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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG039440
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 11003507-11010761 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

801 bp · TkAUNG039440|TK1151|cDNA

CGACCCGTAAATGGCTCGAAGCGAGAGGTGAAGATTCCAAATCACCCACTTCACCTTCTCTCCTTAAAACCCCTCTATTTCTCTTCTCCAAAATCAAAAAGCTCATTTAGCGTAAATTTTACTCCTTCCATGGCGAACAGCAATCTACCTCGAAGAATTATCAAGGAGACACAGCGGTTGCTCAGCGAACCAGCTCCTGGGATCAGTGCATCGCCATCAGAAGAGAACATGCGGTATTTTAATGTCATGATCCTTGGTCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1476 bp · TkAUNG039440|TK1151|CDS

ATGGCTTTCTCTTACATGAAGATGATGAACAGTGGGTGCATCCATGGTTCGAACCCATCGCGCTTGTTTCTGGGGACATCAACGCCGTTTAGTTCACTTAAGTCGAACCCGAACCCGAATTCGAGCCCGAGTAACAAAAACCGGGTCCAAATCCCCCTCGCCAGTCATCGCGCCTCTTCATATGTTGCTTCTTTAGCTGCTTTTGCTGTGCTCACCCGAAGTGTCGCTAATGATGTTCTAACCGTCGGTAAAGAACTTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

491 aa · TkAUNG039440|TK1151|PROTEIN

MAFSYMKMMNSGCIHGSNPSRLFLGTSTPFSSLKSNPNPNSSPSNKNRVQIPLASHRASSYVASLAAFAVLTRSVANDVLTVGKELRTLADEFIPREYQDYYIHEMKKILRNKDAEFTIVIDEYQAQSNTADEMFKAVETYLGTKVNESCIRKVNVCKNKEMLSVRMNKDEEIIDEYDGVQVKWRSTTKTGFGEVQSWLKSYELTFHNRHRYKILESYFPYILERCDEIKANESGLKLHMIDDGYHESKTIVIDNPMTFK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG039440
TK1151 IDTkAUNG039440
OH-1004 IDLXL04_016610
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 75.538
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG039440
位置ChrUn:11003507-11010761 (-)
描述Similar to At3g50940: AAA-ATPase At3g50940
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g50940 AAA-ATP酶 At3g50940。 暂无已核实直接文献
At3g50930 蛋白 HYPER-SENSITIVITY-RELATED 4。 暂无已核实直接文献
At1g16890 催化通过“Lys-63”连接的非规范多聚泛素链的合成。
Arabidopsis thaliana UBC13: implication of error-free DNA damage tolerance and Lys63-linked polyubiquitylation in plants.2006 · DOI: 10.1007/s11103-006-0007-x
A lysine-63-linked ubiquitin chain-forming conjugase, UBC13, promotes the developmental responses to iron deficiency in Arabidopsis roots.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04150.x
At1g78870 催化通过“Lys-63”连接的非规范多聚泛素链的合成。
Arabidopsis thaliana UBC13: implication of error-free DNA damage tolerance and Lys63-linked polyubiquitylation in plants.2006 · DOI: 10.1007/s11103-006-0007-x
A lysine-63-linked ubiquitin chain-forming conjugase, UBC13, promotes the developmental responses to iron deficiency in Arabidopsis roots.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04150.x
At5g17760 AAA-ATP酶 At5g17760。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_016610 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0006301 DNA damage tolerance 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009411 response to UV 生物过程
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009863 salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010039 response to iron ion 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G16890
ath:AT1G78870
ath:AT3G50930
ath:AT3G50940
ath:AT5G17760
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.236
排名 1 · TkAUNG039440 · TK1151
线粒体0.235
排名 2 · TkAUNG039440 · TK1151
质体0.204
排名 3 · TkAUNG039440 · TK1151
细胞核0.143
排名 4 · TkAUNG039440 · TK1151
内质网0.108
排名 5 · TkAUNG039440 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13191AAA_1670-128 aa
PF01637ATPase_289-149 aa
PF20720nSTAND392-113 aa
PF14363AAA_assoc94-187 aa
PF13401AAA_2297-136 aa
PF13207AAA_1797-169 aa
PF00308Bac_DnaA98-142 aa
PF07693KAP_NTPase103-140 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG039440PF13191AAA_16701285.4e-0524.5
TkAUNG039440PF01637ATPase_2891492.7e-0524.8
TkAUNG039440PF20720nSTAND3921130.0003920.8
TkAUNG039440PF14363AAA_assoc941872.2e-1867.1
TkAUNG039440PF13401AAA_22971360.001319.7
TkAUNG039440PF13207AAA_17971690.1213.4
TkAUNG039440PF00308Bac_DnaA981420.000720.5
TkAUNG039440PF07693KAP_NTPase1031400.01815.0
TkAUNG039440PF16316DUF49561031660.04614.2
TkAUNG039440PF02463SMC_N1041380.07813.1
TkAUNG039440PF05673DUF8151051400.01315.4
TkAUNG039440PF05496RuvB_N1061400.003917.7
TkAUNG039440PF13173AAA_141061340.01116.4
TkAUNG039440PF00910RNA_helicase1071300.001319.9
TkAUNG039440PF25199nSTAND_NTPase51101370.09513.2
TkAUNG039440PF26704DUF272_C1111690.06914.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q147F9拟南芥sp|Q147F9|AATPC_ARATH AAA-ATPase At3g5094041.500%Swiss-Prot中等置信
Q8VZG2拟南芥sp|Q8VZG2|HSR4_ARATH Protein HYPER-SENSITIVITY-RELATED 439.300%Swiss-Prot中等置信
Q9FZ48拟南芥sp|Q9FZ48|UBC36_ARATH Ubiquitin-conjugating enzyme E2 3697.400%Swiss-Prot高置信
Q94A97拟南芥sp|Q94A97|UBC35_ARATH Ubiquitin-conjugating enzyme E2 3596.100%Swiss-Prot高置信
Q9FN75拟南芥sp|Q9FN75|AATPI_ARATH AAA-ATPase At5g1776038.900%Swiss-Prot中等置信

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