本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG032390
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 8647555-8648207 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

405 bp · TkAUNG032390|TK1151|cDNA

TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAACTCTCTCTCACACTCTCTCTCTCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCCCGCTTTAGATACAAAATTTCAAACACGTCCACAACTCATTACCAGTTAAAGTGGGT...

405 bp · TkAUNG032390|TK1151|CDS

TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATAAAACTCTCTCTCACACTCTCTCTCTCTTTATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATCCCCGCTTTAGATACAAAATTTCAAACACGTCCACAACTCATTACCAGTTAAAGTGGGT...

134 aa · TkAUNG032390|TK1151|PROTEIN

YIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIKLSLTLSLSLYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYIYPRFRYKISNTSTTHYQLKWVSPAPLGSGPHGWRGIPVPFASLFVELGGSGIWAYIELNIFGALVNLG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG032390
TK1151 IDTkAUNG032390
OH-1004 IDLXL04_010848
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)64.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 23.134 / OH-1004 4.306
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG032390
位置ChrUn:8647555-8648207 (+)
描述Similar to KMT2B: Histone-lysine N-methyltransferase 2B
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_010848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0008284 positive regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0010468 regulation of gene expression 生物过程
GO:0031507 heterochromatin formation 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0032922 circadian regulation of gene expression 生物过程
GO:0033148 positive regulation of intracellular estrogen receptor signaling pathway 生物过程
GO:0035864 response to potassium ion 生物过程
GO:0043627 response to estrogen 生物过程
GO:0045815 transcription initiation-coupled chromatin remodeling 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
KEGG 基因交叉引用
hsa:4297
hsa:9757
mmu:75410
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞质0.280
排名 1 · TkAUNG032390 · TK1151
细胞核0.221
排名 2 · TkAUNG032390 · TK1151
内质网0.211
排名 3 · TkAUNG032390 · TK1151
溶酶体/液泡0.150
排名 4 · TkAUNG032390 · TK1151
细胞外0.121
排名 5 · TkAUNG032390 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

JBrowse

在基因组浏览器中查看