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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG041430
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 11530972-11533432 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1328 bp · TkAUNG041430|TK1151|cDNA

GTCGATACCCGGCAAAAACAAAAGAAAGAATAATAAAGGAAAAAAAAACCCGTCTAATTGTACGTTATCTAAAGGTTTTTGTAGGGTTTTCGTGCACATTTACCAGATATAAACACACAGTTATCCAACACAGAAAGAGAAAAAATGGGTTCTCTGAATAATGAAACAGAGCATATCAATGGAGAAGAAGAGCCAATTTTAATGGAGCAAAACCAGAGATTTTGTATGTTTCCAGTGAAATACCATCAACTGTGGGAGAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1017 bp · TkAUNG041430|TK1151|CDS

ATGGGTTCTCTGAATAATGAAACAGAGCATATCAATGGAGAAGAAGAGCCAATTTTAATGGAGCAAAACCAGAGATTTTGTATGTTTCCAGTGAAATACCATCAACTGTGGGAGATGTACAAGAAAGCACAAGCTAGTTTTTGGACTGCTGAAGAGGTTGATCTCTCGTTAGACATACAGCAGTGGCAAAAGTTGACTGAATCAGAACAGCAGTTCATAAGCCATATCTTAGCCTTTTTTGCTGCTTCAGATGGAATTGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

338 aa · TkAUNG041430|TK1151|PROTEIN

MGSLNNETEHINGEEEPILMEQNQRFCMFPVKYHQLWEMYKKAQASFWTAEEVDLSLDIQQWQKLTESEQQFISHILAFFAASDGIVLENLAARFLNDIQIPEARAFYGFQIAMENVHSEMYSLLLETLIKDSKEKYRLFNAIENIPCIARKADWALNWISSSNSFAERLVAFACVEGIFFSGSFCSIFGLKKRGLMPGLTFSNELISRDEGLHCDFACLLYSLLRKQLPRQKVDEIVQEAVEIETEFVCESLPCALIGM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG041430
TK1151 IDTkAUNG041430
OH-1004 IDLXL04_003144
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG041430
位置ChrUn:11530972-11533432 (-)
描述Similar to RNR2A: Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g23580 提供 DNA 合成所需的前体。
Arabidopsis ribonucleotide reductases are critical for cell cycle progression, DNA damage repair, and plant development.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037044
UniProt: P0DKH3 提供 DNA 合成所需的前体。 暂无已核实直接文献
At3g27060 提供 DNA 合成所需的前体。
Arabidopsis ribonucleotide reductases are critical for cell cycle progression, DNA damage repair, and plant development.2006 · DOI: 10.1105/tpc.105.037044

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003144 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006260 DNA replication 生物过程
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0009259 ribonucleotide metabolic process 生物过程
GO:0009263 deoxyribonucleotide biosynthetic process 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
GO:0051726 regulation of cell cycle 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005971 ribonucleoside-diphosphate reductase complex 细胞组分
GO:0004748 ribonucleoside-diphosphate reductase activity, thioredoxin disulfide as acceptor 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G23580
ath:AT3G27060
dre:30733
nta:107781035
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.609
排名 1 · TkAUNG041430 · TK1151
细胞核0.595
排名 2 · TkAUNG041430 · TK1151
线粒体0.064
排名 3 · TkAUNG041430 · TK1151
细胞膜0.037
排名 4 · TkAUNG041430 · TK1151
内质网0.031
排名 5 · TkAUNG041430 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00268Ribonuc_red_sm25-291 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG041430PF00268Ribonuc_red_sm252911.1e-115386.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
P50651拟南芥sp|P50651|RIR2A_ARATH Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain A81.200%Swiss-Prot高置信
P0DKH3拟南芥sp|P0DKH3|RI2BL_ARATH Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain B71.000%Swiss-Prot高置信
Q9LSD0拟南芥sp|Q9LSD0|RIR2C_ARATH Ribonucleoside-diphosphate reductase small chain C70.900%Swiss-Prot高置信

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