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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkAUNG025190
当前版本: TK1151 染色体: ChrUn 坐标: 6744000-6748412 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2342 bp · TkAUNG025190|TK1151|cDNA

AAACATGATTAATTACGACTTTAACCCAATATATAAAATTGTGGAAGTTTATCTGTTTTCTCAGCCAATCAATAAATTTGATGGCCGTGGAAATGGTTTGTTGAATGTCGAACTTCACCCGTCAAACGGTTTCCTCAATGCTCCTTCCCCCAATCCACAACGATGTTGTTGAAACCGGCCTTCAATCTCTCGCCCTCCTTGCTGAAAACCTTCTTCAACAACAAAACCCCATCCTTCTTACTCAATTGCTCCTCATACCG...

CDS

下载 CDS FASTA

1470 bp · TkAUNG025190|TK1151|CDS

ATGAGCGGCAAGGCAGAGAAAAGAGCCCGTCGTGAATCCCCATCTGGTATTCTTCTCTCCCACCTCTGCCGTTGCTCTAAAGAAAACAACACCGAAGAAGCTCTTCGTCTATACGACGAAGCAGTACGCAACAATGTCCCCCTCAACGTCGAACATTACAACAAGTTACTGTACTTGTGCTCCTCTTCCGACACCAATTTTGCTTTAAAAAGGGGTTTCGAGATATACAAGCGAATGGAAACCGGTAATAACGTCACCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

489 aa · TkAUNG025190|TK1151|PROTEIN

MSGKAEKRARRESPSGILLSHLCRCSKENNTEEALRLYDEAVRNNVPLNVEHYNKLLYLCSSSDTNFALKRGFEIYKRMETGNNVTKVVPNEATFTTMARLAAAKEDPEMAFDLVKRMKEGCGISPRLRSYVPALSGFCKKGMADKAYEVDSYMIENGIAAEEGELAMLLQVSFDTKREDKVYEMLQRLRATVRQVSEDTASLVEDWFKSDCAISVGKVKWDVGKVEEAVVKGGGGWHGQGWLGNGKWKVVRTEMNEKGV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkAUNG025190
TK1151 IDTkAUNG025190
OH-1004 IDLXL04_038692
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 84.602
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkAUNG025190
位置ChrUn:6744000-6748412 (-)
描述Similar to PRORP1: Proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g32230 核酸内切酶 RNase P 负责 tRNA 前体的 5' 成熟。
A single Arabidopsis organellar protein has RNase P activity.2010 · DOI: 10.1038/nsmb.1812
Mitochondrial ribonuclease P structure provides insight into the evolution of catalytic strategies for precursor-tRNA 5' processing.2012 · DOI: 10.1073/pnas.1209062109
At2g16650 核酸内切酶 RNase P 负责 tRNA 前体的 5' 成熟。
Nuclear Protein-Only Ribonuclease P2 Structure and Biochemical Characterization Provide Insight into the Conserved Properties of tRNA 5' End Processing Enzymes.2016 · DOI: 10.1016/j.jmb.2015.11.025
At4g21900 核酸内切酶 RNase P 负责 tRNA 前体的 5' 成熟。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038692 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0001682 tRNA 5'-leader removal 生物过程
GO:0006397 mRNA processing 生物过程
GO:0008033 tRNA processing 生物过程
GO:0043144 sno(s)RNA processing 生物过程
GO:0090646 mitochondrial tRNA processing 生物过程
GO:0097745 mitochondrial tRNA 5'-end processing 生物过程
GO:0140040 mitochondrial polycistronic RNA processing 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005759 mitochondrial matrix 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0030678 mitochondrial ribonuclease P complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G16650
ath:AT2G32230
ath:AT4G21900
dme:Dmel_CG15896
hsa:9692
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.331
排名 1 · TkAUNG025190 · TK1151
质体0.324
排名 2 · TkAUNG025190 · TK1151
细胞核0.179
排名 3 · TkAUNG025190 · TK1151
细胞质0.148
排名 4 · TkAUNG025190 · TK1151
过氧化物酶体0.038
排名 5 · TkAUNG025190 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF17177PPR_long7-213 aa
PF13041PPR_224-57 aa
PF01535PPR25-46 aa
PF12854PPR_127-40 aa
PF13428TPR_1428-57 aa
PF13812PPR_336-63 aa
PF23276TPR_2444-57 aa
PF01535PPR71-80 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkAUNG025190PF17177PPR_long72131.3e-65221.4
TkAUNG025190PF13041PPR_224571.5e-1041.7
TkAUNG025190PF01535PPR25466e-1039.4
TkAUNG025190PF12854PPR_127400.00119.5
TkAUNG025190PF13428TPR_1428570.1513.5
TkAUNG025190PF13812PPR_336633.5e-0524.5
TkAUNG025190PF23276TPR_2444570.002718.3
TkAUNG025190PF01535PPR71806e-1039.4
TkAUNG025190PF13041PPR_287981.5e-1041.7
TkAUNG025190PF12854PPR_188980.00119.5
TkAUNG025190PF13041PPR_2901261.5e-1041.7
TkAUNG025190PF13812PPR_3901313.5e-0524.5
TkAUNG025190PF01535PPR941206e-1039.4
TkAUNG025190PF13428TPR_14971180.1513.5
TkAUNG025190PF23276TPR_241011990.002718.3
TkAUNG025190PF13812PPR_31231603.5e-0524.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q66GI4拟南芥sp|Q66GI4|PRRP1_ARATH Proteinaceous RNase P 1, chloroplastic/mitochondrial62.300%Swiss-Prot高置信
Q680B9拟南芥sp|Q680B9|PRRP2_ARATH Proteinaceous RNase P 246.300%Swiss-Prot中等置信
F4JKB6拟南芥sp|F4JKB6|PRRP3_ARATH Proteinaceous RNase P 346.200%Swiss-Prot中等置信

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