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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkAUNG030520
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 8214696-8215162 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

384 bp · TkAUNG030520|TK1151|cDNA

ATGATCAAGAACAGCAAAGGGTCTGTTTGGAAGAGGCAAAATTCAAGAATGGATGACAACAAAAGCCAAGAAACATGTCTTCTGAAGACTGAGACGACGAAGAAGAAGAAGACGATGATGGATAGAGGGAACAAAGGGGAAAAATACCGGCTTTTATCCTTCAACGAACTGCCGGATTATATGAAGGATAATGAGTTCATATTGAATTATTACAGAGTGAATTGGCCTGTTAAAGAGGCATTCTTCAGCTTGTTTAGGTG...

384 bp · TkAUNG030520|TK1151|CDS

ATGATCAAGAACAGCAAAGGGTCTGTTTGGAAGAGGCAAAATTCAAGAATGGATGACAACAAAAGCCAAGAAACATGTCTTCTGAAGACTGAGACGACGAAGAAGAAGAAGACGATGATGGATAGAGGGAACAAAGGGGAAAAATACCGGCTTTTATCCTTCAACGAACTGCCGGATTATATGAAGGATAATGAGTTCATATTGAATTATTACAGAGTGAATTGGCCTGTTAAAGAGGCATTCTTCAGCTTGTTTAGGTG...

127 aa · TkAUNG030520|TK1151|PROTEIN

MIKNSKGSVWKRQNSRMDDNKSQETCLLKTETTKKKKTMMDRGNKGEKYRLLSFNELPDYMKDNEFILNYYRVNWPVKEAFFSLFRWHNETLNVWTHLLGFLLFVGLTVGNVMDVPQVADFITMITE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG030520
TK1151 IDTkAUNG030520
OH-1004 IDLXL04_024407
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)55.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 58.268 / OH-1004 19.221
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG030520
位置ChrUn:8214696-8215162 (+)
描述Similar to ADIPOR3: Heptahelical transmembrane protein ADIPOR3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g20270 可能作为脱落酸 介导的渗透应激信号传导的负调节剂,并在冷和渗透信号传导之间的串扰中发挥作用。
At4g38320 可能在非生物胁迫响应中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g37680 可能在非生物胁迫响应中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At4g30850 可能在非生物胁迫响应中发挥作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0643700 可能在非生物胁迫响应中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_024407 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009725 response to hormone 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0038023 signaling receptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G24150
ath:AT4G30850
ath:AT4G37680
ath:AT4G38320
dosa:Os03g0232900
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.362
排名 1 · TkAUNG030520 · TK1151
内质网0.238
排名 2 · TkAUNG030520 · TK1151
高尔基体0.158
排名 3 · TkAUNG030520 · TK1151
溶酶体/液泡0.110
排名 4 · TkAUNG030520 · TK1151
细胞质0.085
排名 5 · TkAUNG030520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16962ABC_export14-115 aa
PF03006HlyIII85-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG030520PF16962ABC_export141150.08112.4
TkAUNG030520PF03006HlyIII851097.9e-0729.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93ZH9拟南芥sp|Q93ZH9|HHP1_ARATH Heptahelical transmembrane protein 165.100%Swiss-Prot低置信
Q9SVF3拟南芥sp|Q9SVF3|HPP5_ARATH Heptahelical transmembrane protein 553.400%Swiss-Prot中等置信
Q9SZG0拟南芥sp|Q9SZG0|HHP4_ARATH Heptahelical transmembrane protein 453.400%Swiss-Prot中等置信
Q84N34拟南芥sp|Q84N34|HHP2_ARATH Heptahelical transmembrane protein 250.500%Swiss-Prot中等置信
B7F9G7水稻sp|B7F9G7|ADPO1_ORYSJ Heptahelical transmembrane protein ADIPOR163.300%Swiss-Prot中等置信

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