044020PF13173AAA_14821030.02715.2
TkAUNG044020PF23952LRR_EndoS1311520.002918.5
TkAUNG044020PF06309Torsin1831980.2312.3
TkAUNG044020PF13191AAA_162142970.001519.8
TkAUNG044020PF00158Sigma54_activat2182650.1812.2
TkAUNG044020PF00931NB-ARC2193937.5e-2175.2
TkAUNG044020PF01637ATPase_22213329e-0523.1
TkAUNG044020PF03215Rad172213280.1612.6
TkAUNG044020PF06309Torsin2222700.2312.3
TkAUNG044020PF24883NPHP3_N2242970.0002322.1
TkAUNG044020PF20720nSTAND32372790.01615.6
TkAUNG044020PF13173AAA_142373360.02715.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JT80拟南芥sp|F4JT80|RPP2B_ARATH Disease resistance protein RPP2B32.900%Swiss-Prot中等置信
Q9FHF0拟南芥sp|Q9FHF0|RPS4B_ARATH Disease resistance protein RPS4B28.300%Swiss-Prot低置信
Q9FI14拟南芥sp|Q9FI14|TAO1_ARATH Disease resistance protein TAO126.700%Swiss-Prot低置信
F4JWM0拟南芥sp|F4JWM0|DSC2_ARATH Disease resistance-like protein DSC227.600%Swiss-Prot低置信
Q9SZ67拟南芥sp|Q9SZ67|WRK19_ARATH Probable WRKY transcription factor 1927.800%Swiss-Prot低置信

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