TkAUNG027580 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkAUNG027580

当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 7363990-7366042 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1507 bp · TkAUNG027580|TK1151|cDNA

TTCATGCATCTATGATATCATTCTAACATATGTACTCCATCTCTTATGTCAGGGCCTATTGGTTATGTGGTTATTTAATCCATACGACGTGACATGGCTTATTACCATGGCGATAGTTCTCTTAGCTCTTGGAAAATCAGGAGACACCATTTTAGAATACGTACTTACTGATTTGGTTGATGGAATTGACACATCAGTAAATCGCAATATAAAACGTTCTCTTGCACGTAGAGAAATCTGGTGGCGTATATCGTACGTGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1371 bp · TkAUNG027580|TK1151|CDS

ATGTGGTTATTTAATCCATACGACGTGACATGGCTTATTACCATGGCGATAGTTCTCTTAGCTCTTGGAAAATCAGGAGACACCATTTTAGAATACGTACTTACTGATTTGGTTGATGGAATTGACACATCAGTAAATCGCAATATAAAACGTTCTCTTGCACGTAGAGAAATCTGGTGGCGTATATCGTACGTGTTTGGTGCAATTGCTGCAATATTATGGGTTGCCCCATTCGCGTTTGGCCTTGATGATGATCATGA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

456 aa · TkAUNG027580|TK1151|PROTEIN

MWLFNPYDVTWLITMAIVLLALGKSGDTILEYVLTDLVDGIDTSVNRNIKRSLARREIWWRISYVFGAIAAILWVAPFAFGLDDDHDPTWKTTFFICIISMTAALIIFCIGHNVYHQRELTQRPVEIFFRVLRAKLQKLLNSNSRQERPPKSTMQENEGITQDRSPVNEYTTGKRSIGNTTYKDDIKVVRSLLRMFPMWGTLIVVSLTSAIGSTFYIEQFNNLRGSDNIPAQMFDMIQDFSGFVILILYGCTRFSRNEKL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkAUNG027580`
TK1151 ID	TkAUNG027580
OH-1004 ID	LXL04_019127
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	25.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 50.000 / OH-1004 43.860 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkAUNG027580

位置 ChrUn:7363990-7366042 (+)

描述 Similar to NPF8.1: Protein NRT1/ PTR FAMILY 8.1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g54450`	蛋白 NRT1/PTR 家族 5.4。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_019127 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006857 oligopeptide transport 生物过程

GO:0009860 pollen tube growth 生物过程

GO:0015031 protein transport 生物过程

GO:0015833 peptide transport 生物过程

GO:0042938 dipeptide transport 生物过程

GO:0042939 tripeptide transport 生物过程

GO:0055085 transmembrane transport 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005773 vacuole 细胞组分

GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G62200

ath:AT2G02020

ath:AT2G02040

ath:AT3G54140

ath:AT5G01180

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.656

排名 1 · TkAUNG027580 · TK1151

溶酶体／液泡0.130

排名 2 · TkAUNG027580 · TK1151

内质网0.127

排名 3 · TkAUNG027580 · TK1151

细胞质0.090

排名 4 · TkAUNG027580 · TK1151

高尔基体0.046

排名 5 · TkAUNG027580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03739LptF_LptG36-113 aa

PF11026DUF272144-109 aa

PF00689Cation_ATPase_C47-109 aa

PF07690MFS_150-282 aa

PF00854PTR266-357 aa

PF10642Tom566-80 aa

PF15013CCSMST174-110 aa

PF24803DUF770488-121 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkAUNG027580	`PF03739`	LptF_LptG	36	113	0.0094	15.8
TkAUNG027580	`PF11026`	DUF2721	44	109	0.12	13.0
TkAUNG027580	`PF00689`	Cation_ATPase_C	47	109	0.11	12.9
TkAUNG027580	`PF07690`	MFS_1	50	282	0.00024	20.9
TkAUNG027580	`PF00854`	PTR2	66	357	9.3e-23	81.5
TkAUNG027580	`PF10642`	Tom5	66	80	0.45	11.3
TkAUNG027580	`PF15013`	CCSMST1	74	110	5.1	8.0
TkAUNG027580	`PF24803`	DUF7704	88	121	0.041	14.5
TkAUNG027580	`PF11026`	DUF2721	262	276	0.12	13.0
TkAUNG027580	`PF24803`	DUF7704	302	397	0.041	14.5
TkAUNG027580	`PF00689`	Cation_ATPase_C	310	310	0.11	12.9
TkAUNG027580	`PF15013`	CCSMST1	379	398	5.1	8.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9M1I2`	拟南芥	sp\|Q9M1I2\|PTR46_ARATH Protein NRT1/ PTR FAMILY 5.4	21.200%	Swiss-Prot	低置信

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