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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG025980
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 6926655-6928845 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

516 bp · TkAUNG025980|TK1151|cDNA

ATGCCAAAGGTTGACTTGACTGCGTATGTAGAGAAGCATGAGTTCTGTTTTGATGCTGTCCTAGATGAGCAAGTGACAAATGATGAGGTGTACCGTAAGACTGTGGAGCCAATTATACCCATCATTTTTCAACGGACCAAAGCAACATGCTTTGCATATGGCCAGACAGGAAGTGGTAAAACATACACCATGCAGCCATTACCTCTCAGAGCAGCAGAAGACCTTGTCAGATTGCTGCATCAGCCAATTTACCGTAATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

516 bp · TkAUNG025980|TK1151|CDS

ATGCCAAAGGTTGACTTGACTGCGTATGTAGAGAAGCATGAGTTCTGTTTTGATGCTGTCCTAGATGAGCAAGTGACAAATGATGAGGTGTACCGTAAGACTGTGGAGCCAATTATACCCATCATTTTTCAACGGACCAAAGCAACATGCTTTGCATATGGCCAGACAGGAAGTGGTAAAACATACACCATGCAGCCATTACCTCTCAGAGCAGCAGAAGACCTTGTCAGATTGCTGCATCAGCCAATTTACCGTAATCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

171 aa · TkAUNG025980|TK1151|PROTEIN

MPKVDLTAYVEKHEFCFDAVLDEQVTNDEVYRKTVEPIIPIIFQRTKATCFAYGQTGSGKTYTMQPLPLRAAEDLVRLLHQPIYRNQRFKLWLSYFEIYGGKLFDLLSDRKKLCMREDGRQQVCIVGLQEFEVSDVAIVKEYIERGNAARSTGSTGANEESSRSLPFCNWL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG025980
TK1151 IDTkAUNG025980
OH-1004 IDLXL04_029177
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.737 / OH-1004 20.808
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG025980
位置ChrUn:6926655-6928845 (-)
描述Similar to KIN13A: Kinesin-like protein KIN-13A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g16630 参与毛状体形态发生的内部运动驱动蛋白。
An internal motor kinesin is associated with the Golgi apparatus and plays a role in trichome morphogenesis in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1091/mbc.e04-05-0400
AtKinesin-13A is located on Golgi-associated vesicle and involved in vesicle formation/budding in Arabidopsis root-cap peripheral cells.2009 · DOI: 10.1186/1471-2229-9-138
Rho of plant GTPase signaling regulates the behavior of Arabidopsis kinesin-13A to establish secondary cell wall patterns.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.117853
Atkinesin-13A modulates cell-wall synthesis and cell expansion in Arabidopsis thaliana via the THESEUS1 pathway.2014 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1004627
At3g16060 与 KIN13A 一起作用，通过 THE1 途径调节细胞壁合成和细胞扩增。
Atkinesin-13A modulates cell-wall synthesis and cell expansion in Arabidopsis thaliana via the THESEUS1 pathway.2014 · DOI: 10.1371/journal.pgen.1004627

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0154700 类驱动蛋白 KIN-13A。 暂无已核实直接文献
Os01g0625200 类驱动蛋白 KIN-13B。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029177 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007019 microtubule depolymerization 生物过程
GO:0007080 mitotic metaphase chromosome alignment 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010090 trichome morphogenesis 生物过程
GO:0030951 establishment or maintenance of microtubule cytoskeleton polarity 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051310 metaphase chromosome alignment 生物过程
GO:0051315 attachment of mitotic spindle microtubules to kinetochore 生物过程
GO:0051983 regulation of chromosome segregation 生物过程
GO:0090058 metaxylem development 生物过程
GO:0098696 regulation of neurotransmitter receptor localization to postsynaptic specialization membrane 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G16060
ath:AT3G16630
dosa:Os05g0154700
mmu:73804
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.732
排名 1 · TkAUNG025980 · TK1151
细胞核0.280
排名 2 · TkAUNG025980 · TK1151
细胞膜0.108
排名 3 · TkAUNG025980 · TK1151
线粒体0.069
排名 4 · TkAUNG025980 · TK1151
高尔基体0.060
排名 5 · TkAUNG025980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00225Kinesin7-164 aa
PF16796Microtub_bd10-107 aa
PF00910RNA_helicase51-95 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG025980PF00225Kinesin71647.1e-43147.6
TkAUNG025980PF16796Microtub_bd101076.3e-1349.6
TkAUNG025980PF00910RNA_helicase51950.2312.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q940B8拟南芥sp|Q940B8|KN13A_ARATH Kinesin-like protein KIN-13A88.300%Swiss-Prot高置信
Q940Y8拟南芥sp|Q940Y8|KN13B_ARATH Kinesin-like protein KIN-13B77.200%Swiss-Prot高置信
B9FMJ3水稻sp|B9FMJ3|KN13A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-13A92.600%Swiss-Prot高置信
B9EY52水稻sp|B9EY52|KN13B_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-13B75.900%Swiss-Prot高置信

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